Journals / Afyon Kocatepe Üniversitesi Fen ve Mühendislik Bilimleri Dergisi / 2022 / Cilt: 22 - Sayı: 6

Optimization of PCR-RFLP Method for Genotyping of GHSR rs2232165 Gene Polymorphism and Determination of Allele Frequency in Turkish men

GHSR rs2232165 Gen Polimorfizminin Genotiplendirilmesi için PCR-RFLP Yönteminin Optimizasyonu ve Türk Erkeklerinde Alel Frekansının Belirlenmesi

Pages
1245–1255
Publication Date
2022-12-28
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

In this study, the first data on the allele frequency of GHSR rs2232165 polymorphism, which plays a role in the etiology of obesity, which is as important as alcohol use disorder in the current era, were collected in Turkish males.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Alcohol addiction, which is one of the crucial problems of the current era, arises with the effects of genetic, environmental, culturel, developmental and neurobiological factors.
📊
Key Findings & Data:Therefore, in this study the relationship between rs2232165 polymorphism in GHSR gene encoding ghrelin receptor and alcohol use disorder in Turkish men with alcohol use problem.
💡
Conclusion & Impact:In this study, the first data on the allele frequency of GHSR rs2232165 polymorphism, which plays a role in the etiology of obesity, which is as important as alcohol use disorder in the current era, were collected in Turkish males.
🔬Design:Research Article
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:Alkol Kullanım Bozukluğu · Grelin · Gen Polimorfizmi

Abstract

Alcohol addiction, which is one of the crucial problems of the current era, arises with the effects of genetic, environmental, culturel, developmental and neurobiological factors. In recent years, the discovery that the neurobiology of eating behavior and the neurobiology of craving for addictive substances have similar characteristics has prompted researchers to investigate the relationship between alcohol addiction and hormones important in food intake such as ghrelin. Even though the importance of the ghrelin system in alcohol use disorder and alcohol craving has been stated by existing studies , more studies are needed to enlighten the biological mechanism of this relationship. Therefore, in this study the relationship between rs2232165 polymorphism in GHSR gene encoding ghrelin receptor and alcohol use disorder in Turkish men with alcohol use problem. Seventy-two individuals diagnosed with alcohol use disorder and 82 healthy men without any substance addiction were included in this study. The GHSR rs2232165 gene polymorphism was genotyped by PCR-RFLP which was optimized for the first time in this study. The allele frequency of the GHSR rs2232165 gene polymorphism was determined in the group with alcohol use problem (n:144) as 0,99 (n:142) for C allele and 0,01 (n:2) for T allele. The frequency of the C allele was 0,98 (n:161) and T allele was 0,02 (n:3) in the healthy group. There was no statistically significant difference between two groups in terms of T allele frequency. Since gene polymorphisms are not affected by environmental factors, individuals in two groups were combined (n=154) in order to determine minor allele frequency (MAF) in Turkish males, and the MAF value of GHSR rs2232165 polymorphism in Turkish males was determined as 0,02. In this study, the first data on the allele frequency of GHSR rs2232165 polymorphism, which plays a role in the etiology of obesity, which is as important as alcohol use disorder in the current era, were collected in Turkish males.

Özet

Çağımızın ciddi sorunlardan biri olan alkol bağımlılığı, genetik, çevresel, kültürel, gelişimsel ve nörobiyolojik faktörlerin etkisiyle ortaya çıkmaktadır. Son yıllarda yeme davranışı nörobiyolojisi ile bağımlılık yapan maddelere aşerme davranışının nörobiyolojisinin benzer özelliklere sahip olduğunun keşfedilmesi araştırmacıları, alkol bağımlılığı ile grelin gibi besin alımında önemli olan hormonlar arasındaki ilişkiyi araştırmaya sevk etmiştir. Alkol kullanım bozukluğunda ve alkole aşermede grelin sisteminin önemi mevcut çalışmalar tarafından ortaya konulmasına karşın bu ilişkinin biyolojik mekanizmasının aydınlatılması için daha çok çalışmaya ihtiyaç vardır. Bu nedenle, bu çalışmada, alkol kullanım sorunu olan Türk erkeklerinde, grelin reseptörünü kodlayan GHSR genindeki rs2232165 polimorfizminin alkol kullanım sorunu ile ilişkisi araştırılmıştır. Çalışmaya alkol kullanım bozukluğu tanısı konmuş 72 erkek birey ile herhangi bir madde bağımlılığı olmayan 82 sağlıklı erkek dahil edilmiştir. GHSR rs2232165 gen polimorfizmi, ilk defa bu çalışmada optimize edilen PCR-RFLP yöntemi ile genotiplendirilmiştir. GHSR rs2232165 polimorfizmi için alel frekansları alkol kullanım sorunu olan grupta (n:144); C aleli için 0,99 (n:142), T aleli için 0,01 (n:2) olarak hesaplanmıştır. Karşılaştırma grubunda ise (n:164), C aleli frekansı 0,98 (n:161), T aleli frekansı 0,02 (n:3) olarak belirlenmiştir. İki grup arasında, T alel frekansı açısından istatistiksel olarak anlamlı bir fark bulunmamıştır (p>0,05). Gen polimorfizmleri, çevresel faktörlerden etkilenmediği için Türk erkeklerindeki minör alel frekansını (MAF) belirlemek için iki gruptaki bireyler birleştirilmiş (n=154) ve Türk erkeklerinde GHSR rs2232165 polimorfizminin MAF değeri 0,02 olarak belirlenmiştir. Bu çalışmada, çağımızda alkol kullanım bozukluğu kadar önemli olan obezite etiyolojisinde de rol oynayan GHSR rs2232165 polimorfizminin Türk erkeklerinde alel frekansı ile ilgili ilk veriler toplanmıştır.

