KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Aquaculture Studies / 2017 / Cilt: 17 Sayı: 1

Fırat ve Dicle Nehri’nde Yaşayan Barbus grypus (Heckel, 1843) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin mtDNA COI Gen Dizileri Kullanılarak Belirlenmesi

Determination of Genetic Diversity in Barbus grypus Heckel, 1843 Populations by mtDNA COI Gene Sequences

Arif PARMAKSIZ
Özlem ŞEKER
Nevin ASLAN
Ahmet OYMAK
Sayfa
103–107
Yayın Tarihi
2017-01-02
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

İki populasyondan toplam 36 örnek alınıp iki değişken bölge ve üç haplotip tespit edilmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Barbus grypus (Heckel, 1843) Fırat ve Dicle nehir sistemlerinde yaşayan ve ekonomik önemi olan endemik balık türlerden biridir.
📊
Temel Bulgular & Veri:İki populasyondan toplam 36 örnek alınıp iki değişken bölge ve üç haplotip tespit edilmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:Yapılan bu çalışmadaki sonuçlar B. grypus türü için ilk kez elde edilmiş verilerdir. mtDNA COI gen bölgesi için belirlenen haplotipler literatür açısından yeni sonuçlar olup, bu türün genetik çeşitliliği açısından önemli bir veri seti oluşturmuştur.
🔬Tür:Laboratuvar & Saha Deneyi
📍Kapsam:36 örnek
⚙️Değişkenler:mtDNA · Barbus grypus · Genetik Çeşitlilik

Özet

Barbus grypus (Heckel, 1843) Fırat ve Dicle nehir sistemlerinde yaşayan ve ekonomik önemi olan endemik balık türlerden biridir. Bu çalışmada, B. grypus populasyonlarında mitokondriyal DNA sitokrom c oksidaz altünite I (mtDNA COI) gen bölgesinin dizi analizlerine dayalı genetik çeşitlilik belirlenmiştir. İki populasyondan toplam 36 örnek alınıp iki değişken bölge ve üç haplotip tespit edilmiştir. Ortalama haplotip (h) ve nükleotit çeşitliliği (π) sırasıyla 0,246 ve 0,00045 olarak hesaplanmıştır. Nötralite testleri sonucunda tüm değerler istatistiksel olarak önemsiz bulunmuştur (p>0.10). Yapılan bu çalışmadaki sonuçlar B. grypus türü için ilk kez elde edilmiş verilerdir. mtDNA COI gen bölgesi için belirlenen haplotipler literatür açısından yeni sonuçlar olup, bu türün genetik çeşitliliği açısından önemli bir veri seti oluşturmuştur.

Abstract

Barbus grypus (Heckel, 1843) living in the Euphrates and Tigris river system, is one of the endemic fish species and has economic importance. In this study, genetic diversity of B. grypus populations was detected based on mitochondrial DNA cytochrome c oxidase subunit I (mtDNA COI) gene sequences. Three haplotypes and two polymorphic sites were detected in totally 36 individuals sampled from two populations. The average haplotype diversity (h) and nucleotide diversity (π) were calculated 0,246 and 0,00045 respectively. The result of Neutrality tests as statistically was insignificant (p>0.10). The results obtained by this study performed firstly for Barbus grypus species. Determined haplotypes for mtDNA COI gene region are new results for literature, in terms of genetic diversity of this species is an important data set.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

PARMAKSIZ, A., ŞEKER, Ö., ASLAN, N., OYMAK, A. (2017). Fırat ve Dicle Nehri’nde Yaşayan Barbus grypus (Heckel, 1843) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin mtDNA COI Gen Dizileri Kullanılarak Belirlenmesi. Aquaculture Studies, Cilt: 17 Sayı: 1, 103–107. https://ajindex.com/articles/982435

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (3)

  1. Ward, R. D.,Genetics in fisheries management,191–201,2000,420 Tajima, F,The amount of DNA polymorphism maintained in a finite population when the neutral mutation rate varies among sites,1457-1465,1996,143 Rozas, J., Sanchez-DelBarrio, J. C., Messeguer, X. ve Rozas, R,DnaSP DNA polymorphism analyses by the coalescent and other methods,2496–2497,2003,19 Ortega-Villaizan Romo, M., Suzuki, S., Nakajima, M. ve Taniguchi, N,Genetic evolution of inter individual relatedness for broodstock management of the rare species barfin flounder Verasper moseri using microsatellite DNA markers,33–39,2006,72 Olgunoğlu, M. P. ve Olgunoğlu, İ. A,Seasonal variation of trace elements in muscle tissues of two commercially valuable freshwater fish species (Silurus triostegus and Barbus grypus Heckel, 1843) from Atatürk Dam Lake (Turkey),6628-6632,2011,10 Olgunoğlu, İ. A., Olgunoglu, M. P. ve Artar, E,Seasonal changes in biochemical composition and meat yield of Shabut (Barbus grypus, Heckel 1843).,181-187,2010,10 Oymak, S. A., Doğan, N. ve Uysal, E,Age, growth and reproduction of the Shabut Barbus grypus (Cyprinidae) in Atatürk Dam Lake (Euphrates River), Turkey,145-152,2008,32 Nei, M.,Molecular evolutionary genetics,Columbia University Press,New York,1987
  2. Nei, M. ve Li, W. H,Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases,5269–5273,1979,76 Keskin, E. ve Atar, H. H,Türkiye'nin Akdeniz Kıyısındaki Mavi Yengeç (Callinectes sapidus) Populasyonları Arasındaki Genetik Farklılığın COI Gen Dizleri Kullanılarak Değerlendirilmesi,125-131,2012,6 Gökçınar, N. C,Şabot (Bıyıklı Balık) (Tor grypus H. 1843) Balığı Yavru Yemlerine Balık Unu Yerine Farklı Oranlarda Azolla (Azolla Sp.) İlavesinin büyüme Parametrelerine Etkisi,Ankara Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü,2010
  3. Fu, Y. X,Statistical tests of neutrality against population growth, hitchiking and background selection,915-925,1997,47 Düşükcan, M., Çalta, M. ve Eroğlu, M,Keban Baraj Gölü’nde yaşayan B. grypus Heckel, 1843’de otolit Biyometrisi-Balık Boyu İlişkisi (Elazığ, Türkiye).,21-29,2015,15 Doğu, Z., Aral, F. ve Şahinöz, E.,Atatürk Baraj Gölü’ndeki (Şanlıurfa) Şabut Balığının Bazı Spermatolojik ve Hematolojik Özelliklerinin Belirlenmesi,265- 277,2014,8 Darabi, A. R., Kashan, N., Fayazi, J., Aminafshar, M. ve Chamani, M,Investigation of Phylogenetic Relationship Among two Barbus species (Cyprinidae) Populations with Mitochondrial DNA Using Pcr-Sequencing,302-311,2015,4 Darabi, A. R., Kashan, N.,