Dergiler / Hayvansal Üretim / 2023 / Cilt: 64 Sayı: 1

Anaerobik Gut Funguslarının Uzun Süreli Muhafazalarında Agarlı Besi Yerlerinin ve Ön Soğutma İşleminin Etkinliğinin Araştırılması

Effectiveness of Agar Nutrient and Precooling Process for Long Term Storage of Anaerobic Gut Fungi

Sayfa
17–26
Yayın Tarihi
2023-10-30
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bulgular: Caecomyces GMLF77 izolatı en yüksek yaşama oranını (%67) ksiloz içeren eğik agar içerisinde %15 gliserol varlığında doğrudan –196 °C’de (sıvı azot) muhafazaya alındığında göstermiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Amaç: Anaerobik gut funguslarının (AGF) kültüre alınması ve uzun süreli muhafazası özellikle aerobik mikroorganizmalar ve prokaryotik gut mikrobiyom ile karşılaştırıldıklarında göreceli olarak düşük verimlidir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Materyal ve Metot: Bu çalışmada farklı enerji kaynakları (buğday samanı, sükroz, dekstroz, ksiloz ve glikoz) kullanılarak dağ keçisi dışkısından izolasyonu ve saflaştırılması yapılan Caecomyces GMLF77 izolatı ile kültür koleksiyonundan temin edilen Orpinomyces GMLF18 izolatı 6 aylık süreyle eğik agar ve Roll tüp agar besi yerlerinde farklı sıcaklık kombinasyonlarında muhafaza edilmiş ve izolatların yaşama oranları analiz edilmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:Bulgular: Caecomyces GMLF77 izolatı en yüksek yaşama oranını (%67) ksiloz içeren eğik agar içerisinde %15 gliserol varlığında doğrudan –196 °C’de (sıvı azot) muhafazaya alındığında göstermiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Agar · anaerobik gut fungus · kriyoprotektan

Özet

Amaç: Anaerobik gut funguslarının (AGF) kültüre alınması ve uzun süreli muhafazası özellikle aerobik mikroorganizmalar ve prokaryotik gut mikrobiyom ile karşılaştırıldıklarında göreceli olarak düşük verimlidir. Anaerobik koşullar altında yapılan bu muhafaza işleminde hücre yapılarının düşük sıcaklıklarda uzun süreli korunması amacıyla gliserol, dimetil sülfoksit (DMSO), kan serumu, polivinilpirolidon (PVP) ve sorbitol gibi kriyoprotektanlar kullanılır. Materyal ve Metot: Bu çalışmada farklı enerji kaynakları (buğday samanı, sükroz, dekstroz, ksiloz ve glikoz) kullanılarak dağ keçisi dışkısından izolasyonu ve saflaştırılması yapılan Caecomyces GMLF77 izolatı ile kültür koleksiyonundan temin edilen Orpinomyces GMLF18 izolatı 6 aylık süreyle eğik agar ve Roll tüp agar besi yerlerinde farklı sıcaklık kombinasyonlarında muhafaza edilmiş ve izolatların yaşama oranları analiz edilmiştir. Bulgular: Caecomyces GMLF77 izolatı en yüksek yaşama oranını (%67) ksiloz içeren eğik agar içerisinde %15 gliserol varlığında doğrudan –196 °C’de (sıvı azot) muhafazaya alındığında göstermiştir. Orpinomyces GMLF18 ise glikoz içeren eğik agarlı besi yerinde, 6 aylık süreyle ön soğutmasız –196 °C’de muhafazasında %83 yaşama oranı göstermiştir. Diğer taraftan her iki izolat da kullanılan tüm besi yeri ve enerji kaynaklarında 4 °C’de ön soğutmaya tabi tutulduklarında yaşama şansı bulamamışlardır. Sonuç: Sonuçlar fungal izolatların sıvı azota aktarılmadan önce ön soğutma işlemine tabi tutulmalarının uzun süreli yaşama oranlarının artırılmasına önemli bir katkı sağlamadığını ortaya koymuştur.