🔖

Cite This Article

KOTİLOĞLU, S. Ö., AKYÜZLÜ, D. K., DÜZGÜN, G., DANIŞMAN, M., ERTAN, E. A., İLHAN, İ. Ö. (2022). Optimization of PCR-RFLP Method for Genotyping of GHSR rs2232165 Gene Polymorphism and Determination of Allele Frequency in Turkish men. Afyon Kocatepe Üniversitesi Fen ve Mühendislik Bilimleri Dergisi, Cilt: 22 - Sayı: 6, 1245–1255. https://ajindex.com/articles/874190

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (8)

  1. Ando, T., Komaki, G., Naruo, T., Okabe, K., Takii, M., Kawai, K., Konjiki, F., Takei, M., Oka, T., Takeuchi, K., Masuda, A., Ozaki, N., Suematsu, H., Denda, K., Kurokawa, N., Itakura, K., Yamaguchi C., Kono, M., Suzuki, T., Nakai, Y., Nishizono‐Maher, A., Koide, M., Murakami, K., Nagamine, K., Tomita, Y., Ookuma, K., Tomita, K., Tonai, E., Ooshima, A., et al., 2006. Possible role of preproghrelin gene polymorphisms in susceptibility to bulimia nervosa. American Journal Medical Genetics Part B Neuropsychiatric Genetics, 141, 929-934.
  2. Ando, T., Ichimaru, Y., Konjiki, F., Shoji, M., Komaki, G., 2007. Variations in the preproghrelin gene correlate with higher body mass index, fat mass, and body dissatisfaction in young Japanese women. The American Journal of Clinical Nutrition, 86, 25-32.
  3. Ariyasu, H., Takaya, K., Tagami, T., Ogawa, Y., Hosoda, K., Akamizu, T., Suda, M., Koh, T., Natsui, K., Toyooka, S., Shirakami, G., Usui, T., Shimatsu, A., Doi, K., Hosoda, H., Kojima, M., Kangawa, K., Nakao, K., 2001. Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism, 86, 4753-4758.
  4. Aydin, S., 2006. Increased grelin levels in epileptic patients. Seizure, 15, 658. Aydin, S., 2007. A comparison of grelin, glucose, alpha-amylase and protein levels in saliva from diabetics. Journal of Biochemistry and Molecular Biology, 40, 29-35.
  5. Aydın, S., Özkan, Y., Çaylak, E., Aydın, S., 2006. Ghrelin and its biochemical functions. Türkiye Klinikleri, Journal of Medical Sciences, 26, 272-283.
  6. Baessler, A., Hasinoff, M.J., Fischer, M., Reinhard, W., Sonnenberg, G.E., Olivier, M., Erdmann, J., Schunkert, H., Doering, A., Jacob, H.J., Comuzzie, A.G., Kissebah, A.H., Kwitek, A.E., 2005. Genetic linkage and association of the growth hormone secretagogue receptor (ghrelin receptor) gene in human obesity. Diabetes, 54, 259-267.
  7. Coşkun, B., Çakmak, D., 2005. Alkol ve madde bağımlılarının grup psikoterapisinde psikodramanın kullanılması. Bağımlılık Dergisi, 6, 103-110. D’Addario, C., Shchetynsky, K., Pucci, M., Cifani, C., Gunnar, A., Vukojevic, V., Padyukov, L., Terenius, L., 2017. Genetic variation and epigenetic modification of the prodynorphin gene in peripheral blood cellsin alcoholism. Progress in Neuro-Psychopharmacology and Biological Psychiatry, 76, 195-203.Gelder, M., Gath, D., Mayou, R., Cowen, P., 1995, The abuse of alcohol and drugs. Oxford Textbook of Psychiatry, Gelder M, Gath D, Mayou R, Cowen P (ed.) Oxford University Press, Oxford, 438-461.
  8. Emeç, H., Gülay, E., 2008. Alkol tüketimi v