Dergiler / Anadolu Tarım Bilimleri Dergisi / 2014 / Cilt: 29 - Sayı: 1

MORPHOLOGICAL AND MOLECULAR COMPARISON OF SELECTED CHESTNUT (Castanea sativa Mill.) GENOTYPES FROM BLACK SEA REGION OF TURKEY

Sayfa
54–62
Yayın Tarihi
2014-02-15
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Genotiplerin ayırt edilmesinde 10 morfolojik kriterin etkili olduğu tespit edilmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Bu çalışmada 14 Türk kestane genotipinde fenotipik ve genotipik farklılıklar incelenmiştir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Genotipler, hem genetik olarak hem de 12’si kalitatif ve 18’i kantitatif olmak üzere toplam 30 morfolojik kritere göre analiz edilmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:Genotiplerin ayırt edilmesinde 10 morfolojik kriterin etkili olduğu tespit edilmiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Genetic similarity · morphological criteria · phylogenetic tree

Özet

Bu çalışmada 14 Türk kestane genotipinde fenotipik ve genotipik farklılıklar incelenmiştir. Genotipler, hem genetik olarak hem de 12’si kalitatif ve 18’i kantitatif olmak üzere toplam 30 morfolojik kritere göre analiz edilmiştir. Çalışmada, Sinop, Samsun, Artvin ve Bartın illerinden seçilen farklı kestane genotipleri arasındaki filogenetik ilişkiler belirlenmiştir. Morfolojik kriterler çok değişkenli analizler kullanılarak biometrik olarak araştırılmıştır. Genotiplerin ayırt edilmesinde 10 morfolojik kriterin etkili olduğu tespit edilmiştir. Bunlardan beşinin genotipler arasındaki farklılığın %64,1’ini açıkladığı saptanmıştır. Bu kriterler: diş uzunluğu/diş genişliği oranı, hilum uzunluğu/meyve uzunluğu oranı, yaprakta enine kesit, meyve yüksekliği/meyve uzunluğu oranı ve tohum zarının soyulabilirliği’dir. Morfolojik kriterlere göre yapılan kümeleme analizinde dört ana grubun oluştuğu görülmüştür. “Dice” katsayısı RAPD analizi ile sonuçlarına gore hesaplanmış ve genetik benzerlik durumunun değerlendirilmesinde kullanılmıştır. Buna göre de 3 ana grubun oluştuğu görülmüştür. Filogenetik ağaçlar UPGMA metoduna göre oluşturulmuştur. Genetik ve morfolojik dendogramlar Mantel testi yardımıyla karşılaştrılmış ve r=-0.33 korelasyon katsayısı hesaplanmıştır. Bu çalışma seçilen genotiplerin gelecekte yapılacak ıslah çalışmaları için değerli genetik kaynaklar olduğunu göstermiştir.

Abstract

Here we report phenotypic and genotypic differences among 14 Turkish chestnut genotypes. The genotypes were analyzed both genetically and for 30 morphological criteria comprising 12 qualitative and 18 quantitative characteristics. The phylogenetic relationships were determined between different chestnut genotypes selected from Sinop, Samsun, Artvin and Bartin provinces of Black Sea Region in Turkey. Morphological criteria were investigated biometrically using multivariate analysis. Ten morphological criteria were found to be effective for discrimination between the genotypes. Five morphological criteria accounts for 64.1% of the variability. These morphological criteria were the ratio of length of teeth to width of teeth, the ratio of length of hilum to length of fruit, cross section of leaves, the ratio of height of fruit to length of fruit and peeling of testa. The discrimination of morphological criteria was shown using cluster analysis, which created four main groups. Dice’s coefficient was used to evaluate the genetic similarity by RAPD analysis, which created three main groups. The UPGMA method was used for the determination of phylogenetic trees. The genetic and morphological dendrograms were compared using the Mantel test, which gave a correlation of r=-0.33. The discrimination of morphological criteria was shown using cluster analysis, which created four main groups. Dice’s coefficient was used to evaluate the genetic similarity by RAPD analysis, which created three main groups. The UPGMA method was used for the determination of phylogenetic trees. The genetic and morphological dendrograms were compared using the Mantel test, which gave a correlation of r=-0.33. This study illustrates that the selected chestnut genotypes might be valuable genetic resources for future chestnut breeding programs.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

