SavedAdd your journal

Journals / MANTAR DERGİSİ / 2018 / Cilt: 9 - Sayı: 2

Biodiversity Of Aspergillus Species Isolated From Sogutluk Forest Soil Of Edirne City

Edirne İli Söğütlük Ormanı Toprağından İzole Edilen Aspergillus Türlerinin Biyoçeşitliliği

Eda Gizem AYAN
Ahmet ASAN
Burhan SEN
Suzan OKTEN
Pages
126–141
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

These species are Aspergillus affinis (New record for Turkey), Aspergillus awamori, Aspergillus carbonarius, Aspergillus dimorphicus, Aspergillus europaeus (New record for Turkey), Aspergillus spelaeus (New record for Turkey) and Aspergillus fischeri.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:We aimed to isolation and identification of Aspergillus species in Edirne Sogutluk Forest soil by morphological-colonial and molecular methods in our study.
📊
Key Findings & Data:For this purpose, soil samples were taken by using Brown's Method in March, 2016 from mentioned forest soil. “Soil Dilution Method” was used for fungus isolation from soil.
💡
Conclusion & Impact:These species are Aspergillus affinis (New record for Turkey), Aspergillus awamori, Aspergillus carbonarius, Aspergillus dimorphicus, Aspergillus europaeus (New record for Turkey), Aspergillus spelaeus (New record for Turkey) and Aspergillus fischeri.
🔬Design:Research Article
📍Scope:2016 Verileri
⚙️Variables:Toprak · Aspergillus · Calmodulin geni

Abstract

We aimed to isolation and identification of Aspergillus species in Edirne Sogutluk Forest soil by morphological-colonial and molecular methods in our study. For this purpose, soil samples were taken by using Brown's Method in March, 2016 from mentioned forest soil. “Soil Dilution Method” was used for fungus isolation from soil. For the morphological studies, microscopic and macroscopic characters were examined after the operation of inoculating in CZ, CYA, CY20S, MEA media. For the molecular studies, DNA isolation, PCR operations that targeting Calmodulin gene region, purification of the PCR product, sequence analysis and phylogenetics analysis processes were performed respectively. Seven Aspergillus species were detected as a result of studies. These species are Aspergillus affinis (New record for Turkey), Aspergillus awamori, Aspergillus carbonarius, Aspergillus dimorphicus, Aspergillus europaeus (New record for Turkey), Aspergillus spelaeus (New record for Turkey) and Aspergillus fischeri.

Özet

Çalışmamızda, Edirne ili orman topraklarından izole edilen Aspergillus türlerinin morfolojik-koloniyal ve moleküler yöntemlerle teşhis edilmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla, Edirne Söğütlük Ormanından, 2016 yılı Mart ayında Brown’un metodu kullanılarak toprak örnekleri alınmıştır. Topraktan fungus izolasyonu için “Toprağı Sulandırma Metodu” kullanılmıştır. Morfolojik çalışmalar için CZ, CYA, CY20S, MEA besiyerlerine yapılan ekimlerden sonra, mikroskobik ve makroskobik karakterler incelenmiştir. Moleküler çalışmalar için ise sırasıyla DNA izolasyonu, calmodulin gen bölgesini hedefleyen PCR işlemleri, PCR ürününün saflaştırılması, dizi analizi ve filogenetik analiz aşamaları uygulanmıştır. Çalışmalar sonucunda 7 adet Aspergillus türü tespit edilmiştir. Bu türler, Aspergillus affinis (Türkiye için yeni kayıt), Aspergillus awamori, Aspergillus carbonarius, Aspergillus dimorphicus, Aspergillus europaeus (Türkiye için yeni kayıt), Aspergillus spelaeus (Türkiye için yeni kayıt) ve Aspergillus fischeri’dir.

🔖

Cite This Article

AYAN, E. G., ASAN, A., SEN, B., OKTEN, S. (2018). Biodiversity Of Aspergillus Species Isolated From Sogutluk Forest Soil Of Edirne City. MANTAR DERGİSİ, Cilt: 9 - Sayı: 2, 126–141. https://ajindex.com/articles/279263

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (17)

  1. Adametz, L. Untersuchungen uber die niederen Pilze der Acker - krume. Inaugural-Dissertation. Leipzig, 78 pp, 1886. (Bu makalenin orijinaline ulaşılamamış, bilgiler Tresner ve Ark., 1954 ve Kanaujia ve Ark., 1977’den alınmıştır). Al-Sheboul, Y. Ege Üniversitesi,
  2. Ziraat Fakültesi, Bahçe Bitkileri Bölümü meyve bahçelerindeki mikrofungus florası ile ilgili bir araştırma, YL Tezi, Ege Üniversitesi,
  3. Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Anabilim Dalı, Bornova-İzmir, 1990.
  4. Asan, A., Ekmekçi, S., The Determination of Penicillium and Aspergillus in Edirne Soils and Their Seasonal distribution. Turk. J. Biol. 18 (4): 291-303, 1994.
  5. Asan, A. Trakya Bölgesi mısır tarlaları mikrofungus florası üzerinde araştırmalar-1. Turk. J. Biol. 21: 89-101, 1997.
  6. Asan, A., Ekmekçi, S. Contribution to the colonial and morphological characteristics of Some Aspergillus species isolated from soil. J. Fac. Sci. Ege Univ. 25 (1): 121-139, 2002.
  7. Asan, A. Aspergillus, Penicillium and related species reported from Turkey. Mycotaxon. 89 (1): 155-157, 2004 (Son güncelleme tarihi: 10 Şubat, 2015).
  8. Asan, A., Ekmekçi, S. Topraktan izole edilen bazı Aspergillus türlerinin kolonial ve morfolojik özelliklerine katkılar. Orlab On-Line Mikrobiyol. Derg. 2(1): 12-15, 2004.
  9. Asan, A. Tıpta önemli mantarların filogenetik ve sistematiği. İnf. Derg. 21 (2): 21-31, 2007.
  10. Asan, A., Sarıca Ökten, S., Şen, B. Airborne and soilborne microfungi in the vicinity Hamitabat Thermic Power Plant in Kirklareli City (Turkey), their seasonal distributions and relations with climatological factors. Environ. Mon. Assessment. 164 (1-4): 221-231, 2010.
  11. Balajee, S. A., Houbraken, J., Verweij, P. E., Hong, S-B., Yaghuchi, T., Varga, J., Samson, R. A. Aspergillus species identification in the clinical setting. Stud. In Mycol. 59 (1): 39-46. 2007.
  12. Bıyık, H., Törün, B., Geroğlu, Y., Poyrazoğlu Çoban, E., Başbülbül, G. Preservation and molecular identification of Aspergillus and Penicilium species with ITS-PCR. Eur. J. Biotechnol. Biosci. 4 (11): 4-7, 2016.
  13. Bilgin, İ. Çiçekli köyü (Bornova) ve civarı toprakları mikrofungus florasının bitki süksesyonuna bağlı olarak incelenmesi. YL tezi. Ege Üniversitesi,
  14. Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Böl., İzmir, 1994.
  15. Boynukara, Z. Van Gölü çevresi topraklarının Aspergillus Mich Ex Fr. ve Penicillium Link ex Fr. türleri üzerine taksonomik ve ekolojik bir araştırma. Doktora Tezi, Yüzüncü Yıl Üniversitesi,
  16. Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Anabilim Dalı, Van, 1998.
  17. Brown, J. C. Soil fungi of som