Dergiler / Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi / 2021 / Cilt: 11 - Sayı: 3

2-(p-Florofenil)-5-(2-(4-asetilpiperazin-1-il)asetamido)benzoksazol’ün Sentezi, Moleküler Doking, DFTve Antimikrobiyal Aktivite Çalışmaları

Synthesis, Molecular Docking, DFT and Antimicrobial Activity Studies of 2-(p-Fluorophenyl)-5-(2-(4- acetylpiperazin-1-yl)acetamido)benzoxazole

Sayfa
2122–2132
Yayın Tarihi
2022-10-18
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Ayrıca DFT/B3LYP yöntemi ve 6-311G (d,p) temel seti kullanılarak HOMO-LUMOenerjileri, moleküler elektrostatik potansiyel analizi ve optimize edilmiş geometrik yapısı belirlendi ve sonuçlargörüntülendi.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Bu çalışmada, yeni 2-(p-Florofenil)-5-(2-(4-asetilpiperazin-1-il)asetamido)benzoksazol bileşiği üçaşamada sentezlenmiş ve yapısı 1H-NMR ve 13C-NMR spektroskopisi ile aydınlatılmıştır.
📊
Temel Bulgular & Veri:Antimikrobiyal aktiviteçalışmaları, Staphylococcus aureus ATCC 29213, Enterococcus faecalis ATCC 29212, Escherichia coli ATCC25922, Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853, Acinetobacter baumannii NTCC 13304, Klebsiella pneumoniae ATCC 700603, Candida albicans ATCC 10231 ve bunların izolatları izolatları üzerinde gerçekleştirildi.Antimikrobiyal aktivite sonuçlarına göre, referans ilaçlar genel olarak daha iyi antimikrobiyal aktivitegöstermesine rağmen sentezlenen bileşik, MİK: 32 µg mL-1 ile ampisilin ile karşılaştırıldığında E. faecalis izolatları ve E. coli izolatları üzerinde oldukça umut verici aktivite gösterdi.
💡
Sonuç & Katkı:Ayrıca DFT/B3LYP yöntemi ve 6-311G (d,p) temel seti kullanılarak HOMO-LUMOenerjileri, moleküler elektrostatik potansiyel analizi ve optimize edilmiş geometrik yapısı belirlendi ve sonuçlargörüntülendi.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Bu çalışmada, yeni 2-(p-Florofenil)-5-(2-(4-asetilpiperazin-1-il)asetamido)benzoksazol bileşiği üçaşamada sentezlenmiş ve yapısı 1H-NMR ve 13C-NMR spektroskopisi ile aydınlatılmıştır. Antimikrobiyal aktiviteçalışmaları, Staphylococcus aureus ATCC 29213, Enterococcus faecalis ATCC 29212, Escherichia coli ATCC25922, Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853, Acinetobacter baumannii NTCC 13304, Klebsiella pneumoniae ATCC 700603, Candida albicans ATCC 10231 ve bunların izolatları izolatları üzerinde gerçekleştirildi.Antimikrobiyal aktivite sonuçlarına göre, referans ilaçlar genel olarak daha iyi antimikrobiyal aktivitegöstermesine rağmen sentezlenen bileşik, MİK: 32 µg mL-1 ile ampisilin ile karşılaştırıldığında E. faecalis izolatları ve E. coli izolatları üzerinde oldukça umut verici aktivite gösterdi. Moleküler doking çalışması DNAgiraz subunit B yapısı üzerinde gerçekleştirildi. Teorik ADME (absorbsiyon, dağılım, metabolizma, eliminasyon)özellikleri hesaplandı. Ayrıca DFT/B3LYP yöntemi ve 6-311G (d,p) temel seti kullanılarak HOMO-LUMOenerjileri, moleküler elektrostatik potansiyel analizi ve optimize edilmiş geometrik yapısı belirlendi ve sonuçlargörüntülendi.