SERDAR, U., MERCAN, L., OKUMUS, A., SOYLU, A. (2014). MORPHOLOGICAL AND MOLECULAR COMPARISON OF SELECTED CHESTNUT (Castanea sativa Mill.) GENOTYPES FROM BLACK SEA REGION OF TURKEY. Anadolu Tarım Bilimleri Dergisi, Cilt: 29 - Sayı: 1, 54–62. https://ajindex.com/articles/135749

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (10)

  1. Ahmed, M., McNeil, D.L. 1996.
  2. Comparison of crossability, RAPD, SDS-PAGE and morphological markers in revealing genetic relationships within and among Lens species, Theor. Appl. Genet. 93:788-793.
  3. Ai, C.X., Zhang, L.Z., Wei, H.R., Jin, S.N., Yuan, K.J., Liu, Q.Z. 2007. Study on the Genetic Diversity of Natural Chestnut of Shandong by ISSR. Chin. J. Biotechnol. 23(4): 628-633.
  4. Aksoy, H.M., Serdar, Ü., Soylu, A. 2005. Kestane fidanlarında kansere (Cryphonectria parasitica (murrill) barr) karşı yapılan uygulamalar. OMÜ Zir. Fak. Der. 20(1): 24-29. Anonymous. 2008. http://faostat.fao.org/site/567/DesktopDefault.aspx
  5. Arslan, B., Okumus, A. 2006. Genetic and Geographic Polymorphism of Cultivated Tobaccos (Nicotiana tabacum) in Turkey. Russ. J. Genetics. 42(6): 667-671.
  6. Ayfer, M., Soylu, A., Celebioglu, G. 1977. Selection of chestnut cultivars (Castanea sativa Mill.) in Marmara Region. Proc. TUBITAK VI. Scientific Congress, Hort.Section. 84:123-132.
  7. Baykal, N., Tezcan, H, Soylu, A., Ufuk, S., Arslan, U., Yahyaoglu, M. 2000. Incidence of chestnut blight in Bursa Province and reactions of some Turkish chestnut cultivars against it. J. Turk. Phytopath. 29(1): 1-5. Bojović, S., Heizmann, P., Barbero, M. 2000. Fraxinus ornus l. sexual polymorphism and rapd markers. Genetika, 32: 1. Burnham, C.R., Rutter, P.A., French, D.W. 1986. Breeding blight-resistant chestnuts. Plant Breeding Rev. 4: 347- 397. Cross, R.J. 1996. Assessment of IBPGR morphological descriptors in determining pattern within crop germplasm collection. PhD Thesis, Lincoln University, Canterbury, N.Z. Ding, G., Li, X., Ding, X., Qian, L. 2009. Genetic diversity across natural populations of Dendrobium officinale, the endangered medicinal herb endemic to China, revealed by ISSR and RAPD markers. Russ. J. Genetics, 45(3): 327-334.
  8. Doyle, J.J., Doyle, J.L. 1990. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus, 12: 13-15.
  9. Erper, İ., Serdar, Ü., Karaca, G. 2004. Bazı kestane (Castanea sativa Mill.) genotiplerinin Cryphonectria parasitica (Murrill) Barr’ya duyarlılıklarının belirlenmesi. OMÜ. Zir. Fak. Der. 19(1): 46-49.
  10. Ertan, E., Seferoğlu, G., Dalkılıç, G.G., Tekintaş, F.E., Seferoğlu, S., Babaeren, F., Onal, M., Dalkılıç, Z. 2007. Selection of Chestnuts (Castanea sativa Mill.) Grown in Nazilli District, Turkey, Turk. J. Agric. For. 31: 115- 123. Fineschi, S., Taurchini, D., Villani, F., Vendramin, G.G. 2000. Chloroplast DNA polymorphism reveals little geographical structure in Castanea sativa Mill. (Fagacea