Dergiler / Anadolu Tarım Bilimleri Dergisi / 2015 / Cilt: 30 - Sayı: 3

Samsun ilinde sert çekirdekli meyve türlerinde Şarka hastalığı etmeninin (Plum pox virus) belirlenmesi

Determination of Plum pox virus, the causal agent of Sharka Disease, in Samsun Province

Sayfa
227–235
Yayın Tarihi
2015-12-08
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bu çalışma, Karadeniz Bölgesi’nde Samsun ilinin yanısıra diğer illerde de sert çekirdekli meyve bahçelerinin PPV ile bulaşıklık durumunun detaylı incelenmesinin gerekliliğini ortaya koymuştur.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Plum pox virus (PPV), erik, şeftali, nektarin, kayısı, badem, kiraz ve vişne gibi sert çekirdekli meyve ağaçlarının en önemli viral etmenlerinden birisidir.
📊
Temel Bulgular & Veri:PPV ırkları günümüzde en az 8 alt grupta toplanmıştır.
💡
Sonuç & Katkı:Bu çalışma, Karadeniz Bölgesi’nde Samsun ilinin yanısıra diğer illerde de sert çekirdekli meyve bahçelerinin PPV ile bulaşıklık durumunun detaylı incelenmesinin gerekliliğini ortaya koymuştur.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:2013 · 22 örnek
⚙️Değişkenler:plum · apricot · PPV

Özet

Plum pox virus (PPV), erik, şeftali, nektarin, kayısı, badem, kiraz ve vişne gibi sert çekirdekli meyve ağaçlarının en önemli viral etmenlerinden birisidir. PPV ırkları günümüzde en az 8 alt grupta toplanmıştır. Türkiye’de bugüne kadar yapılan çalışmalarda Marmara, İç Anadolu, Ege ve Akdeniz Bölgelerinde PPV’nin bulaşık olduğu bahçeler tespit edilmiş, virüsün ırk düzeyinde tanısı yapılmış ve dağılımı belirlenmiştir. Karadeniz Bölgesi’nde ise şu ana kadar sert çekirdekli meyve üretimi yapılan alanlarda Şarka hastalığının varlığına dair bir kayda rastlanmamıştır. Bu çalışmada, Samsun ili Canik ilçesinde 2013 yılı Temmuz ayında PPV-benzeri yaprak ve meyve simptomları gösteren 4 bahçe belirlenmiş ve 9 kayısı, 6 nektarin, 4 erik ve 3 şeftali ağacından toplam 22 örnek test edilmek üzere alınmıştır. PPV’ye spesifik antiserum kullanılarak DAS-ELISA ve PPV’ye spesifik primerler kullanılarak RT-PCR yöntemleri ile örneklerin test edilmesi sonucunda, iki kayısı ağacı ve bir erik ağacının PPV ile enfekteli olduğu belirlenmiştir. Kayısı ve erik izolatlarının kısmi kılıf protein (CP) bölgesi nükleotid dizileri elde edilmiş ve nükleotid BLAST analizine göre en yüksek benzerliği (% 99) Ankara’da kayısı ağacından izole edilen AbTk izolatı (PPV-T strain) ve yine Türkiye’den elde edilen Abricotier Turquie izolatı ile gösterdiği belirlenmiştir. Bu çalışma, Karadeniz Bölgesi’nde Samsun ilinin yanısıra diğer illerde de sert çekirdekli meyve bahçelerinin PPV ile bulaşıklık durumunun detaylı incelenmesinin gerekliliğini ortaya koymuştur.

Abstract

Plum pox virus (PPV) is one of the most destructive and serious viral agent of stone fruits such as plum, peach, nectarine, apricot, almond, sweet and sour cherries. PPV strains have been classified into at least eight sub-groups. PPV has been detected in some orchards in different geographical regions of Turkey including Marmara, Central Anatolia, Aegean and Mediterranean, and the strains of PPV and their distributions have been determined. To date, there is no report on the presence of PPV in the Black Sea Region. PPV-like fruit and leaf symptoms were noticed in four stone fruit orchards in Canik district of Samsun province in July 2013, and a total of 22 samples were taken from nine apricot, six nectarine, four plum and three peach trees. Only one plum and two apricot trees were found to be infected by DAS-ELISA using virus-spesific polyclonal antiserum and RT-PCR method using PPV-specific primers. The partial nucleotide sequences of coat protein (CP) region of plum and apricot isolates were obtained. Nucleotide BLAST analysis showed that plum and apricot isolates had the highest (99%) sequence similarity at nucleotide level with PPV-AbTk isolate (PPV-T strain) found on apricot trees in Ankara province and the PPV Abricotier Turquie isolate. This study revealed that the occurrence and distribution of PPV infection in stone fruit orchards needs to be investigated in the Black Sea Region in detail.

