Journals / Alatarım / 2014 / Cilt: 13 - Sayı: 2

Use of Cannonical Discriminant Analysis in Classification of Local Tomato Genetic Resources

Yerel Sofralık Domates Gen Kaynaklarının Sınıflandırılmasında 'Kanonik Ayırma Analizi' Yönteminin Kullanımı

Journal
Alatarım
Pages
23–32
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

This approach has potential use to determine the group of anovel unit according to differences and similarities

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Tomato is one of the Solanaceae species grown extensively in the world and in our country.
📊
Key Findings & Data:In this study, 61genotypes including 2 commercial varieties and 59 local genotypes collected from different regions ofTurkey were used.
💡
Conclusion & Impact:This approach has potential use to determine the group of anovel unit according to differences and similarities
🔬Design:Research Article
📍Scope:2012 Verileri
⚙️Variables:Domain Parameters

Abstract

Tomato is one of the Solanaceae species grown extensively in the world and in our country. Localvarieties have always been of interest as gene sources for tomato breeding studies. In this study, 61genotypes including 2 commercial varieties and 59 local genotypes collected from different regions ofTurkey were used. The local genotypes maintained in the gene bank were grown in field conditions inEskişehir and Bilecik during 2012 summer period. Morphological variations among genotypes weredetermined at both locations and the genotypes that increase variation were identified. Temperatureand wavelength differences between locations affected variation and therefore, was effective in'genotype x location' interactions. Canonical Discriminant Analysis was used to determinesimilarities and differences in terms of quantitative traits in determinate and indeterminate tomatogenotypes grown in Eskişehir and Bilecik. This approach has potential use to determine the group of anovel unit according to differences and similarities

Özet

Tüm dünyada ve ülkemizde, Solanaceae familyası içerisinde yetiştiriciliği en fazla yapılan sebze türüdomatestir. Domatesle ilgili yapılan ıslah çalışmalarında kullanılabilecek farklı gen kaynaklarınınbelirlenmesi önem taşımakta, bu nedenle yerel çeşitler her zaman ilginç bulunmaktadır. Bu çalışmada2 adedi ticari ve 59 adedi yerel çeşit olmak üzere toplamda 61 genotip kullanılmıştır. Türkiye'nindeğişik yörelerinden toplanarak gen bankasında muhafaza edilen yerel genotiplere ait bitkilerEskişehir ve Bilecik lokasyonlarında 2012 yılı yaz periyodunda açık arazide yetiştirilmiştir. Bumateryaller arasındaki varyasyon morfolojik olarak her iki lokasyonda da araştırılmış, varyasyonuyükselten genotipler ortaya konmuştur. Lokasyonlar arasındaki sıcaklık ve ışık dalga boyufarklılıklarının varyasyonu etkilediği ve dolayısıyla genotip x çevre interaksiyonunun etkili olduğugörülmüştür. Eskişehir ve Bilecik'teki arazilerde yetiştirilen yer ve sırık genotiplere ait ölçülebilirözellikler arasında benzerlik ve farklılıkların ortaya konulmasında Kanonik Ayırma Analizi(Setlerarası Korelasyon) yönteminden yararlanılmıştır. Bu yöntem, tanımlanacak yeni bir biriminhangi grupta yer alacağının bulunmasında farklı veya benzer özelliklerine göre yol gösterebilecekpotansiyelde bulunmuştur

🔖

Cite This Article

SÖNMEZ, K., ÖZDAMAR, K., ELLİALTIOĞLU, Ş. Ş. (2014). Use of Cannonical Discriminant Analysis in Classification of Local Tomato Genetic Resources. Alatarım, Cilt: 13 - Sayı: 2, 23–32. https://ajindex.com/articles/144995

References (12)

  1. Anonim, 2008. Web Sitesi: http//www.bilgipasaji.com/forum/jk1458/798116-kavun. html. Erişim Tarihi: 01.09.2013 Anonymous, 2001. Guidelines for the conduct of tests for distinctness, uniformity and stability tomato (Lycopersicon lycopersicum (L.) Karsten ex farw.) Geneva. Anonymous,, 2014. Web Sitesi: http://faostat.fao.org, Erişim Tarihi: 01.06.2014.
  2. Balkaya, A., Özbakır, M., Karaağaç, O., 2010. Karadeniz bölgesinden toplanan bal kabağı (Cucurbita karakterizasyonu ve varyasyonun değerlendirilmesi. Tarım Bilimleri Dergisi, 16: 17-25. Duch.) populasyonlarındaki meyve özelliklerinin Bliss, F.A., 1981. Utilization of vegetable germplasm. Hort Science, 16(2): 129-132.
  3. Bozokalfa, M.K., Eşiyok, D., 2010. Biber (Capsicum annuum L.) aksesyonlarında genetik çeşitliliğin agronomik özellikler ile belirlenmesi. Ege Üniv. Ziraat Fak. Derg., 47(2): 123-134.
  4. Crossa, J., Franco, J., 2004. Statistical methods for classifying genotypes. Euphytica 137: 19-37.
  5. Franco, J., Crossa, J., Villasenor, J, Taba, S., Eberhart, S.A., 1997. A sequential clustering strategy for classifying gene bank accessions. Crop Sci. 37: 1656-1662.
  6. Franco, J., Crossa, J., Villasenor, J., Taba, S., Eberhart, S.A., 1998. Classifying genetic resources by categorical and continuous variables. Crop Sci. 38: 1688-1696.
  7. Franco, J., Crossa, J., Villasenor, J., Castillo, A.,Taba, S., Eberhart, S.A., 1999. A two stages, three-way method for classifying genetic resources in multiple environments. Crop Sci 39: 259-267.
  8. Gonçalves, L.S.A., Rodrigues, R., Do Amaral, A.T., Karasawa, M., Sudré, C. P., 2009. Heirloom tomato gene bank: assessing genetic divergence based on morphological, agronomic and molecular data using a Ward-modified location model. Genet. Mol. Res. 8 (1): 364-374.
  9. Köse, T.M., 2008. Türkiye acurlarının (Cucumis melo var. flexuosus) genetik ve morfolojik karakterizasyonu. Yüksek Lisans Tezi, Çukurova Üniversitesi,
  10. Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, 80 s, Adana. Oguz, A., Gozen, V., Kabas, A., Zengin, S., Sonmez, K., Ellialtıoglu, S.S., 2014. Determination of relationship between some Turkish local tomato genotypes by using phenotypic characterization. Derim, 31(1):25-34.
  11. Olkin, I., Tate, R.F., 1961. Mutivariate correlation models with mixed discrete and continuous variables. Ann Math Stat 32: 448- 465. Ortiz, R., Crossa, J., Franco, J., Sevilla, R., Burgueno, J., 2008. Classification of Peruvian highland maize races using plant traits. Genet Resour Crop Evol 55:151-162.
  12. Özdamar, K