Abstract

In this study, the new compound 2-(p-Fluorophenyl)-5-(2-(4-acetylpiperazine-1-yl)acetamido)benzoxazole was synthesized in three steps and its structure was clarified by 1H-NMR and 13C-NMRspectroscopy. Its antimicrobial activity was studied on Staphylococcus aureus ATCC 29213, Enterococcusfaecalis ATCC 29212, Escherichia coli ATCC 25922, Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853, Acinetobacterbaumannii NTCC 13304, Klebsiella pneumoniae ATCC 700603, Candida albicans ATCC 1023, and theirisolates. When the antimicrobial activity results were examined, although the reference drugs showed betterantimicrobial activity in general, the synthesized compound showed quite promising activity on E. faecalis isolates and E. coli isolates compared to ampicillin with MIC: 32 µg mL-1 . Molecular docking study was carriedout on the DNA gyrase subunit B structure. Theoretical ADME (absorption, distribution, metabolism,elimination) properties were calculated. In addition, HOMO-LUMO energies, molecular electrostatic potentialanalysis, and optimized geometric structure were determined using the DFT/B3LYP method and the 6-311G (d,p)basis set, and the results were displayed.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

KUYUCUKLU, G., EROL, M., ÇELİK, İ. (2022). 2-(p-Florofenil)-5-(2-(4-asetilpiperazin-1-il)asetamido)benzoksazol’ün Sentezi, Moleküler Doking, DFTve Antimikrobiyal Aktivite Çalışmaları. Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, Cilt: 11 - Sayı: 3, 2122–2132. https://ajindex.com/articles/538510

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (7)

  1. Arandjelovic P, Doerflinger M, Pellegrini M, 2019. Current and emerging therapies to combat persistent intracellular pathogens. Current opinion in pharmacology, 48: 33-39.
  2. Arisoy M, Temiz-Arpaci O, Yildiz I, Kaynak-Onurdag F, Aki E, Yalcin I, Abbasoglu U, 2008. Synthesis, antimicrobial activity and QSAR studies of 2, 5-disubstituted benzoxazoles. SAR and QSAR in Environmental Research, 19(5-6): 589-612.
  3. Arısoy M, Temiz-Arpaci O, Kaynak-Onurdag F, Ozgen S, 2012. Synthesis and antimicrobial activity of novel benzoxazoles. Zeitschrift fur Naturforschung. C, Journal of biosciences, 67(9-10): 466-472. Biovia DS, 2017. Discovery studio visualizer. San Diego, CA, USA. Celik I, Erol M, Temiz Arpaci O, Sezer Senol F, Erdogan Orhan I, 2020. Evaluation of Activity of Some 2,5-Disubstituted Benzoxazole Derivatives against Acetylcholinesterase, Butyrylcholinesterase and Tyrosinase: ADME Prediction, DFT and Comparative Molecular Docking Studies. Polycyclic Aromatic Compounds, 1-12. Cheminformatics M, 2018. Calculation of molecular properties and bioactivity score. Computer software. Retrieved from http://www. molinspiration. com/cgi-bin/properties. CLSI, 2008. Reference method for broth dilution antifungal susceptibility testing of yeasts. Approved standard third edition CLSI document M27-A3. CLSI, 2018. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing: Approved Twenty-: Document M100-S28. Wayne, PA, USA. El‐Helby AGA, Sakr H, Eissa IH, Abulkhair H, Al‐Karmalawy AA, El‐Adl K, 2019. Design, synthesis, molecular docking, and anticancer activity of benzoxazole derivatives as VEGFR‐2 inhibitors. Archiv der Pharmazie, 352(10): 1-19.
  4. Erol M, Celik I, Uzunhisarcikli E, Kuyucuklu G, 2020.
  5. Synthesis, Molecular Docking, and DFT Studies of Some New 2, 5-Disubstituted Benzoxazoles as Potential Antimicrobial and Cytotoxic Agents. Polycyclic Aromatic Compounds, 1-18. French G, 2010. The continuing crisis in antibiotic resistance. International journal of antimicrobial agents, 36: S3-S7. Frisch M, 2019. Gaussian09. http://www. gaussian. com. (Erişim Tarihi:05.01 2021). GaussView V, 2016.
  6. Roy Dennington, Todd A. Keith, and John M. Millam, Semichem Inc., Shawnee Mission, KS. Huey R, Morris GM, 2008. Using AutoDock 4 with AutoDocktools: a tutorial. The Scripps Research Institute, USA, 54-56.
  7. Kaur A, Pathak DP, Sharma V, Wakode S, 2018. Synthesis, biological evaluation and docking study of a new series of di-substituted benzoxazole derivatives as selective COX-2 inhibitors a