Journals / Harran Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi / 2023 / Cilt: 27 Sayı: 2

Assessment of genetic diversity in safflower cultivars and breeding lines with AFLP markers

Aspir çeşit ve ıslah hatlarında AFLP belirteçleri ile genetik çeşitliliğin belirlenmesi

Pages
145–152
Publication Date
2023-06-23
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

The study shows genetic variation within germplasm and could be useful for breeding and genetic diversity studies in the future.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Safflower is a self-pollinating oilseed crop and has been cultivated since antiquity in the Middle East.
📊
Key Findings & Data:Safflower has become a minor oilseed crop, and to increase its cultivation it is necessary to characterize and introduce new germplasm.
💡
Conclusion & Impact:The study shows genetic variation within germplasm and could be useful for breeding and genetic diversity studies in the future.
🔬Design:Research Article
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:Carthamus tinctorius · Aspir · Genetik çeşitlilik

Abstract

Safflower is a self-pollinating oilseed crop and has been cultivated since antiquity in the Middle East. Safflower has become a minor oilseed crop, and to increase its cultivation it is necessary to characterize and introduce new germplasm. Thirty-eight safflower cultivars and breeding lines from different countries have been screened with 8 AFLP primer combinations to assess genetic diversity and relationships among these genotypes. AFLP primers produced total of 410 bands, 113 of which was polymorphic, with an average of 51.2 bands per assay. Polymorphism ratio changed between 14.8 to 41.4% among the genotypes. Polymorphism information content (PIC) and resolving power (Rp) of the primer combinations were between 0.21-0.38 and 5.11-27.68, respectively. Genetic similarity coefficients were between 0.245-0.850 with an average of 0.573. Dendrogram based on similarity matrix produced three clusters and three cultivars clustered separately from the rest of the genotypes. The study shows genetic variation within germplasm and could be useful for breeding and genetic diversity studies in the future.

Özet

Aspir, kendine döllenen tek yıllık bir yağ bitkisidir ve antik çağlardan beri Orta Doğu'da yetiştirilmektedir. Aspir önemini yitiren bir kültür bitkisi haline gelmiştir ve aspir tarımını artırmak için yeni çeşitlerin temini ve karakterizasyonu gereklidir. Farklı coğrafi kökene sahip 38 aspir çeşidi ve ıslah hattı arasındaki genetik çeşitliliği ve ilişkilerini belirlemek için 8 AFLP primer kombinasyonu kullanılarak genotiperler taranmıştır. AFLP primerleri, reaksiyon başına ortalama 51.2 bant ve toplamda 410 bant üretmiştir. Üretilen bantların 113 tanesinin genotipler arasında polimorfik olduğu gözlenmiş ve polimorfizm oranı %14.8-%41.4 arasında değişmiştir. Primer kombinasyonlarının polimorfizm bilgi içeriği (PIC) 0.21-0.38 ve çözümleme gücü (Rp) 5.11-27.68 arasında değişmiştir. Aspir çeşit ve ıslah hatları arasındaki genetik benzerlik katsayıları 0.245-0.850 arasında değişkenlik gösterirken; ortalama genetik benzerlik 0.573 olarak bululnumuştur. Benzerlik matrisine dayalı dendogram, genotipleri üç küme içine yerleştirmiş fakat üç kültivar gruplandrılamamıştır. Mevcut çalışma, genotipler içerisindeki genetik çeşitliliğin boyutunu göstermekte ve gelecekte yapılacak ıslah ve genetik analizler için faydalı olacaktır.

🔖

Cite This Article

TONGUÇ, M., ERBAŞ, S. (2023). Assessment of genetic diversity in safflower cultivars and breeding lines with AFLP markers. Harran Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi, Cilt: 27 Sayı: 2, 145–152. https://ajindex.com/articles/949632

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (11)

  1. Ali, F., Nadeem, M. A., Habyarimana, E., Yılmaz, A., Nawaz, M. A., Khalil, I. H., Ercişli, S., Chung, G., & Baloch F. S. (2020). Molecular characterization of genetic diversity and similarity centers of safflower accessions with ISSR markers. Brazilian Journal of Botany, 43, 109-121. DOI: https://doi.org/10.1007/s40415-019-00574-7
  2. Amini, F., Saeidi, G., & Arzani, A. (2008). Study of genetic diversity in safflower genotypes using agro-morphological traits and RAPD markers. Euphytica, 163, 21-30. DOI: https://doi.org/10.1007/s10681-007-9556-6
  3. Archak, S., Galkwad, A. B., Gautam, D., Rao, V. B., Swamy, K. R. M., & Karihaloo, J. R. (2003). Comperative assessment of DNA finger printing techniques (RAPD, ISSR and AFLP) for genetic analysis of cashew (Anacardium occidentale L.) accessions of India. Genome, 46, 362-369. DOI: https://doi.org/10.1139/g03-016
  4. Chapman, M. A., & Burke, J. M. (2007). DNA sequence diversity and the origin of cultivated safflower (Carthamus tinctorius L.; Asteraceae). BMC Plant Biology, 7, 1-9. DOI: https://doi.org/10.1186/1471-2229-7-60
  5. Çankaya, A., Tonguç, M., & Önder, S. (2019). Peroxidase gene based genetic relationships among safflower genotypes. Süleyman Demirel University Faculty of Arts and Science Journal of Science, 14, 367-373. DOI: https://doi.org/10.29233/sdufeffd.612472
  6. Doyle, J., & Doyle, J. (1990). Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus, 12, 13-15. DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-642-83962-718
  7. Giachino, R. R. A., & İnan, D. (2019). Assessment of genetic diversity in safflower (Carthamus tinctorius L.) using RAPD markers. Yuzuncu Yıl University Journal of Agricultural Sciences, 29, 300-308. DOI: https://doi.org/10.29133/yyutbd.560936
  8. Johnson, R. C., Kisha, T. J., & Evans, M. A. (2007). Characterizing safflower germplasm with AFLP molecular markers. Crop Science, 47, 1728-1736. DOI: https://doi.org/10.2135/cropsci2006.12.0757
  9. Kim, E. O., Oh, J. H., Lee, S. K., Lee, J. Y., & Choi S. W. (2007). Antioxidant properties and quantification of phenolic compounds from safflower (Carthamus tinctorius L.) seeds. Food Science and Biotechnology, 16, 71-77.
  10. Köse, A. (2017). Eskişehir koşulları altında bazı aspir (Carthamus tinctorius L.) çeşitlerinin tarımsal performanslarının belirlenmesi. Selcuk Journal of Agriculture and Food Science, 31, 1-7. DOI: https://doi.org/10.15316/SJAFS.2018.55
  11. Landau, S., Friedman, S., Brenner, S., Brukental, I., Weinberg, Z. G., Ashbell, G., Hen, Y., Dvash, L., & Leshem, Y. (2004). The value of s