SavedAdd your journal

Journals / Dicle Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi / 2022 / Cilt: 15 - Sayı: 1

Dondurulmuş Deniz Ürünlerinde Vibrio spp.’nin İlmiğe Dayalı İzotermal Amplifikasyon (Loop Mediated Isothermal Amplification, LAMP) Yöntemiyle Belirlenmesi

A. Ezgi TELLİ
Nihat TELLİ
Yusuf DOĞRUER
Yusuf BİÇER
Pages
14–19
Publication Date
2022-10-12
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

Bu bağlamda, dondurulmuş deniz ürünlerinde V. parahaemolyticus ve V. vulnificus gibi patojenik suşların varlığı halk sağlığı açısından riskli olarak kabul edildi.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Bu çalışmada, deniz ürünleri kaynaklı enfeksiyonlarda en yaygın etkenlerden olan Vibrio spp.’nin yüksek risk grubunu oluşturan Vibrio parahaemolyticus, V. vulnificus ve V. cholerae’nın yüksek özgüllük, verimlilik ve hızlılık içeren yeni bir yöntem olan İlmiğe Dayalı İzotermal Amplifikasyon (Loop Mediated Isothermal Amplification, LAMP) yöntemiyle tespit edilmesi amaçlandı.
📊
Key Findings & Data:Araştırma materyali olarak, süpermarketler ve balık hallerinde satışa sunulan dondurulmuş deniz ürünleri (hamsi filetosu, bütün hamsi, dondurulmuş balık köfte, ahtapot, karides, kalamar, akivades midyesi, midye eti, kabuklu midye, uskumru filetosu, sardalya, surimi çubuk, vongole midyesi, çıtır kalamar halkaları, kaya levreği n = 212) toplandı.
💡
Conclusion & Impact:Bu bağlamda, dondurulmuş deniz ürünlerinde V. parahaemolyticus ve V. vulnificus gibi patojenik suşların varlığı halk sağlığı açısından riskli olarak kabul edildi.
🔬Design:Lab & Field Experiment
📍Scope:2007 Verileri
⚙️Variables:Dondurulmuş deniz ürünleri · LAMP · Vibrio spp.

Özet

Bu çalışmada, deniz ürünleri kaynaklı enfeksiyonlarda en yaygın etkenlerden olan Vibrio spp.’nin yüksek risk grubunu oluşturan Vibrio parahaemolyticus, V. vulnificus ve V. cholerae’nın yüksek özgüllük, verimlilik ve hızlılık içeren yeni bir yöntem olan İlmiğe Dayalı İzotermal Amplifikasyon (Loop Mediated Isothermal Amplification, LAMP) yöntemiyle tespit edilmesi amaçlandı. Araştırma materyali olarak, süpermarketler ve balık hallerinde satışa sunulan dondurulmuş deniz ürünleri (hamsi filetosu, bütün hamsi, dondurulmuş balık köfte, ahtapot, karides, kalamar, akivades midyesi, midye eti, kabuklu midye, uskumru filetosu, sardalya, surimi çubuk, vongole midyesi, çıtır kalamar halkaları, kaya levreği n = 212) toplandı. Klasik kültür yöntemiyle örneklerin izolasyonu için ISO / TS 21872-1: 2007 ve ISO 21872-2: 2007 prosedürleri kullanıldı. Şüpheli izolatlardan DNA ekstraksiyonu gerçekleştirildi. Daha sonra izolatlar Vibrio spp. için gyrB1 gen bölgesinin amplifikasyonu ile genus spesifik PCR reaksiyonu kullanılarak doğrulandı. Pozitif örneklerde turbidite bazlı Real-Time LAMP gerçekleştirildi. Bu amaçla, sırasıyla V. parahaemolyticus, V. vulnificus ve V. cholerae'nin saptanması için toxR, vvHA ve ompW hedef gen bölgeleri için tasarlanmış LAMP primer setleri kullanıldı. Sonuç olarak, klasik kültür metodu kullanılarak analiz edilmiş 212 (% 16,98) örnekten 36'sının Vibrio spp. ile kontamine olduğu tespit edildi. LAMP reaksiyonu sonuçlarına göre, Vibrio spp. pozitif izolatların içerisinde V. parahaemolyticus ve V. vulnificus'un oranı sırasıyla 13/36 (% 36.1) ve 2/36 (% 5.5) olarak tespit edildi. Analiz edilen örneklerin hiçbirinde V. cholerae tespit edilmedi. Bu bağlamda, dondurulmuş deniz ürünlerinde V. parahaemolyticus ve V. vulnificus gibi patojenik suşların varlığı halk sağlığı açısından riskli olarak kabul edildi.

