Dergiler / Anadolu Tarım Bilimleri Dergisi / 2020 / Cilt: 35 - Sayı: 1

Buğday (Triticum aestivum L.) ve arpada (Hordeum vulgare L.) tuzluluk stres yanıtı ile ilişkili WRKY transkripsiyon faktörlerinin belirlenmesi

Determining WRKY transcription factors related to salinity stress response in wheat (Triticum aestivum L.) and barley (Hordeum vulgare L.)

Sayfa
1–7
Yayın Tarihi
2020-02-14
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bu çalışma, Türkiye’de ekimi yapılan buğday ve arpa çeşitlerinde WRKY genleri ve tuz stresi yanıtı arasında bir ilişki sağlaması açısından öncül bir çalışma niteliğindedir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Tuzluluk, buğday (Triticum aestivum L.) ve arpa (Hordeum vulgare L.) için yıkıcı etkileri olan en yaygın stres faktörlerinden biridir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Lord ve Ramata tohumlarına iki NaCl konsantrasyonu (% 1.0 ve % 2.0) ile 10 gün boyunca tuz stresi uygulandı. % 2.0 NaCl uygulanan tohumlarda çimlenme gözlenmedi.
💡
Sonuç & Katkı:Bu çalışma, Türkiye’de ekimi yapılan buğday ve arpa çeşitlerinde WRKY genleri ve tuz stresi yanıtı arasında bir ilişki sağlaması açısından öncül bir çalışma niteliğindedir.
🔬Tür:Deneysel Tarla Denemesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Gene expression · WRKY · Salt stress

Özet

Tuzluluk, buğday (Triticum aestivum L.) ve arpa (Hordeum vulgare L.) için yıkıcı etkileri olan en yaygın stres faktörlerinden biridir. Bu çalışmada, WRKY transkripsiyon faktörleriyle ilişkili tuz stresi yanıtının gen ekspresyon analizi ile belirlenmesi amaçlandı. T. aestivum L. cvs. Esperia ve Bezozya ile H. vulgare L. cvs. Lord ve Ramata tohumlarına iki NaCl konsantrasyonu (% 1.0 ve % 2.0) ile 10 gün boyunca tuz stresi uygulandı. % 2.0 NaCl uygulanan tohumlarda çimlenme gözlenmedi. Çalışılan hemen tüm WRKY genleri, kontrol gruplarına kıyasla % 1.0 NaCl stresine yanıt olarak nispeten dirençli ve hassas kültivarlarda sırasıyla yukarı ve aşağı yönde düzenlendi. İncelenen genler arasında, buğdayda nispeten dirençli Esperia kültivarında TaWRKY7, 40, 41, 53, 68, 72 ve 79 genlerinin ekspresyonu indüklendi. Benzer şekilde, arpada nispeten dirençli Lord’da 7 WRKY geni (HvWRKY6, 9, 24, 25, 33, 34, 42) indüklendi. WRKY gen ekspresyon profili açısından, buğdayda TaWRKY7 ve TaWRK72 ile arpada HvWRKY33 genlerinde anlamlı derecede artış saptanması nedeniyle bu genler abiyotik stres yanıtının daha fazla araştırılması için marker genler olarak kullanılabilir. Bu çalışma, Türkiye’de ekimi yapılan buğday ve arpa çeşitlerinde WRKY genleri ve tuz stresi yanıtı arasında bir ilişki sağlaması açısından öncül bir çalışma niteliğindedir.

Abstract

The salinity is one of most common stress factors with devastating effects for wheat (Triticum aestivum L.) and barley (Hordeum vulgare L). The aim of this study was to determine the salt stress response associated with WRKY transcription factors by gene expression analysis. Seeds of T. aestivum L. cvs. Esperia and Bezozya, and H. vulgare L. cvs. Lord and Ramata were subjected to salt stress for 10 days with two concentrations of NaCl (1.0 % and 2.0 %). No germination was observed in 2.0 % NaCl treated seeds. Nearly all the WRKY genes studied were upregulated and downregulated in response to 1.0 % NaCl stress in relatively resistant and sensitive cultivars in comparison to control sets, respectively. Among the screened genes, the expression of TaWRKY7, 40, 41, 53, 68, 72 and 79 genes were increased in relatively resistant Esperia cultivar in wheat. Similarly, 7 of WRKY genes (HvWRKY6, 9, 24, 25, 33, 34, 42) were upregulated in relatively resistant Lord cultivar in barley. In terms of WRKY gene expression profile, since TaWRKY7 and TaWRK72 in wheat and HvWRKY33 in barley increased significantly, these genes can be used as marker genes for further investigation of abiotic stress response. This study is a preliminary study in terms of providing an association between WRKY genes and salinity stress response of wheat and barley breeding cultivars in Turkey.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

