SavedAdd your journal

Journals / Afyon Kocatepe Üniversitesi Fen ve Mühendislik Bilimleri Dergisi / 2012 / Cilt: 12 Sayı: 1

DNA Barcodes in Plants

Bitkilerde DNA Barkotları (011007) (53-57)

Ertuğrul FİLİZ
İbrahim KOÇ
Pages
53–57
Publication Date
2012-04-01
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

Bu çalışmada, bilim dünyasındaki en yeni bitki barkot çalışmaları ve yönelimleri araştırılmıştır. © Afyon Kocatepe Üniversitesi DNA Barcodes in Plants

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:“DNA barkot” DNA dizisi temelli bir sistem olup bir veya birkaç lokus kullanılarak türlerin tanımlanmasını sağlar.
📊
Key Findings & Data:Bitkilerde, mitokondriyal genlerin nükleotid değişim oranları düşük olduğundan bitki barkodu olarak uygun değillerdir.
💡
Conclusion & Impact:Bu çalışmada, bilim dünyasındaki en yeni bitki barkot çalışmaları ve yönelimleri araştırılmıştır. © Afyon Kocatepe Üniversitesi DNA Barcodes in Plants
🔬Design:Research Article
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:DNA barkot · Bitki · Plastid

Özet

“DNA barkot” DNA dizisi temelli bir sistem olup bir veya birkaç lokus kullanılarak türlerin tanımlanmasını sağlar. Yani türlerin tanımlanmasında DNA’daki standart bir bölgenin dizilenmesini gerektirmektedir. Hayvanlar aleminde, mitokondriyal sitokrom c oksidaz geni evrensel barkodu olarak kullanılırken bitki barkotları için hangi bölge veya bölgelerin kullanılacağı konusunda bir uzlaşma bulunmamaktadır. Bitkilerde, mitokondriyal genlerin nükleotid değişim oranları düşük olduğundan bitki barkodu olarak uygun değillerdir. Günümüzde, Yaşam Barkot Konsorsiyumu’na (CBOL) bağlı farklı bitki çalışma grupları çekirdek ve plastid genomundaki farklı barkot bölge adaylarını test etmektedirler. Bu test edilen bölgelerin çoğu plastid genom bölgeleridir ki örneğin kodlama yapan bölgelerden matK, rbcL, rpoB, rpoC1, kodlama yapmayan bölgelerden atpF–atpH, trnH–psbA ve psbK–psbI bölgeleridir. Bununla birlikte, çekirdek gen bölgelerinden Transkripsiyonu Yapılan İç Ara Bölgeler (ITS1 ve ITS2) yaygın olarak kullanılmaktadır. Bu çalışmada, bilim dünyasındaki en yeni bitki barkot çalışmaları ve yönelimleri araştırılmıştır. © Afyon Kocatepe Üniversitesi DNA Barcodes in Plants

🔖

Cite This Article

FİLİZ, E., KOÇ, İ. (2012). DNA Barcodes in Plants. Afyon Kocatepe Üniversitesi Fen ve Mühendislik Bilimleri Dergisi, Cilt: 12 Sayı: 1, 53–57. https://ajindex.com/articles/920968

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (9)

  1. Arca, M., Hinsinger, D.D., Cruaud, C., Tillier, A., Bousquet, J. and Frascaria-Lacoste, N., 2012. Deciduous Trees and the Application of Universal DNA Barcodes: A Case Study on the Circumpolar Fraxinus. PLoS ONE, 7(3): e34089. doi:10.1371/journal.pone.0034089. CBOL Plant Working Group, 2009. A DNA barcode for land plants. PNAS, 31, 12794–12797.
  2. Chase, M.W., Salamin, N., Wilkinson, M., Dunwell, J.M., Kesanakurthi, R.P., Haidar, N. and Savolainen, V., 2005. Land plants and DNA barcodes: short-term and long-term goals. Philos. Trans. R. Soc. B Biol. Sci., 360, 1889–1895.
  3. Chen, S., Yao, H., Han, J., Liu, C., Song, J. et al., 2010. Validation of the ITS2 region as a novel DNA barcode for identifying medicinal plant species. PLoS ONE, 5, e8613 Dasmahapatra, K.K. and Mallet, J., 2006. DNA barcodes: recent successes and future prospects. Heredity, 97, 254– 255. Fazekas, A.J., Burgess, K.S., Kesenakurti, P.R., Graham, S.W., Newmaster, S.G. et al., 2008. Multiple Multilocus DNA Barcodes from the Plastid Genome Discriminate Plant Species Equally Well. Multiple Multilocus DNA Barcodes from the Plastid Genome Discriminate Plant Species Equally doi:10.1371/journal.pone.0002802 ONE, 3(7), e2802. Ford, C.S., Ayres, K.L., Toomey, N., Haider, N., Van Alphen Stahl, J. et al., 2009. Selection of candidate coding DNA barcoding regions for use on land plants. Bot J Linn Soc, 159, 1–11.
  4. Gonzalez, M.A., Baraloto, C., Engel, J., Mori, S.A., Petronelli, P. et al., 2009. Identification of Amazonian Trees with DNA Barcodes. doi:10.1371/journal.pone.0007483. ONE, 4(10), e7483. Hawksworth, D.L. and Kalin-Arroyo, M.T., 1995. Magnitude and distribution of biodiversity. In global biodiversity assessment. Edited by V.H. Heywood. Cambridge University Press, 107–191.
  5. Hebert, P.D.N., Cywinska, A., Ball, S.L. and DeWaard, J.R., 2003. Biological identifications through DNA barcodes. Proc R Soc B, 270, 313–321.
  6. Hebert, P.D.N. and Gregory, T.R., 2005. The Promise of DNA Barcoding for Taxonomy. Syst. Biol., 54, 852–859.
  7. Hilu, K.W. and Liang, H. 1997. The matK gene: sequence variation and application in plant systematics. American Journal of Botany, 84, 830–839.
  8. Hollingsworth, P.M., Graham, S.W. and Little, D.P., 2011. Choosing and Using a Plant DNA Barcode. PLoS ONE, 6(5), e19254. doi:10.1371/journal.pone.0019254. Kress, W.J., Wurdack, K.J., Zimmer, E.A., Weigt, L.A. and Janzen, D.H., 2005. Use of DNA barcodes to identify flowering plants. Proc Natl Acad Sci USA, 102, 8369–8374.
  9. Kress, W.J. and Er