SavedAdd your journal

Journals / Aquaculture Studies / 2017 / Cilt: 17 Sayı: 1

Determination of Genetic Diversity in Barbus grypus Heckel, 1843 Populations by mtDNA COI Gene Sequences

Fırat ve Dicle Nehri’nde Yaşayan Barbus grypus (Heckel, 1843) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin mtDNA COI Gen Dizileri Kullanılarak Belirlenmesi

Arif PARMAKSIZ
Özlem ŞEKER
Nevin ASLAN
Ahmet OYMAK
Pages
103–107
Publication Date
2017-01-02
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

Determined haplotypes for mtDNA COI gene region are new results for literature, in terms of genetic diversity of this species is an important data set.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Barbus grypus (Heckel, 1843) living in the Euphrates and Tigris river system, is one of the endemic fish species and has economic importance.
📊
Key Findings & Data:Three haplotypes and two polymorphic sites were detected in totally 36 individuals sampled from two populations.
💡
Conclusion & Impact:Determined haplotypes for mtDNA COI gene region are new results for literature, in terms of genetic diversity of this species is an important data set.
🔬Design:Research Article
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:mtDNA · Barbus grypus · Genetik Çeşitlilik

Abstract

Barbus grypus (Heckel, 1843) living in the Euphrates and Tigris river system, is one of the endemic fish species and has economic importance. In this study, genetic diversity of B. grypus populations was detected based on mitochondrial DNA cytochrome c oxidase subunit I (mtDNA COI) gene sequences. Three haplotypes and two polymorphic sites were detected in totally 36 individuals sampled from two populations. The average haplotype diversity (h) and nucleotide diversity (π) were calculated 0,246 and 0,00045 respectively. The result of Neutrality tests as statistically was insignificant (p>0.10). The results obtained by this study performed firstly for Barbus grypus species. Determined haplotypes for mtDNA COI gene region are new results for literature, in terms of genetic diversity of this species is an important data set.

Özet

Barbus grypus (Heckel, 1843) Fırat ve Dicle nehir sistemlerinde yaşayan ve ekonomik önemi olan endemik balık türlerden biridir. Bu çalışmada, B. grypus populasyonlarında mitokondriyal DNA sitokrom c oksidaz altünite I (mtDNA COI) gen bölgesinin dizi analizlerine dayalı genetik çeşitlilik belirlenmiştir. İki populasyondan toplam 36 örnek alınıp iki değişken bölge ve üç haplotip tespit edilmiştir. Ortalama haplotip (h) ve nükleotit çeşitliliği (π) sırasıyla 0,246 ve 0,00045 olarak hesaplanmıştır. Nötralite testleri sonucunda tüm değerler istatistiksel olarak önemsiz bulunmuştur (p>0.10). Yapılan bu çalışmadaki sonuçlar B. grypus türü için ilk kez elde edilmiş verilerdir. mtDNA COI gen bölgesi için belirlenen haplotipler literatür açısından yeni sonuçlar olup, bu türün genetik çeşitliliği açısından önemli bir veri seti oluşturmuştur.

🔖

Cite This Article

PARMAKSIZ, A., ŞEKER, Ö., ASLAN, N., OYMAK, A. (2017). Determination of Genetic Diversity in Barbus grypus Heckel, 1843 Populations by mtDNA COI Gene Sequences. Aquaculture Studies, Cilt: 17 Sayı: 1, 103–107. https://ajindex.com/articles/982435

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (3)

  1. Ward, R. D.,Genetics in fisheries management,191–201,2000,420 Tajima, F,The amount of DNA polymorphism maintained in a finite population when the neutral mutation rate varies among sites,1457-1465,1996,143 Rozas, J., Sanchez-DelBarrio, J. C., Messeguer, X. ve Rozas, R,DnaSP DNA polymorphism analyses by the coalescent and other methods,2496–2497,2003,19 Ortega-Villaizan Romo, M., Suzuki, S., Nakajima, M. ve Taniguchi, N,Genetic evolution of inter individual relatedness for broodstock management of the rare species barfin flounder Verasper moseri using microsatellite DNA markers,33–39,2006,72 Olgunoğlu, M. P. ve Olgunoğlu, İ. A,Seasonal variation of trace elements in muscle tissues of two commercially valuable freshwater fish species (Silurus triostegus and Barbus grypus Heckel, 1843) from Atatürk Dam Lake (Turkey),6628-6632,2011,10 Olgunoğlu, İ. A., Olgunoglu, M. P. ve Artar, E,Seasonal changes in biochemical composition and meat yield of Shabut (Barbus grypus, Heckel 1843).,181-187,2010,10 Oymak, S. A., Doğan, N. ve Uysal, E,Age, growth and reproduction of the Shabut Barbus grypus (Cyprinidae) in Atatürk Dam Lake (Euphrates River), Turkey,145-152,2008,32 Nei, M.,Molecular evolutionary genetics,Columbia University Press,New York,1987
  2. Nei, M. ve Li, W. H,Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases,5269–5273,1979,76 Keskin, E. ve Atar, H. H,Türkiye'nin Akdeniz Kıyısındaki Mavi Yengeç (Callinectes sapidus) Populasyonları Arasındaki Genetik Farklılığın COI Gen Dizleri Kullanılarak Değerlendirilmesi,125-131,2012,6 Gökçınar, N. C,Şabot (Bıyıklı Balık) (Tor grypus H. 1843) Balığı Yavru Yemlerine Balık Unu Yerine Farklı Oranlarda Azolla (Azolla Sp.) İlavesinin büyüme Parametrelerine Etkisi,Ankara Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü,2010
  3. Fu, Y. X,Statistical tests of neutrality against population growth, hitchiking and background selection,915-925,1997,47 Düşükcan, M., Çalta, M. ve Eroğlu, M,Keban Baraj Gölü’nde yaşayan B. grypus Heckel, 1843’de otolit Biyometrisi-Balık Boyu İlişkisi (Elazığ, Türkiye).,21-29,2015,15 Doğu, Z., Aral, F. ve Şahinöz, E.,Atatürk Baraj Gölü’ndeki (Şanlıurfa) Şabut Balığının Bazı Spermatolojik ve Hematolojik Özelliklerinin Belirlenmesi,265- 277,2014,8 Darabi, A. R., Kashan, N., Fayazi, J., Aminafshar, M. ve Chamani, M,Investigation of Phylogenetic Relationship Among two Barbus species (Cyprinidae) Populations with Mitochondrial DNA Using Pcr-Sequencing,302-311,2015,4 Darabi, A. R., Kashan, N.,