TUFAN, F. (2020). Buğday (Triticum aestivum L.) ve arpada (Hordeum vulgare L.) tuzluluk stres yanıtı ile ilişkili WRKY transkripsiyon faktörlerinin belirlenmesi. Anadolu Tarım Bilimleri Dergisi, Cilt: 35 - Sayı: 1, 1–7. https://ajindex.com/articles/135656

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (7)

  1. Aktaş, Y.L. and Güven, A., 2005. Bitki savunma sistemlerinde hormonal sinyal moleküler ve çapraz iletişimleri. J. Arts Sci., 3:1-12.
  2. Almodares, A.M., Hadi, R., Kholdebarin, B., Samedani, B., Kharazian, A., 2014. The response of sweet sorghum cultivars to salt stress and accumulation of Na+, Cl- and K+ ions in relation to salinity. J. Environ. Biol., 35:733–739.
  3. Badridze, G., Weidner, A., Asch, F., 2009. Variation in salt tolerance within a Georgian wheat. Genet. Resour. Crop Evol., 56:1125–1130. DOI: 10.1007/s10722-009-9436-0.
  4. Bagdi, D.L., Shaw, B.P., Sahu, B.B.,Purohit, G.K., 2015. Real time PCR expression analysis of gene encoding p5cs enzyme and proline metabolism under NaCl salinity in rice. J. Environ. Biol., 36:955–961.
  5. Budak, H., Hussain, B., Khan, Z., Ozturk, N.Z. and Ullah, N., 2015. From genetics to functional genomics: improvement in drought signaling and tolerance in wheat. Front. Plant. Sci., 6:1012. DOI: 10.3389/fpls.2015.01012. Dawson I. K., Russell J., Powell W., Steffenson B., Thomas W. T. and Waugh R. 2015, Barley: a translational model for adaptation to climate change, New phytologist, 206, 913–931. DOI: 10.1111/nph.13266. Eulgem T., Rushton P. J., Robatzek S. and Somssich I. E., 2000. The WRKY superfamily of plant transcription factors. Trends Plant Sci., 5, 199–206. DOI: 10.1016/S1360-1385(00)01600-9.
  6. Forster B. P., Ellis R. P., Thomas W. T. B., Newton A. C., Tuberosa R., This D. et al., 2000. The development and application of molecular markers for abiotic stress tolerance in barley, J. Exp. Bot., 51, 19–27. DOI: 10.1093/jexbot/51.342.19. Harlan, J. R., and Zohary, D., 1966. Distribution of wild wheats and barley. Science, 153 (3740), 1074–1080. DOI: 10.1126/science.153.3740.1074. Hu, Y. and Schmidhalter, U., 2005. Drought and salinity: A comparison of their effects on mineral nutrition of plants. J. Plant Nutr. Soil Sci., 168:541– 549. DOI: 10.1002/jpln.200420516. Imadi, S.R,, Kazi, A.G., Ahanger, M.A., Gucel, S., Ahmad, P., 2015. Plant transcriptomics and responses to environmental stress: an overview. J. Genet., 94:525–537. DOI: 10.1007/s12041-015- 0545-6.
  7. Jain, R., Singh, S.P., Singh, A., Singh, S., Tripathi, P., Chandra, A. et al., 2016. Study on physiobiochemical attributes and metallothionein gene expression affected by chromium (VI) in sugarcane (Saccharum spp. hybrid). J. Environ. Biol., 37:375– 382. Livak, K. J., and Schmittgen, T. D., 2001. Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2