Journals / Gazi Üniversitesi Mühendislik Mimarlık Fakültesi Dergisi / 2023 / Cilt: 38 - Sayı: 2

Lösemi hastalığının temel türlerinden ALL ve KML malignitelerinin grafik sinir ağları ve bulanık mantık algoritması ile sınıflandırılması

Pages
707–720
Publication Date
2022-10-07
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

Böylece KML ve ALL malignitelerinin sınıflandırılmasında %80’lik bir başarı düzeyi yakalanmıştır.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Beyaz kan hücresi kanseri olan lösemi, yaşam kalitesini düşüren ve ilerleyen aşamalarda ölüme sebep olabilen maliyeti yüksek bir malignitedir.
📊
Key Findings & Data:Farklı yaş gruplarında görülebilen bu hastalığın erken ve doğru teşhisinin sağlanması tedavi sürecini etkilemekte ve hastalığın ilerlemesini engellemektedir.
💡
Conclusion & Impact:Böylece KML ve ALL malignitelerinin sınıflandırılmasında %80’lik bir başarı düzeyi yakalanmıştır.
🔬Design:Modeling & Simulation
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:DNA dizilimleri · Entropi tabanlı/geleneksel haritalama teknikleri · Sayısal sinyal işleme metotları

Özet

Beyaz kan hücresi kanseri olan lösemi, yaşam kalitesini düşüren ve ilerleyen aşamalarda ölüme sebep olabilen maliyeti yüksek bir malignitedir. Farklı yaş gruplarında görülebilen bu hastalığın erken ve doğru teşhisinin sağlanması tedavi sürecini etkilemekte ve hastalığın ilerlemesini engellemektedir. Bu çalışmada löseminin temel türlerinden olan ALL ve KML malignitelerinin sınıflandırılması amaçlanmıştır. Genetik temelli maligniteler olan bu türlerin ayırt edilmesinde DNA’da bir mutasyon sonucunda beliren BCR-ABL geni analiz edilmiştir. Tıp dünyasında BCR-ABL geni üzerinden mevcut türlerin ayırt edilmesi hususunda PCR tekniği kullanılarak değerlendirmeler yapılabilmektedir. Teşhis ve tedavi sürecindeki maliyetin ve zamanın indirgenmesi amacıyla disiplinlerarası çalışmalar da mevcuttur . İki aşamadan oluşan bu çalışmanın ilk aşamasında farklı nükleotit uzunluklarına sahip ALL ve KML DNA dizilimlerinin spektral yoğunluk bilgisi sinyal işleme teknikleri kullanılarak spektogramlara yansıtılmıştır. Ardından CNN ve GNN teknolojilerinin hibrit yaklaşımı olan DGCNN teknolojisi ile ALL ve KML malignitelerine ait spektogramlar sınıflandırılmıştır. Ancak nükleotitlerin farklı uzunluklarda olmasından dolayı spektogramlar üzerinde net ifadeler elde edilememiştir. Çalışmanın ikinci aşamasında farklı uzunluklara sahip DNA dizilimleri, kodon dağılımlarının esas alındığı entropi temelli haritalama tekniği ile sayısallaştırılmıştır. Sayısallaştırılan bu dizilimler üzerinden çıkarılan istatiktiksel ve yapısal özellikler uyarlanabilir bulanık mantık algoritması ile sınıflandırılarak nükleotit uzunluğundan bağımsız bir çalışma gerçekleştirilmiştir. Böylece KML ve ALL malignitelerinin sınıflandırılmasında %80’lik bir başarı düzeyi yakalanmıştır.

🔖

Cite This Article

AKALIN, F., YUMUŞAK, N. (2022). Lösemi hastalığının temel türlerinden ALL ve KML malignitelerinin grafik sinir ağları ve bulanık mantık algoritması ile sınıflandırılması. Gazi Üniversitesi Mühendislik Mimarlık Fakültesi Dergisi, Cilt: 38 - Sayı: 2, 707–720. https://ajindex.com/articles/667482

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (3)

  1. Aydın G., Quercetinin KML kök hücreleri üzerine sitotoksik etkilerinin moleküler düzeyde incelenmesi, Yüksek Lisans Tezi, Erciyes Üniversitesi,
  2. Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Kayseri, 2017 [2] https://www.healthline.com/health/leukemia#treatment. [3] Arslan S, KML ve ALL tanılı hastalarada BCR / ABL füzyon geni mutasyonlarının taranması,Eskişehir Osmangazi Üniversitesi,
  3. Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Eskişehir, 2014. [4] Kitamura H. et al., A new highly sensitive real-time quantitative-PCR method for detection of BCR-ABL1 to monitor minimal residual disease in chronic myeloid leukemia after discontinuation of imatinib, PLoS One, 14(3), 1–13, 2019, doi: 10.1371/journal.pone.0207170. [5] https://medlineplus.gov/lab-tests/bcr-abl-genetic-test/. [6] Paiva A. S. et al., Detection of the BCR-ABL Gene By the Real-Time PCR Method in Patients with Chronic Myeloid Leukemia in Rio Grande Do Norte, Brazil, Blood, 132(1), pp. 5432–5432, 2018, doi: 10.1182/blood-2018-99-118853. [7] Smitalova D., Dvorakova D., Racil Z., and Romzova M., Digital PCR can provide improved BCR-ABL1 detection in chronic myeloid leukemia patients in deep molecular response and sensitivity of standard quantitative methods using EAC assays, Practical Laboratory Medicine, 25, 2021, doi: 10.1016/j.plabm.2021.e00210. [8] Uzoma I. and Nna E., Detectıon and quantıtatıon of bcr-abl1 fusıon gene ın salıva of chronıc myeloıd leukaemıc patıents ın nıgerıa, Proceedings - 2017 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine, BIBM 2017, 2017. [9] Yang R., Paparini A., Monis P., and Ryan U., Comparison of next-generation droplet digital PCR (ddPCR) with quantitative PCR (qPCR) for enumeration of Cryptosporidium oocysts in faecal samples, International Journal for Parasitology., 44(14),1105–1113, 2014, doi: 10.1016/j.ijpara.2014.08.004. [10] Maier J., Lange T., Cross M., Wildenberger K., Niederwieser D., and Franke G. N., Optimized Digital Droplet PCR for BCR-ABL, Journal of Molecular Diagnostics,21(1),27–37, 2019, doi: 10.1016/j.jmoldx.2018.08.012. [11] Jennings L. J., George D., Czech J., Yu M., and Joseph L., Detection and quantification of BCR-ABL1 fusion transcripts by droplet digital PCR, Journal of Molecular Diagnostics,16(2),174–179, 2014, doi: 10.1016/j.jmoldx.2013.10.007. [12] Khodaei A., Feizi-Derakhshi M. R., and Mozaffari-Tazehkand B., A pattern recognition model to distinguish cancerous DNA sequences via signal processing methods, Soft Computing, 24(21),16315–16334, 2020, doi: 10.10