Dergiler / Harran Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi / 2019 / Cilt: 23 - Sayı: 2

Hereford ırkı sığırlarda stearoyl-CoA desaturase (SCD) gen polimorfizmi

Polymorphism of stearoyl-CoA desaturase (SCD) gene in Hereford cattle breed

Sayfa
247–253
Yayın Tarihi
2019-06-18
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

SCD geni ekson V bölgesi gen dizi bilgilerine göre A702G, T762C ve C878T tek nükleotid polimorfizmleri (SNP) tespit edilmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Bu çalışmada, Hereford ırkı sığır populasyonunda Stearoyl CoA Desaturase (SCD) gen polimorfizmi belirlenmiştir.
📊
Temel Bulgular & Veri:SCD geni ekson V bölgesi gen dizi bilgilerine göre A702G, T762C ve C878T tek nükleotid polimorfizmleri (SNP) tespit edilmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:Ayrıca ilgili SNP’ler bakımından populasyonun Hardy-Weinberg dengesinde olmadığı belirlenmiştir (P>0.05).
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Hereford · Stearoyl CoA Desaturase geni · Polimorfizm

Özet

Bu çalışmada, Hereford ırkı sığır populasyonunda Stearoyl CoA Desaturase (SCD) gen polimorfizmi belirlenmiştir. SCD geni ekson V bölgesi gen dizi bilgilerine göre A702G, T762C ve C878T tek nükleotid polimorfizmleri (SNP) tespit edilmiştir. A702G bölgesinde AA, AG ve GG genotiplerinin frekansları sırasıyla; %20.69, 44.83 ve 34.45, T762C bölgesinde TT, TC ve CC genotiplerinin frekansları sırasıyla; %13.79, 62.07 ve 24.14, C878T bölgesinde CC, CT ve TT genotiplerinin frekansları sırasıyla; %44.83, 31.03 ve 24.14 olarak hesaplanmıştır. Bununla beraber, A702G bölgesinde A ve G allel frekansları 0.431 ve 0.569, T762C bölgesinde T ve C allel frekansları 0.448 ve 0.552, C878T bölgesinde C ve T allel frekansları 0.603 ve 0.397'dir. Ayrıca ilgili SNP’ler bakımından populasyonun Hardy-Weinberg dengesinde olmadığı belirlenmiştir (P>0.05).

Abstract

In this study, Stearoyl CoA Desaturase (SCD) gene polymorphism was determined in Hereford cattle breed. A702G, T762C and C878T single nükleotid polymorfphisms (SNPs) have been identified based on DNA sequence information of exon V region in SCD gene. AA, AG and GG genotype frequencies were 20.69%, 44.83% and 34.45% in A702G region, and TT, TC and CC genotype frequencies were 13.79%, 62.07% and 24.14% T762C region, and CC, CT and TT genotype frequencies were %44.83, 31.03 and 24.14 in C878T region, respectively. In addition, A and G allele frequencies were 0.431 and 0.569 in A702G region, T and C allele frequencies were 0.448 and 0.552 in T762C region, and C and T allele frequencies were 0.603 and 0.397 in C878T region, respectively. In addition, it was found that the population was not at Hardy-Weinberg equilibrium in terms of related SNP genotypes.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

NERGİS, H., KONCAGÜL, S., KİRAZ, S. (2019). Hereford ırkı sığırlarda stearoyl-CoA desaturase (SCD) gen polimorfizmi. Harran Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi, Cilt: 23 - Sayı: 2, 247–253. https://ajindex.com/articles/423104

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (10)

  1. Bölükbaşı, C., Erhan, M.K., Çelebi, Ş. 2005. The effects of dietary conjugated linoleic acid (CLA),sunflower oil and soybean oil on fatty acid composition of yolk and egg quality in laying hen. J. Food. Tech. 3(3): 427-429.
  2. Chung, M., Ha, S., Jeong, S., Bok, J., Che, K., Baik, M., Choi, Y. 2000. Clonning and characterization of bovine Stearoyl CoA desaturase cDNA from adipose tissues. Bioscience, Biotechnology and Biochemistry, 64: 1526-1530.
  3. Conte, G., Mele, M., Castiglinoni, B., Serra, A., Viva, M., Chessa, S., Pagnacco, G., Secchiari, P. 2006. Relationship between bovine SCD polymorphism locus and mammary gland desaturation activity. In: Procceedings of the 8th World congress on genetics applied to livestock prodiction. Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil,13-18
  4. August, Pp. 22-37.
  5. Elmas, H., Koncagül, S., Kiraz, S. 2015. Sığırlarda SCD (stearoyl-coa desaturase) geni. GAP VII. Tarım Kongresi Bildiri Kitabı, 28 Nisan -01 Mayıs. HRÜ. Şanlıurfa. Kgwatalala, P.M., Ibeagha-Awemu, E.M., Mustafa, A.F., Zhao, X. 2009. Influence of Stearoyl coenzyme a desaturase 1 genotype and stage of lactation on fatty acid composition jersey cows. Journal of Dairy Sciences, 92: 1220-1228.
  6. Köknaroğlu, H. 2007. Beslemenin sığır eti konjuge linoleik asit miktarına etkisi. Hayvansal Üretim, 48(1): 1-7.
  7. Loor, J.J., Lin, X.B., Herbein, J.H. 2003. Effects of dietary cis-9, trans-11-18:2, trans-10, cis-12-18:2, or vaccenic acid (trans-11-18:1) during lactation on body composition, tissue fatty acid profiles, and litter growth in mice. Br. J. Nutr., 90: 1039-1048.
  8. Macciota, N.P.P., Mele, M., Conte, G., Serra, A., Cassandro, M., Dal Zotto, R., Borlino, A.C., Pagnacco, G., Secchiari, P. 2008. Association between an polymorophism at the Stearoyl-CoA desaturase locus and milk production traits in Italian holsteins. Journan of Dairy Sciences, 91: 3184-3189.
  9. Matsuhashi, T., Maruyama, S., Uemoto, Y., Kobayashi, N., Manen, H., Abe, T., Sakaguch, S., Kobayashi, E. 2011. Effects of bovine fatty acid synthase, Stearoyl coenzyme a desaturase, sterol regulatory element-binding protein 1, and growth hormone gene polymorphisms on fatty acid composition and carcass traits in Japanese black cattle. Journal of Animal Science, 89: 12-22.
  10. Milanesi, E., Nicoloso, L., Crepaldi, P. 2007. Stearoyl CoA Desaturase (SCD) gene polymorphisms in Italian cattle breeds. sezione di zootecnica agraria, dipartimento di scienze animali, Universita Delgi Studi di Milano, Milamo, Italy. Milanesi, E., Nicoloso, L., Crepaldi