KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Open Journal of Nano / 2022 / Cilt: 7 - Sayı: 1

Antikanser Acalabrutinib Molekülünün Konformasyonel, Toksik, Fizikokimyasal ve Moleküler Kenetlenme Analizi

Conformational, Toxic, Physicochemical and Molecular Docking Analysis of the Anticancer Acalabrutinib Molecule

Sefa ÇELİK
A. Demet DEMİRAG
Samet ARSLAN
Ayşen ÖZEL
Sevim AKYÜZ
Sayfa
1–9
Yayın Tarihi
2022-06-17
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Daha sonra acalabrutinib'in en kararlı konformerinin DNA ve integrin ile etkileşimleri kenetlenme simülasyonları ile incelenmiş ve en aktif etkileşim bölgeleri ve bağlanma afiniteleri belirlenmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Acalabrutinib, Bruton'un tirozin kinaz (BTK) aktivitesinin bir inhibitörüdür ve B hücresi antijen reseptörü (BCR) sinyal yolunun aktivasyonunu önler.
📊
Temel Bulgular & Veri:Acalabrutinib molekülünün kararlı yapılarını incelemek için yarı deneysel bir yöntem olan AM1 kullanılmıştır.
💡
Sonuç & Katkı:Daha sonra acalabrutinib'in en kararlı konformerinin DNA ve integrin ile etkileşimleri kenetlenme simülasyonları ile incelenmiş ve en aktif etkileşim bölgeleri ve bağlanma afiniteleri belirlenmiştir.
🔬Tür:Modelleme & Sayısal Simülasyon
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Acalabrutinib · Konformasyon analizi · Antikanser

Özet

Acalabrutinib, Bruton'un tirozin kinaz (BTK) aktivitesinin bir inhibitörüdür ve B hücresi antijen reseptörü (BCR) sinyal yolunun aktivasyonunu önler. Acalabrutinib bu özelliklere sahip olduğu için yakın zamanda bir antikanser ilacı olarak tıbbi kullanım için onaylanmıştır. Biyoaktif bir molekülün konformasyonel özelliklerinin belirlenmesi, biyoaktivitesini ortaya çıkarmak için gereklidir. Bu nedenle öncelikle acalabrutinib'in konformasyonel durumları incelenmiştir. Acalabrutinib molekülünün kararlı yapılarını incelemek için yarı deneysel bir yöntem olan AM1 kullanılmıştır. Acalabrutinib molekülünün en düşük enerjili dokuz konformeri belirlenmiştir ve bağıl enerjileri hesaplanmıştır. Daha sonra acalabrutinib'in en kararlı konformerinin DNA ve integrin ile etkileşimleri kenetlenme simülasyonları ile incelenmiş ve en aktif etkileşim bölgeleri ve bağlanma afiniteleri belirlenmiştir.

Abstract

Acalabrutinib is an inhibitor of Bruton's tyrosine kinase (BTK) activity and prevents the activation of the B-cell antigen receptor (BCR) signaling pathway. For having these properties acalabrutinib recently was approved for medical use as an anticancer drug. Determining the conformational properties of a bioactive molecule is necessary to reveal its bioactivity. For this reason, the conformational states of the acalabrutinib were examined first. The AM1, a semi-experimental method, was used to examine the stable conformations of the acalabrutinib molecule. Nine lowest energy conformers of the acalabrutinib molecule were determined and their relative energies were calculated. Afterwards, the interactions of the most stable conformer of acalabrutinib with DNA and integrin were examined by docking simulations, and the most active interaction sites and binding affinities were determined.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ÇELİK, S., DEMİRAG, A. D., ARSLAN, S., ÖZEL, A., AKYÜZ, S. (2022). Antikanser Acalabrutinib Molekülünün Konformasyonel, Toksik, Fizikokimyasal ve Moleküler Kenetlenme Analizi. Open Journal of Nano, Cilt: 7 - Sayı: 1, 1–9. https://ajindex.com/articles/794602

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (9)

  1. Satterthwaite A.B. Bruton’s Tyrosine Kinase, a Component of B Cell Signaling Pathways, Has Multiple Roles in the Pathogenesis of Lupus, Frontiers in Immunology, 8 (2018) 1-10. Article No 1986. Acalabrutinib Monograph for Professionals, Drugs.com. Retrieved 16 March 2019.
  2. Barf, T., Covey, T., Izumi, R., van de Kar, B., Gulrajani, M., van Lith, B.,. & Kaptein, A. (2017). Acalabrutinib (ACP-196): a covalent Bruton tyrosine kinase inhibitor with a differentiated selectivity and in vivo potency profile. Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics, 363(2), 240-252.
  3. Goede V, Fischer K, Busch R, Engelke A, Eichhorst B, Wendtner CM, et al. Obinutuzumab plus chlorambucil in patients with CLL and coexisting conditions. N Engl J Med. 2014;370(12):1101–10.
  4. Cang S, Iragavarapu C, Savooji J, Song Y, Liu D. ABT-199 (venetoclax) and BCL-2 inhibitors in clinical development. J Hematol Oncol. 2015;8(1):129. Novero A, Ravella PM, Chen Y, Dous G, Liu D. Ibrutinib for B cell malignancies. Experimental Hematology & Oncology. 2014;3(1):1–7.
  5. Covey T, Barf T, Gulrajani M, Krantz F, van Lith B, Bibikova E, et al. Abstract 2596: ACP-196: a novel covalent Bruton’s tyrosine kinase (Btk) inhibitor with improved selectivity and in vivo target coverage in chronic lymphocytic leukemia (CLL) patients. Cancer Res. 2015;75(15 Supplement):2596. Walter HS, Rule SA, Dyer MJS, Karlin L, Jones C, Cazin B, et al. A phase 1 clinical trial of the selective BTK inhibitor ONO/GS-4059 in relapsed and refractory mature B-cell malignancies. Blood. 2016;127(4):411–9. The New England Journal of Medicine 374;4 nejm.org January 28, 2016.
  6. Ferit Avcu, Kll Tedavisinde Gelecek: Hedefe Yönelik Yeni Moleküller XXXIX. Ulusal Hematoloji Kongresi. Treon SP, Tripsas CK, Meid K, Warren D, Varma G, Green R, et al. Ibrutinib in previously treated Waldenstrom’s macroglobulinemia. N Engl J Med. 2015; 372(15):1430–40.
  7. Byrd JC, Furman RR, Coutre SE, Flinn IW, Burger JA, Blum KA, et al. Targeting BTK with ibrutinib in relapsed chronic lymphocytic leukemia. N Engl J Med. 2013;369(1):32–42.
  8. Brown JR, Barrientos JC, Barr PM, Flinn IW, Burger JA, Tran A, et al. The Bruton tyrosine kinase inhibitor ibrutinib with chemoimmunotherapy in patients with chronic lymphocytic leukemia. Blood. 2015;125(19):2915–22.
  9. Burger JA, Tedeschi A, Barr PM, Robak T, Owen C, Ghia P, et al. Ibrutinib as initial therapy for patients with chronic lymphocytic leukemia. N Engl J Med. 2015;373(25):2425–37. https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compou