🔖

Cite This Article

TELLİ, A. E., TELLİ, N., DOĞRUER, Y., BİÇER, Y. (2022). Dondurulmuş Deniz Ürünlerinde Vibrio spp.’nin İlmiğe Dayalı İzotermal Amplifikasyon (Loop Mediated Isothermal Amplification, LAMP) Yöntemiyle Belirlenmesi. Dicle Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, Cilt: 15 - Sayı: 1, 14–19. https://ajindex.com/articles/488133

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (15)

  1. Peterson KM. (2000). Molecular Pathogenesis of Vibrio Infections. In: Microbial Foodborne Diseases. Cary JW, Linz JE, Bhatnagar D (eds.) 1st. ed. pp. 157-190. Techomic Publishing, USA
  2. Helmi AM, Mukti AT, Soegianto A, Effendi MH. (2020). A review of vibriosis in fisheries: Public health importance. Sys Rev Pharm. 11 (8): 51-58
  3. Janda JM, Newton AE, Bopp CA. (2015). Vibriosis. Clin. Lab. Med, 35(2): 273-288
  4. Baker-Austin C, Oliver JD, Alam M ve ark. (2018). Vibrio spp. infections. Nat Rev Dis Primers 4(1): 1-19
  5. Heperkan D. (2016). Temel Gıda Mikrobiyolojisi, Editör: Heperkan D. Bölüm: Gıdaların Normal Mikrobiyolojik Kalitesi ve Önemi. Ankara, Türkiye: Osmanlı Mücellit Matbaacılık, s.41-50
  6. Al-Ashhab A, Alexander-Shani R et al. (2022). Fish skin microbiota under healthy and diseased conditions.
  7. Liu C, Zhao LP, Shen YQ (2021). A systematic review of advances in intestinal microflora of fish. Fish Physiol. Biochem, 47(6): 2041-2053
  8. Zarei M, Borujeni MP, Jamnejod A, Khezrzadeh M. (2012). Seasonal prevalence of Vibrio species in retail shrimps with an emphasis on Vibrio parahaemolyticus. Food Control. 25: 107-109
  9. Garg N, Ahmad FJ, Kar S. (2022). Recent advances in loop-mediated isothermal amplification (LAMP) for rapid and efficient detection of pathogens. CRMICR, 3, 100120.
  10. Mori Y, Notomi T. (2009). Loop-mediated isothermal amplification (LAMP): a rapid, accurate, and cost-effective diagnostic method for infectious diseases. J. Infect. Chemother. 15(2): 62-69
  11. Tomita N, Mori Y, Kodama H, Notomi T. (2008). Loop Mediated isothermal amplification (LAMP) of gene sequences and simple visual detection of products. Nat Protoc. 3: (877-882)
  12. Ren CH, Hu CQ, Luo P, Wang QB. (2009) Sensitive and rapid identification of Vibrio vulnificus by loop-mediated isothermal amplification. Microbiol Res. 164(5): 514-521
  13. Okada K, Chantaroj S, Taniguchi T, Suzuki Y, Roobthaisong A, Puiprom O, Honda T, Sawanpanyalert P. (2010). A rapid, simple and sensitive loop-mediated isothermal amplification method to detect toxigenic Vibrio cholerae in rectal swap samples. Diagn Microbiol Infect Dis. 66:135-139
  14. Jones JL, Hara-Kudo Y, Krantz JA, Benner Jr. RA, Smith AB, Dambaugh TR, Bowers JC, DePaola A. (2012) Comparison of molecular detection methods for Vibrio parahaemolyticus and Vibrio vulnificus. Food Microbiol. 30:105-111
  15. Telli AE, Doğruer Y. (201