Anahtar kelimeler
🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

DELİGÖZ, İ., DEĞİRMENCİ, K., SÖKMEN, M. (2015). Samsun ilinde sert çekirdekli meyve türlerinde Şarka hastalığı etmeninin (Plum pox virus) belirlenmesi. Anadolu Tarım Bilimleri Dergisi, Cilt: 30 - Sayı: 3, 227–235. https://ajindex.com/articles/135755

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (10)

  1. Akbaş, B., Değirmenci, K., Çiftçi, O., Kaya, A., Yurtmen, M., Uzunoğulları, N., Çelik, N., Türkölmez, Ş. 2011. Update on Plum pox virus distribution in Turkey, Phytopathol. Mediterr., 50: 75-83.
  2. Azeri, T. 1994. Detection of virus diseases of stone fruits in agean region of Turkiye. 9th Congress of Mediterranean Phytopathological Union, Kuşadası, Aydın, Türkiye. 511-513 p. Baumgartnerova, H. 1996. First findings of Plum pox virus in wallnut trees (Juglans regia L.). Acta Virologica, 40: 59-60.
  3. Berger, P., Barnett, O.W., Brunt, A.A., Colinet, D., Edwardson, 1.R., Hammond, 1., Hill, 1.H., Jordan, R.L., Kashwazaki, S., Makkouk, K., Morales, F.1., Rybicki, E., Spence, N., Ohki, S.T., Uyeda, I., van Zaayen, A., Vetten, R.I. 2000. Family Potyviridae. In: Virus Taxonomy. Seventh Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Springer- Verlag, NY. pp 703-724.
  4. Brunt, A.A., Crabtree, K., Dallwitzitz, M.J., Gibbs, A.J., Watson, L. 1996. Viruses of plants. CAB International, 1484 pp. Caglayan, K. 2006. Plum pox virus (PPV) in Turkey. Bulletin OEPP/EPPO Bulletin, 36: 216. Candresse, T., Cambra, M., Dallot, S., Lanneau, M., Asensio, M., Gorris, M.T., Revers, F., Macquaire, G., Olmos, A., Boscia, D., Quiot, J.B., Dunez, J. 1998. Comparison of monoclonal antibodies and polymerase chain reaction assays for the typing of izolates belonging to the D and M serotypes of Plum pox potyvirus. Phytopathology, 88: 198-204.
  5. Candresse T., Cambra, M. 2006. Plum pox virus strains or types: historical perspective and current status. EPPO Bulletin 36: 239-246.
  6. Candresse, T., Svanella-Dumas, L., Gentit, P., Çağlayan, K., Çevik, B. 2007. First report of the presence of Plum pox virus Rec strain in Turkey. Plant Disease, 91: 331. Ceylan, A., Gürcan, K., Akbulut, M., Ghaderi, M. 2014. Kayseri’de yüksek şarka enfeksiyonu. Erciyes Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 30(2): 80-85.
  7. Chirkov, S., Ivanov, P., Sheveleva, A. 2013. Detection and partial molecular characterization of atypical Plum pox virus isolates from naturally infected sour cherry. Archives of Virology, 158(6): 1383-1387.
  8. Crescenzi, A., D'aquino, L., Comes, S., Nuzzaci, M., Piazzolla, P. 1997. Charecterisation of the sweet cherry ısolate of Plum pox potyvirus, Plant Disease, 81: 711-714.
  9. Clark, M.R., Adams, A.M. 1977. Characteristics of the microplate method of enzyme-linked immunosorbent assay for the detection of plant viruses. J. General Virology, 34: 475-483.
  10. Çelik, N., Topkaya Kütük, B. 2013. Antalya il