KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi / 2023 / Cilt: 6 Sayı: 2

Escherichia coli'de Acinetobacter baumannii OccAB1 Porin Proteininin Klonlanması, Ekspresyonu ve Saflaştırılması

Cloning, Expression, and Purification of Acinetobacter baumannii OccAB1 Porin Protein in Escherichia coli

Özge KAYGUSUZ İZGÖRDÜ
Cihan DARCAN
Fatma DOĞAN GUZEL
Sayfa
1529–1542
Yayın Tarihi
2023-07-05
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Porinler ve dışa akış pompalarının aşırı ekspresyonu, ilaç direncini artırmada ve tedavinin etkisiz hale getirilmesinde katkıda bulunan faktörler olarak tespit edilmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Acinetobacter baumannii, toprakta, suda, insan ve hayvan vücutlarının yüzeyleri gibi farklı habitatlarda serbest yaşayan gram negatif bir organizmalardır.
📊
Temel Bulgular & Veri:Porinler ve dışa akış pompalarının aşırı ekspresyonu, ilaç direncini artırmada ve tedavinin etkisiz hale getirilmesinde katkıda bulunan faktörler olarak tespit edilmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:Sonuç olarak, ekspresyon vektörüne klonlanan A. baumannii OccAB1 porini, E. coli'de başarıyla eksprese edildi.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:E. coli · A. baumannii · Ni-NTA

Özet

Acinetobacter baumannii, toprakta, suda, insan ve hayvan vücutlarının yüzeyleri gibi farklı habitatlarda serbest yaşayan gram negatif bir organizmalardır. Ancak zamanla patojenik bir yaşam tarzına adapte olarak tüm dünyada yoğun bakım ünitelerinde enfeksiyonlara ve ölümlere neden olmaktadır. Antibiyotik direncinde porin proteinleri bu bakteride temel rol oynamaktadır. Porinler ve dışa akış pompalarının aşırı ekspresyonu, ilaç direncini artırmada ve tedavinin etkisiz hale getirilmesinde katkıda bulunan faktörler olarak tespit edilmiştir. Bu sebeple antibiyotik geçişlerinin in vitro olarak çalışılabilmesi için öncelikli olarak bu proteinlerin saflaştırılması gerekmektedir. Saflaştırma işleminin ardından elde edilen bu porin proteini ile çift katmanlı lipit tabakalarda antibiyotiklerin geçişleri araştırılacaktır. Bu çalışmada, A. baumannii OccAB1 porin proteini klonlandı ve E. coli'de eksprese edildi. Sonuç olarak, ekspresyon vektörüne klonlanan A. baumannii OccAB1 porini, E. coli'de başarıyla eksprese edildi.

Abstract

Acinetobacter baumannii is a free-living gram-negative organism in different habitats such as soil, water, surfaces of human and animal bodies. However, adapting to a pathogenic lifestyle over time, it causes infections and deaths in intensive care units all over the world. Porin proteins play a fundamental role in antibiotic resistance in this bacterium. Overexpression of porins and efflux pumps have been identified as contributing factors in increasing drug resistance and inactivation of therapy. For this reason, to study antibiotic transitions in vitro, these proteins must be purified first. With this porin protein obtained after purification, the passage of antibiotics in bilayer lipid layers will be investigated. In this study, A. baumannii OccAB1 porin protein was cloned and expressed in E. coli. As a result, A. baumannii OccAB1 porin cloned into the expression vector was successfully expressed in E. coli.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

İZGÖRDÜ, Ö. K., DARCAN, C., GUZEL, F. D. (2023). Escherichia coli'de Acinetobacter baumannii OccAB1 Porin Proteininin Klonlanması, Ekspresyonu ve Saflaştırılması. Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, Cilt: 6 Sayı: 2, 1529–1542. https://ajindex.com/articles/952762

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (11)

  1. Abbott, I., Cerqueira, G. M., Bhuiyan, S., & Peleg, A. Y. (2013). Carbapenem resistance in Acinetobacter baumannii: laboratory challenges, mechanistic insights, and therapeutic strategies. Expert Review of Anti-Infective Therapy, 11(4), 395–409. https://doi.org/10.1586/ERI.13.21
  2. Assenberg, R., Wan, P. T., Geisse, S., & Mayr, L. M. (2013). Advances in recombinant protein expression for use in pharmaceutical research. Current Opinion in Structural Biology, 23(3), 393–402. https://doi.org/10.1016/J.SBI.2013.03.008
  3. Bhamidimarri, S. P., Zahn, M., Prajapati, J. D., Schleberger, C., Söderholm, S., Hoover, J., West, J., Kleinekathöfer, U., Bumann, D., Winterhalter, M., & van den Berg, B. (2019). A Multidisciplinary Approach toward Identification of Antibiotic Scaffolds for Acinetobacter baumannii. Structure (London, England: 1993), 27(2), 268-280.e6. https://doi.org/10.1016/J.STR.2018.10.021
  4. Blattner, F. R., Plunkett, G., Bloch, C. A., Perna, N. T., Burland, V., Riley, M., Collado-Vides, J., Glasner, J. D., Rode, C. K., Mayhew, G. F., Gregor, J., Davis, N. W., Kirkpatrick, H. A., Goeden, M. A., Rose, D. J., Mau, B., & Shao, Y. (1997). The complete genome sequence of Escherichia coli K-12. Science (New York, N.Y.), 277(5331), 1453–1462. https://doi.org/10.1126/SCIENCE.277.5331.1453
  5. Borneleit, P., & Kleber, H.-P. (1991). The Outer Membrane of: Structure-Function Relationships. The Biology of Acinetobacter, 259–271. https://doi.org/10.1007/978-1-4899-3553-3_18
  6. Choi, U., & Lee, C. R. (2019). Distinct Roles of Outer Membrane Porins in Antibiotic Resistance and Membrane Integrity in Escherichia coli. Frontiers in Microbiology, 10(APR), 1–9. https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.00953
  7. Clark, T. J., Momany, C., & Neidle, E. L. (2002). The benPK operon, proposed to play a role in transport, is part of a regulon for benzoate catabolism in Acinetobacter sp. strain ADP1. