Journals / Harran Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi / 2011 / Cilt: 15 - Sayı: 4

DETERMINATION OF GENETIC VARIATION IN THE POPULATION OF SCLEROTINIA SCLEROTIORUM IN GREENHOUSE GROWN LETTUCE BY MICROSATELLITE MARKERS

ÖRTÜALTINDA YETİŞTİRİLEN MARULDA SCLEROTINIA SCLEROTIORUM POPULASYONUNDA GENETİK ÇEŞİTLİLİĞİN MİKROSATELİT MARKÖRLER İLE BELİRLENMESİ

Pages
39–44
Publication Date
2014-02-21
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

A high level of polymorphism was found in lettuce populations originating from different locations but also within populations from the same greenhouse.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Sclerotinia sclerotiorum is one of the most destructive pathogens of vegetable crops.
📊
Key Findings & Data:One of them ((TACA)10) did not showpolymorphism among the isolates.
💡
Conclusion & Impact:A high level of polymorphism was found in lettuce populations originating from different locations but also within populations from the same greenhouse.
🔬Design:Research Article
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:Sclerotinia sclerotiorum · marul · mikrosatelit markörler

Abstract

Sclerotinia sclerotiorum is one of the most destructive pathogens of vegetable crops. In Çanakkale, lettuce is cultivated under greenhouses between November until end of March.Afterwards, lettuce is replaced with cucumber. Both are important hosts of the pathogen and infected plants can be found throughout the year. Here, we tested if polymorphism exists in theisolates collected from the greenhouses. Eighteen isolates were employed in the research. Eight microsatellite primer sets were used for this purpose. One of them ((TACA)10) did not showpolymorphism among the isolates. We found 2 alleles at (GT)8, 3 alleles at (GA)9, (TATG)9, and (GT)10 loci. Five loci were observed at (CATA)25 and (TTA)9 alleles. The most obviouspolymorphism existed at (AGAT)14(AAGC)4 loci revealing 6 alleles. A high level of polymorphism was found in lettuce populations originating from different locations but also within populations from the same greenhouse.

Özet

Sclerotinia sclerotiorum sebze yetiştiriciliğinde en yıkıcı patojenlerden biridir. Çanakkale’de marul Kasım’dan Mart ayına kadar örtü altında yetiştirilmekte, bu dönemler dışındaki zamanlarda ise hıyar tarımı yapılmaktadır. Her iki bitki türü de hastalık etmeninden etkilenmekte ve yıl boyunca hastalık simptomlarını görmek mümkün olmaktadır. Bu çalışmanın amacı örtüaltında yetiştiriciliği yapılan marul seralarında, S. sclerotiorum’un hastalık simptomlarını gösteren bitkilerden etmeni izole etmek ve izolatlar arasında genetik çeşitliliği PCR yoluyla saptamaktır. Bu çalışmada 18 patojen izolatı, bu izolatlar arasında farklılığı saptamak için ise 8 mikrosatelit primeri kullanılmıştır. (TACA)10 primeri kullanıldığında tüm izolatlardan aynı büyüklükte PCR ürünü elde edilmiştir. (GT)8 primeri kullanıldığında popülasyonda 2 farklı büyüklükte, (GA)9, (TATG)9, ve (GT)10 locuslarında ise 3 farklı büyüklükte allel saptanmıştır. (CATA)25 ve (TTA)9 primerleri kullaınldığında 5’er allel saptanırken, (AGAT)14(AAGC)4 locusunda toplam 6 polimorfik banda rastlanmıştır. Marul populasyonunda yapılan bu çalışmada, izolatlar arasında yüksek oranda polimorfizm olduğu saptanmıştır.

🔖

Cite This Article

TURK, F. (2014). DETERMINATION OF GENETIC VARIATION IN THE POPULATION OF SCLEROTINIA SCLEROTIORUM IN GREENHOUSE GROWN LETTUCE BY MICROSATELLITE MARKERS. Harran Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi, Cilt: 15 - Sayı: 4, 39–44. https://ajindex.com/articles/423156

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (11)

  1. Atallah ZK, Larget B, Johnson DA. (2004) High genetic diversity, phenotypic uniformity outcrossing sclerotiorum in the Columbia basin of Washington State. Phytopathology 94:737-742. of in Sclerotinia Boland GC, Hall R. (1994) Index of plant hosts of Sclerotinia sclerotiorum. Can J Plant Pathol 2:93-108.
  2. Carpenter, M. A., Frampton, C. and Stewart, A. 1999. Genetic variation in New Zealand populations of the plant pathogen Sclerotinia sclerotiorum. N.Z. J. Crop Hortic. Sci. 27: 13-21.
  3. Cubeta, M.A. Cody, B. R. Kohli Y. And L. M. Kohn. 1997. Clonality in Sclerotinia sclerotiorum on infected cabbage in Eastern Phtopathology. 87: 1000-1004.
  4. Glass, N. L. and Kuldau, G. A. 1992. Mating type and vegetative incompatibility in filamentous ascomycetes. Ann. Rev. Phytopathol. 30: 201-224.
  5. Gaggiotti OE, Lange O, Rassmann K, Gliddon C. (1999) A comparison of two indirect average levels of gene flow using microsatellite data. Mol Ecol 8:1513- 1520. estimating Kohn LM, Carbone I, Anderson JB. (1990) Mycelial interactions in Sclerotinia sclerotiorum. Exp Mycol 14:255-267.
  6. Kull, L. S. and Pedersen, W. L. 2004. Mycelial compatibility grouping and virulence of Sclerotinia sclerotiorum. Plant Dis. 88: 325-332.
  7. Marciano, P., Dileena, P. and Magro, P. 1983. Oxalic acid, cell wall degrading enzymes and pH in pathogenesis and their significance in the virulence of two Sclerotinia sclerotiorum isolates on sunflower. Physiol. Plant Pathol. 22: 339-345.
  8. Malvarez, G., Carbone, I., Grunwald, N. J., Subbarao, K. V., Schafer, M. and Kohn, L. M. 2007. New populations of Sclerotinia sclerotiorum from lettuce in California and peas and lentils in Washington. Phytopathol. 97: 470-483.
  9. Mert-Türk, F., Ipek, M., Mermer, D., and Nicholson, P. (2007). Microsatellite and morphological markers reveal genetic variation within a population of Sclerotinia sclerotiorum from oilseed rape in the Çanakkale Province of Turkey. Journal of Phytopathology, 155, 182–187.
  10. Mert-Türk, F. ve D. Mermer, “Çanakkale Örtüaltı Sclerotinia Yaygınlığının ve Miselyal Uyum Gruplarının Saptanması”. MKU Ziraat Fakültesi Dergisi, 9(1-2), 1-8, (2004).
  11. Onaran, A., Yanar, Y. 2007. Tokat ve Amasya Yöresinde Görülen Beyaz Çürüklük Etmeni Sclerotinia Yaygınlığı ve Miselyal Uyumluluk Gruplarının Belirlenmesi Üzerine Araştırmalar. Koruma Kongresi Bildirileri. s.283. II. Bitki Purdy LH. (1979) Sclerotinia sclerotiorum - history, diseases and symptomatology, host range, geographic distribution, and impact. Phytopathology 69:875- 880. Sa