Dergiler / Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi / 2022 / Cilt: 12 - Sayı: 4

4-(5-metil-[1, 2, 4] triazolo [1, 5-a] pirimidin-7-iloksi) ftalonitrilin Yapısal ve Spektral Özellikleri: TD-DFT Yöntemi ile Analizi, ADME analizi ve Moleküler Doking Simülasyonları

Structural and Spectral Properties of 4-(5-methyl-[1, 2, 4] triazolo [1, 5-a] pyrimidine-7-yloxy) phthalonitrile: Analysis by TD-DFT Method, ADME Analysis, and Molecular Docking Simulations

Sayfa
2340–2351
Yayın Tarihi
2022-12-01
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

MTPPN, bir ilaç adayı olarak in-siliko bir çalışmada iyi bir inhibitör performans göstermiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Bu çalışmada ftalonitril bileşiği ve kuantum kimyasalı olarak 4-(5-metil-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pirimidin-7-iloksi)ftalonitril (MTPPN olarak kodlanmıştır) seçilmiştir ve in-siliko çalışmalar yapılmıştır.
📊
Temel Bulgular & Veri:MTPPN bileşiğinin bazı enzimler üzerindeki etkisi incelenmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:MTPPN, bir ilaç adayı olarak in-siliko bir çalışmada iyi bir inhibitör performans göstermiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Ftalonitril · moleküler doking · ADME

Özet

Bu çalışmada ftalonitril bileşiği ve kuantum kimyasalı olarak 4-(5-metil-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pirimidin-7-iloksi)ftalonitril (MTPPN olarak kodlanmıştır) seçilmiştir ve in-siliko çalışmalar yapılmıştır. İlk başta zamana bağlı yoğunluk fonksiyonel teorisi (TD-DFT) yönteminin temel seti kullanılmış ve molekülün sınır yörünge enerjileri ve bant aralığı hesaplamaları yapılmıştır. Elektron yoğunluğu ve bağ kritik nokta hakkında bilgi edinmek için moleküllerdeki atomların analizi (AIM) teorik hesaplamaları sunulmaktadır. Ayrıca bileşiğin ilaç potansiyeli için absorpsiyon, dağılım, metabolizma ve atılım (ADME) analizleri yapıldı. MTPPN bileşiğinin bazı enzimler üzerindeki etkisi incelenmiştir. Yerleştirme puanı sırasıyla AChE, BChE, a-GLY proteinleri -7.864, -6.848 ve -5.511 kcal/mol için elde edilmiştir. MTPPN, bir ilaç adayı olarak in-siliko bir çalışmada iyi bir inhibitör performans göstermiştir.

Abstract

In this study, 4-(5-methyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidine-7-yloxy) phthalonitrile (coded as MTPPN) was chosen as the phthalonitrile compound and the quantum chemical and in-silico studies have been done. First, the basis set of the time dependent density functional theory (TD-DFT) method was used and the boundary orbital energies and band gap calculations of the molecule were performed. Analysis of atoms in molecules (AIM) theoretical calculations is presented to learn about electron density and bond critical point. In addition, absorption, distribution, metabolism, and excretion analyzes (ADME) were performed for the drug potential of the compound. On some enzymes effect of MTPPN compound was examined. The docking score was obtained for AChE, BChE, α-GLY proteins -7.864, -6.848, and -5.511 kcal/mol, respectively. MTPPN gave a good inhibitory performance in an in-silico study as a drug candidate.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ALTUN, K., YILDIKO, Ü., TANRIVERDİ, A. A., TEKEŞ, A. T., ATA, A. Ç., KARTAL, B., ÇAKMAK, İ. (2022). 4-(5-metil-[1, 2, 4] triazolo [1, 5-a] pirimidin-7-iloksi) ftalonitrilin Yapısal ve Spektral Özellikleri: TD-DFT Yöntemi ile Analizi, ADME analizi ve Moleküler Doking Simülasyonları. Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, Cilt: 12 - Sayı: 4, 2340–2351. https://ajindex.com/articles/859892

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (8)

  1. Abdelhady AM, Yin H, Rodriguez Lorenc K, Ji Y, 2019. Clinical Pharmacokinetics (ADME). Clinical Pharmacology in Drug Development 8 (S1): 1-101.
  2. Agirtas MS, Ondes MY, Ozdemir S and Okumus V, 2017. DNA cleavage properties and synthesis of metallophthalocyanines with 5-methyl-[1, 2, 4] triazolo [1, 5-a] pyrimidin-7-oxy substituents. Inorganic and Nano-Metal Chemistry, 47 (7): 1097-1102.
  3. Altun K, Yildiko U, Tanriverdi AA, Cakmak I, 2021. Structural and spectral properties of 4-(4-(1-(4-Hydroxyphenyl)-1-phenylethyl) phenoxy) phthalonitrile: Analysis by TD-DFT method, ADME analysis and docking studies. International Journal of Chemistry and Technology, 5 (2):147-155.
  4. Bernetti M, Cavalli A and Mollica L, 2017. In Medchemcomm pp. 534-550.
  5. Bulat FA, Chamorro E, Fuentealba P and Toro-Labbé A, 2004. Condensation of Frontier Molecular Orbital Fukui Functions. The Journal of Physical Chemistry A, 108 (2): 342-349. BIOVIA Discovery Studio D. SYSTÈMES BIOVIA Corporate Europe 2016, BIOVIA 334 Cambridge Science Park Cambridge CB4 0WN, England http://accelrys.com/products/collaborative-science/biovia-discovery-studio/
  6. De Lile JR, Kang SG, Son YA and Lee SG, 2020. Do HOMO–LUMO Energy Levels and Band Gaps Provide Sufficient Understanding of Dye-Sensitizer Activity Trends for Water Purification? ACS Omega, 5 (25): 15052-15062.
  7. Demircioglu Z, Kastas CA and Buyukgungor O, 2015. Theoretical analysis (NBO, NPA, Mulliken Population Method) and molecular orbital studies (hardness, chemical potential, electrophilicity and Fukui function analysis) of (E)-2-((4-hydroxy-2-methylphenylimino)methyl)-3-methoxyphenol. Journal of Molecular Structure, 1091 (5): 183-195.
  8. Daina A, Michielin O, Zoete V, 2017. SwissADME: a free web tool to evaluate pharmacokinetics, drug-likeness and medicinal chemistry friendliness of small molecules. Scientific Reports, 7: 42717. Dong Q, Hu N, Yue H, Wang H, 2021. Inhibitory Activity and Mechanism Investigation of Hypericin as a Novel α-Glucosidase Inhibitor. Molecules, 26 (15):4566. Frisch MJ, Trucks GW, Schlegel HB, Scuseria GE, Robb MA, Cheeseman JR, Scalmani G, Barone V, Petersson GA, Nakatsuji H, Li X, Caricato M, Marenich AV, Bloino J, Janesko BG, Gomperts R, Mennucci B, Hratchian HP, Ortiz JV, Izmaylov AF, Sonnenberg JL, Williams, Ding F, Lipparini F, Egidi F, Goings J, Peng B, Petrone A, Henderson T, Ranasinghe D, Zakrzewski VG, Gao J, Rega N, Zheng G, Liang W, Hada M, Ehara M, Toyota K, Fukuda R, Hasegawa J, Ishida M, Nakajima T, Honda Y, Kitao O, Nak