KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Turkish Journal of Analytical Chemistry / 2022 / Cilt: 4 Sayı: 2

Investigation of Interaction of Bismarck Brown Y- Palladium Complex with AS1411 G-quadruplex Aptamer

Esra Bağda(SIVAS CUMHURIYET UNIVERSITY, FACULTY OF PHARMACY, PHARMACY PR.)0000-0003-1900-4944
Rümeysa Durak(SIVAS CUMHURIYET UNIVERSITY)0000-0001-8345-3248
Efkan Bağda(SIVAS CUMHURIYET UNIVERSITY)0000-0002-3925-3430
Didem Duman(SIVAS CUMHURIYET UNIVERSITY)0000-0002-0900-0336
Ebubekir Ayhan(SIVAS CUMHURIYET UNIVERSITY)0000-0002-5371-8425
Sayfa
116–122
Yayın Tarihi
2022-12-29
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Etkileşimlerin varlığı, yüksek hassasiyetli LED kaynaklı floresan dedektör Qsep100 kapiler jel elektroforez sistemi kullanılarak DNA polimeraz durdurma testi ile desteklenmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Artan metabolik aktivite ve metastaz, kanser hücrelerinin ana ve en bilinen özellikleridir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Hücrelerin artan aktivitesi, G-dörtlü yapıların oluşumunda artışa neden olur.
💡
Sonuç & Katkı:Etkileşimlerin varlığı, yüksek hassasiyetli LED kaynaklı floresan dedektör Qsep100 kapiler jel elektroforez sistemi kullanılarak DNA polimeraz durdurma testi ile desteklenmiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:G-quadruplex DNA · As1411 · Bismarck brown Y

Abstract

Artan metabolik aktivite ve metastaz, kanser hücrelerinin ana ve en bilinen özellikleridir. Hücrelerin artan aktivitesi, G-dörtlü yapıların oluşumunda artışa neden olur. G-quadruplex'in çeşitli ligandlarla stabilizasyonu veya destabilizasyonu, hücre proliferasyonunda bozulmalara neden olabilir. Dolayısıyla, bu ikincil yapının stabilizasyonu veya destabilizasyonu önemli antikanser ilaç hedefleridir. Bu çalışmada, Bismarck kahverengi Y-Pd kompleksi, kolay, tek aşamalı bir karıştırma yöntemiyle oluşturulmuştur. Kompleksin spektral özellikleri ve stokiyometrisi, Uv-vis spektrofotometrik olarak araştırıldı. 1:2, Bismarck Brown Y-Pd kompleksinin AS1411 G-dörtlü yapı ile etkileşimi spektrofotometrik titrasyon ile araştırıldı. Bağlanma sabitleri hesaplandı ve 4.38 (±1.96) x104 M-1 olarak bulundu. Kompleksin G-dörtlü konformasyon üzerindeki etkisi CD spektroskopisi ile araştırıldı. Etkileşimlerin varlığı, yüksek hassasiyetli LED kaynaklı floresan dedektör Qsep100 kapiler jel elektroforez sistemi kullanılarak DNA polimeraz durdurma testi ile desteklenmiştir.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

Bağda, E., Durak, R., Bağda, E., Duman, D., Ayhan, E. (2022). Investigation of Interaction of Bismarck Brown Y- Palladium Complex with AS1411 G-quadruplex Aptamer. Turkish Journal of Analytical Chemistry, Cilt: 4 Sayı: 2, 116–122. https://doi.org/10.51435/turkjac.1203081

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (26)

