Dergiler / Open Journal of Nano / 2023 / Cilt: 8 Sayı: 1

Bazı Anti-Alzheimer İlaçlarının Asetilkolinesteraz Enzimiyle Etkileşim Mekanizmasının Hesaplamalı İncelemesi

Computational Investigation of the Interaction Mechanism of Some anti-Alzheimer Drugs with the Acetylcholinesterase Enzyme

Sayfa
11–21
Yayın Tarihi
2023-06-30
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Hesaplamalar sonucunda bağlanma modları, bağlanma afiniteleri ve etkileşimler karşılaştırmalı olarak belirlenmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Alzheimer hastalığı ve diğer hafıza bozukluklarında yaygın olarak kullanılan donepezil (C24H29NO3), rivastigmin (C14H22N2O2) ve galantaminin (C17H21NO3) en düşük enerjili konformerlerinin moleküler yapıları Spartan06 programı ve MMFF yöntemi kullanılarak belirlenmiştir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Aynı yöntemle elde edilen optimize geometriler, Asetilkolinesteraz enzimi ile moleküler kenetlenme araştırmalarında başlangıç verisi olarak kullanılmıştır.
💡
Sonuç & Katkı:Hesaplamalar sonucunda bağlanma modları, bağlanma afiniteleri ve etkileşimler karşılaştırmalı olarak belirlenmiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Asetilkolinesteraz Enzimi · Alzheimer · Donepezil

Özet

Alzheimer hastalığı ve diğer hafıza bozukluklarında yaygın olarak kullanılan donepezil (C24H29NO3), rivastigmin (C14H22N2O2) ve galantaminin (C17H21NO3) en düşük enerjili konformerlerinin moleküler yapıları Spartan06 programı ve MMFF yöntemi kullanılarak belirlenmiştir. Aynı yöntemle elde edilen optimize geometriler, Asetilkolinesteraz enzimi ile moleküler kenetlenme araştırmalarında başlangıç verisi olarak kullanılmıştır. Hesaplamalar sonucunda bağlanma modları, bağlanma afiniteleri ve etkileşimler karşılaştırmalı olarak belirlenmiştir.

Abstract

The molecular structures of the lowest-energy conformers of donepezil (C24H29NO3), rivastigmine (C14H22N2O2), and galantamine (C17H21NO3), which are extensively used in Alzheimer's disease and other memory disorders, were identified using the Spartan06 program and the MMFF method. The optimized geometries, obtained with the same method, were used as initial data in molecular docking investigations with the Acetylcholinesterase enzyme. The binding modes, binding affinities, and interactions were comparatively determined as consequence of the calculations.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ÇELİK, S., DEMİRAG, A. D., COŞGUN, A. O., ÖZEL, A., AKYÜZ, S. (2023). Bazı Anti-Alzheimer İlaçlarının Asetilkolinesteraz Enzimiyle Etkileşim Mekanizmasının Hesaplamalı İncelemesi. Open Journal of Nano, Cilt: 8 Sayı: 1, 11–21. https://ajindex.com/articles/911706

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (13)

  1. Soreq, H., Seidman, S. Acetylcholinesterase — new roles for an old actor. Nature Reviews Neuroscience 2, 294–302 (2001).
  2. Villemagne, V. L., Burnham, S., Bourgeat, P., Brown, B., Ellis, K. A., Salvado, O.,. & Masters, C. L. (2013). Amyloid β deposition, neurodegeneration, and cognitive decline in sporadic Alzheimer's disease: a prospective cohort study. The Lancet Neurology, 12(4), 357-367
  3. Jack, C. R., Knopman, D. S., Jagust, W. J., Shaw, L. M., Aisen, P. S., & Weiner, M. W. & Trojanowski JQ (2010). Hypothetical model of dynamic biomarkers of the Alzheimer’s pathological cascade. The Lancet Neurology, 9(1), 119-128
  4. Huang, H. C., & Jiang, Z. F. (2009). Accumulated amyloid-β peptide and hyperphosphorylated tau protein: relationship and links in Alzheimer's disease. Journal of Alzheimer's disease, 16(1), 15-27
  5. Iqbal, K., & Grundke-Iqbal, I. (2010). Alzheimer's disease, a multifactorial disorder seeking multitherapies. Alzheimer's & Dementia, 6(5), 420-424
  6. Shoghi-Jadid, K., Small, G. W., Agdeppa, E. D., Kepe, V., Ercoli, L. M., Siddarth, P.,. & Barrio, J. R. (2002). Localization of neurofibrillary tangles and beta-amyloid plaques in the brains of living patients with Alzheimer disease. The American Journal of Geriatric Psychiatry, 10(1), 24-35
  7. De Felice, F. G., Wu, D., Lambert, M. P., Fernandez, S. J., Velasco, P. T., Lacor, P. N.,. & Klein, W. L. (2008). Alzheimer's disease-type neuronal tau hyperphosphorylation induced by Aβ oligomers. Neurobiology of aging, 29(9), 1334-1347
  8. Norstrom, E. (2017). Metabolic processing of the amyloid precursor protein—new pieces of the Alzheimer’s puzzle. Discovery Medicine, 23(127), 269-276
  9. Edwards III, G., Zhao, J., Dash, P. K., Soto, C., & Moreno-Gonzalez, I. (2020). Traumatic brain injury induces tau aggregation and spreading. Journal of neurotrauma, 37(1), 80-92
  10. Kovacs, G. G. (2018). Tauopathies. Handbook of clinical neurology, 145, 355-368
  11. Iqbal, K., Liu, F., Gong, C. X., & Grundke-Iqbal, I. (2010). Tau in Alzheimer disease and related tauopathies. Current Alzheimer Research, 7(8), 656-664
  12. Panza, F., Lozupone, M., Logroscino, G., & Imbimbo, B. P. (2019). A critical appraisal of amyloid-β-targeting therapies for Alzheimer disease. Nature Reviews Neurology, 15(2), 73-88
  13. Doody, R. S., Stevens, J. C., Beck, C., Dubinsky, R. M., Kaye, J. A., Gwyther, L. M. S. W.,. & Cummings, J. L. (2001). Practice parameter: Management of dement