KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Marmara Fen Bilimleri Dergisi / 2018 / Cilt: 30 - Sayı: 3

Arpa Retrotranspozonlarının (Sukkula ve Nikita) Pimpinella Anisum L.’nin Genetik Yapısını İncelemeye Aktarılabilirliği

Transferability of Barley Retrotransposons (Sukkula and Nikita) to Investigate Genetic Structure of Pimpinella anisum L.

Sevgi MARAKLI
Sayfa
299–304
Yayın Tarihi
2022-10-19
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Sonuçlarımızın, anason ile birlikte tıbbi açıdan önemli bitkilerin genom yapısının anlaşılması için yeni bir bakış açısına katkıda bulunması bekleniyor

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Arpa retrotranspozonlarının (Nikita ve Sukkula) aktarılabilirliği, retrotranspozon temelli bir moleküler markır olan IRAP (retrotranspozon-arası çoğaltılmış polimorfizm) yöntemi kullanılarak Pimpinella anisum L. tohumlarında incelendi.
📊
Temel Bulgular & Veri:Bugüne kadar, anasonda IRAP gibi bir moleküler markır kullanılarak retrotranspozon değerlendirmesi yapan bir çalışma yayınlanmamıştır.
💡
Sonuç & Katkı:Sonuçlarımızın, anason ile birlikte tıbbi açıdan önemli bitkilerin genom yapısının anlaşılması için yeni bir bakış açısına katkıda bulunması bekleniyor
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Arpa retrotranspozonlarının (Nikita ve Sukkula) aktarılabilirliği, retrotranspozon temelli bir moleküler markır olan IRAP (retrotranspozon-arası çoğaltılmış polimorfizm) yöntemi kullanılarak Pimpinella anisum L. tohumlarında incelendi. Ayrıca, tıbbi olarak önemli bitkilerde tanımlanan transpozonların dizileri, NCBI’dan elde edildi ve evrimsel ilişkileri araştırmak için çoklu hizalama analizleri yapıldı. Pimpinella anisum L. bitkisinde tanımlanan bu iki retrotranspozon homomorfik bant profili gösterdi. Bununla birlikte, çoklu hizalama analizleri sonucunda sınırlı sayıda benzer diziler tespit edildi. Bugüne kadar, anasonda IRAP gibi bir moleküler markır kullanılarak retrotranspozon değerlendirmesi yapan bir çalışma yayınlanmamıştır. Sonuçlarımızın, anason ile birlikte tıbbi açıdan önemli bitkilerin genom yapısının anlaşılması için yeni bir bakış açısına katkıda bulunması bekleniyor

Abstract

Transferability of barley retrotransposons (Nikita and Sukkula) were examined in Pimpinella anisum L. seeds by using a retrotransposon-based molecular marker: IRAP (inter-retrotransposon amplified polymorphism). Furthermore, transposons’ sequences identified in medically important plants were obtained form NCBI, and multiple alignment analyses were performed to investigate the evolutionary relationships. These two retrotransposons were identified in Pimpinella anisum L., showing homomorphic band profiles. In addition, limited similar sequences were detected as a result of clustal analyses. Till date, no study about retrotransposons evaluation using IRAP as molecular marker has been published in aniseed. Our results are expected to contribute a new perspective for genome architect of medically important plants in addition to aniseed.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

MARAKLI, S. (2022). Arpa Retrotranspozonlarının (Sukkula ve Nikita) Pimpinella Anisum L.’nin Genetik Yapısını İncelemeye Aktarılabilirliği. Marmara Fen Bilimleri Dergisi, Cilt: 30 - Sayı: 3, 299–304. https://ajindex.com/articles/578365

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (9)

  1. Gülçın, İ., Oktay, M., Kıreçcı, E., & Küfrevıoǧlu, Ö.İ., (2003). Screening of Antioxidant and Antimicrobial Activities of Anise (Pimpinella anisum L.) Seed Extracts. Food Chemistry, 83(3), 371-382.
  2. Rodrigues, V.M., Rosa, P.T., Marques, M.O., Petenate, A.J., & Meireles, M.A.A., (2003). Supercritical Extraction of Essential Oil From Aniseed (Pimpinella anisum L) Using CO2: Solubility, Kinetics, and Composition Data. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 51(6), 1518-1523.
  3. Samojlik, I., Mijatović, V., Petković, S., Škrbić, B., & Božin, B., (2012). The Influence of Essential Oil of Aniseed (Pimpinella anisum, L.) on Drug Effects on the Central Nervous System. Fitoterapia, 83(8), 1466-1473.
  4. Ibrahim, M.K., Mattar, Z.A., Abdel-Khalek, H.H., & Azzam, Y.M., (2017). Evaluation of Antibacterial Efficacy of Anise Wastes Against Some Multidrug Resistant Bacterial Isolates. Journal of Radiation Research and Applied Sciences, 10(1), 34-43.
  5. Koriem, K.M., Arbid, M.S., & El-Gendy, N.F., (2016). The Protective Role of Anise Oil in Oxidative Stress and Genotoxicity Produced In Favism. Journal of Dietary Supplements, 13(5), 505-521.
  6. Jamshidzadeh, A., Heidari, R., Razmjou, M., Karimi, F., Moein, M.R., Farshad, O., Akbarizadeh, A.R. & Shayesteh, M. R. H., (2015). An in vivo and in vitro Investigation on Hepatoprotective Effects of Pimpinella anisum Seed Essential Oil and Extracts Against Carbon Tetrachloride-Induced Toxicity. Iranian Journal of Basic Medical Sciences, 18(2), 205-211.
  7. Asadi, M.H., & Rahamooz-Haghighi, S., (2016). Anti-Proliferative Effect of the Extracts and Essential Oil of Pimpinella anisum on Gastric Cancer Cells. Journal of HerbMed Pharmacology, 5(4), 157-161.
  8. Li, L., Josef, B.A., Liu, B., Zheng, S., Huang, L., & Chen, S., (2017). Three-Dimensional Evaluation on Ecotypic Diversity of Traditional Chinese Medicine: A Case Study of Artemisia annua L. Frontiers in Plant Science, 8, 1225. Wicker, T., Sabot, F., Hua-Van, A., Bennetzen, J.L., Capy, P., Chalhoub, B., Flavell, A., Leroy, P., Morgante, M., Panaud, O., Paux, E., SanMiguel, P., & Paux, E., (2007). A Unified Classification System for Eukaryotic Transposable Elements. Nature Reviews Genetics, 8(12), 973-982.
  9. Schulman, A.H., Flavell, A.J., Paux, E., Ellis, T.H.N., (2012). The application of LTR retrotransposons as molecular markers in plants. In: Bigot, Y. (ed.), Mobile Genetic Elements: Protocols and Genomic Applications. Humana Press, 115153. Gozukirmizi, N., Temel, A., Marakli, S., Yilmaz, S., (2016