  1. [World Health Organization, WHO report on cancer: setting priorities, investing wisely and providing care for all, (2020).
  2. C. Schiliro, B.L. Firestein, Mechanisms of metabolic reprogramming in cancer cells supporting enhanced growth and proliferation, Cells, 10(5), 2021, 1056. https://doi.org/10.3390/cells10051056
  3. A.R. Yadav, S.K. Mohite, Cancer-A silent killer: An overview, Asian Pharm Res, 10(3), 2020, 213–216. 10.5958/2231-5691.2020.00036.2
  4. M.A. Khan, M. Tania, J. Fu, Epigenetic role of thymoquinone: impact on cellular mechanism and cancer therapeutics, Drug Discov Today, 24(12), 2019, 2315–2322. https://doi.org/10.1016/j.drudis.2019.09.007
  5. T. Das, D. Panda, P. Saha, J. Dash, Small molecule driven stabilization of promoter G-quadruplexes and transcriptional regulation of c-MYC, Bioconjugate Chem, 29(8), 2018, 2636–2645. https://doi.org/10.1021/acs.bioconjchem.8b00338
  6. E. Bağda, E. Bağda, The recent studies about the interaction of phthalocyanines with DNA, Turkish Anal Chem, 3(1), 2021, 9–18. https://doi.org/10.51435/turkjac.938781
  7. L. Hassani, Z. Fazeli, E. Safaei, H. Rastegar, M. Akbari, A spectroscopic investigation of the interaction between c-MYC DNA and tetrapyridinoporphyrazinatozinc (II), J Biol Phys, 40(3), 2014, 275–283. 10.1007/s10867-014-9348-x
  8. D. Bhattacharyya, G. Mirihana Arachchilage, S. Basu, Metal cations in G-quadruplex folding and stability, Front Chem, 4, 2016, 38. https://doi.org/10.3389/fchem.2016.00038
  9. Q. Li, J.F. Xiang, H. Zhang, Y.L. Tang, Searching drug-like anti-cancer compound (s) based on G-quadruplex ligands, Curr Pharm Design, 18(14), 2012, 1973–1983. 10.2174/138161212799958369
  10. Z. Shen, K.A. Mulholland, Y. Zheng, C. Wu, Binding of anticancer drug daunomycin to a TGGGGT G-quadruplex DNA probed by all-atom molecular dynamics simulations: Additional pure groove binding mode and implications on designing more selective G-quadruplex ligands, Mol Model, 23(9), 2017, 1–11. 10.1007/s00894-017-3417-6
  11. A. Awadasseid, X. Ma, Y. Wu, W. Zhang, G-quadruplex stabilization via small-molecules as a potential anti-cancer strategy, Biomed Pharmacother, 139, 2021, 111550. 10.1016/j.biopha.2021.111550
  12. Q. Cao, Y. Li, E. Freisinger, P.Z. Qin, R.K. Sigel, Z.W. Mao, G-quadruplex DNA targeted metal complexes acting as potential anticancer drugs, Inorg Chem Front, 4(1), 2017, 10–32. https://doi.org/10.1039/C6QI00300A
  13. R. Yazdian-Robati, P. Bayat, F. Oroojalian, M. Zargari, M. Ramezani, S.M. Taghdisi, K. Abnous, Therapeutic applications of AS1411 aptamer, an update review. Int Biol Macromol, 155, 2020, 1420–1431. 10.1016/j.ijbiomac.2019.11.118
  14. J. Carvalho, J.L. Mergny, G.F. Salgado, J.A. Queiroz, C. Cruz, G-quadruplex, Friend or Foe: The Role of the G-quartet in Anticancer Strategies, Trends Mol Med, 26(9), 2020, 848–861. 10.1016/j.molmed.2020.05.002
  15. J. Figueiredo, J. Lopes-Nunes, J. Carvalho, F. Antunes, M. Ribeiro, M.P.C. Campello, A. Paulo; A. Paiva, G.F. Salgado, J.A. Queiroz, J.L. Mergny, C. Cruz, AS1411 derivatives as carriers of G-quadruplex ligands for cervical cancer cells, Int Pharm, 568, 2019, 118511. 10.1016/j.ijpharm.2019.118511
  16. E. Krieg, M.M. Bastings, P. Besenius, B. Rybtchinski, Supramolecular polymers in aqueous media, Chem Rev, 116(4), 2016, 2414–2477. https://doi.org/10.1021/acs.chemrev.5b00369
  17. Y. Liu, J. Li, M. Chen, X. Chen, N. Zheng, Palladium-based nanomaterials for cancer imaging and therapy, Theranostics, 10(22), 2020, 10057. https://doi.org/10.7150%2Fthno.45990
  18. E. Bağda, E. Bağda, A. Kocak, M. Durmuş, Investigation of Binding behaviour of a water-soluble gallium (III) phthalocyanine with double-stranded and G-quadruplex DNA via experimental and computational methods, Mol Struct, 1240, 2021, 130536. https://doi.org/10.1016/j.molstruc.2021.130536
  19. H. Han, L.H. Hurley, M. Salazar, A DNA polymerase stop assay for G-quadruplex-interactive compounds, Nucleic acids research, 27(2), 1999, 537–542. https://doi.org/10.1093/nar/27.2.537
  20. A. Dey, K. Pandav, M. Nath, R. Barthwal, R. Prasad, Binding characterization of anthraquinone derivatives by stabilizing G-quadruplex DNA leads to an anticancerous activity, Mol Ther-Nucl Acids, 2022. https://doi.org/10.1016/j.omtn.2022.11.008
  21. H.J. Lipps, D. Rhodes, G-quadruplex structures: in vivo evidence and function. Trends Cell Biol, 19(8), 2009. 414–422. https://doi.org/10.1016/j.tcb.2009.05.002
  22. S.M. Haider, S. Neidle, G.N. Parkinson, A structural analysis of G-quadruplex/ligand interactions. Biochimie, 93(8), 2011, 1239–1251. https://doi.org/10.1016/j.biochi.2011.05.012
  23. H. Li, Y. Tang, S. Lei, Z. You, T. Yang, S. Wang, A Spectroscopic Study of the Interaction Between the Bismarck Brown R–Eu (III) Complex and DNA, Appl Spectrosc, 85(4), 2018, 791–799. https://doi.org/10.1007/s10812-018-0720-7
  24. J. Alzeer, B.R. Vummidi, P.J. Roth, N.W. Luedtke, Guanidinium‐modified phthalocyanines as high‐affinity G‐Quadruplex fluorescent probes and transcriptional regulators, Angew Chem Int Edit, 48(49), 2009, 9362–9365. https://doi.org/10.1002/anie.200903685
  25. A.K. Jain, V.V. Reddy, A. Paul, and S. Bhattacharya, Synthesis and evaluation of a novel class of G-quadruplex-stabilizing small molecules based on the 1, 3-phenylene-bis (piperazinyl benzimidazole) system, Biochemistry, 48(45), 2009, 10693–10704. https://doi.org/10.1021/bi9003815
  26. Z. Bagheri, B. Ranjbar, H. Latifi, M.I. Zibaii, T.T Moghadam, A. Azizi, Spectral properties and thermal stability of AS1411 G-quadruplex, Int Biol Macromol, 72, 2015, 806–811. https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2014.09.016