Abstract

Objective: Culturing and long term storage of anaerobic gut fungi (AGF) is a more challenging process compared to aerobic and prokaryotic gut microbiome. For prolonged storage, carried out under anaerobic conditions, various cryoprotectans such as glycerol, dimethyl sulfoxide (DMSO), blood serum, sorbitol, and polyvinylpyrrolidone (PVP) are widely used to protect the cell from possible damages of freezing. Materials and Methods: Caecomyces GMLF77 was isolated and purified from wild goat feces using various energy sources (wheat straw, sucrose, dextrose, xylose and glucose), and Orpinomyces GMLF18 was obtained from the culture collection. Both isolates were stored in agar slant and Roll tube agar media at different temperature combinations until 6 months and later survival rates of the isolates were analyzed. Results: The isolate Caecomyces GMLF77 showed the highest survival rate (67%) when it was grown in the agar slant medium containing xylose as sole energy source and stored directly at –196 °C (liquid nitrogen) under the preservation of 15% glycerol. The isolate Orpinomyces GMLF18 showed survival rate of 83% after the six-month storage period when it was grown in agar slant medium containing glucose as sole energy source and kept at –196 °C without any precooling. No survival was observed for both isolates when they were treated at 4 °C, regardless of medium type and energy source used in the experiment. Conclusion: The results suggest that precooling of fungal isolates in low temperatures just before long-term storage in liquid nitrogen has no remarkable positive effect on their survival rates.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

TURGUT, T., TANIŞ, A. N., ÖZKÖSE, E., EKİNCİ, M. S. (2023). Anaerobik Gut Funguslarının Uzun Süreli Muhafazalarında Agarlı Besi Yerlerinin ve Ön Soğutma İşleminin Etkinliğinin Araştırılması. Hayvansal Üretim, Cilt: 64 Sayı: 1, 17–26. https://ajindex.com/articles/971804

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (11)

  1. Akyol I, Comlekcioglu U, Kar B, Ekinci M, Ozkose E. 2009. Cloning of a xylanase gene xyn2A from rumen fungus Neocallimastix sp. GMLF2 in Escherichia coli and its partial characterization. Biologia, 64(4), 664-670.
  2. Atanasova-Pancevska N, Kungulovski D. 2018. Fermentative activity of five strains of N. frontalis cultivated on a different substrates. Macedonian Journal of Animal Science, 8(1), 33-40.
  3. Brookman JL, Ozkose E, Rogers S, Trinci AP, Theodorou MK. 2000. Identification of spores in the polycentric anaerobic gut fungi which enhance their ability to survive. FEMS Microbiology Ecology, 31(3), 261-267.
  4. Campbell NC, Field J, MacKechnie K, Saxon RJ, Menéndez CR. 2020. Cryopreservation to sustain long term maintenance of algae and protozoa in the culture collection of algae and protozoa (CCAP). Cryobiology, 97, 279. Chen YC, Tsai SD, Cheng HL, 2007. Caecomyces sympodialis sp. nov., a new rumen fungus isolated from Bos indicus. Mycologia, 99(1): 125-130. Chetverikova EP. 2009. The problem of stability of organisms after cryopreservation (fungi as example). Biophysics, 54(5), 626-630.
  5. Clark CG, Stensvold CR. 2016. Blastocystis: isolation, xenic cultivation, and cryopreservation. Current Protocols in Microbiology, 43(1), 20A-1. Comlekcioglu U, Akyol I, Ozkose E, Kar B, Ekinci MS. 2008. Carboxymethylcellulase production by the anaerobic rumen fungus Neocallimastix sp. GMLF7. Annals of Microbiology, 58 (1) 115-119.
  6. Davies, D.R., Theodorou, M.K., Lawrence, M.I. and Trinci, A.P.J. 1993. Distrubution of anaerobic fungi in the digestive tract of cattle and their survival in faeces. J. Gen. Microbiol. 139: 1395-1400.
  7. Ekinci MS, Özköse E, Akyol İ. 2006. Effects of sequential sub-culturing on the survival and enzyme activity of Neocallimastix hurleyensis. Turkish Journal of Biology, 30(3), 157-162.
  8. Gaidhani KA, Harwalkar M, Bhambere D, Nirgude PS. 2015. Lyofilization / freeze drying – A review. World Journal of Pharmaceutical Research. 4(8), 516-543.
  9. Griffith GW, Ozkose E, Theodorou MK, Davies DR. 2009. Diversity of anaerobic fungal populations in cattle revealed by selective enrichment culture using different carbon sources. Fungal Ecology, 2:87-97.
  10. Henske JK, Gilmore SP, Knop D, Cunningham FJ, Sexton JA, Smallwood CR, O’Malley MA. 2017, Transcriptomic characterization of Caecomyces churrovis: a novel, non-rhizoid-forming lignocellulolytic anaerobic fungus. Biotechnology for Biofuels, 10(1), 1-12.
  11. Hooker CA, Hillman ET, Overton JC, Ortiz-Velez A, Schacht M, Hunnicutt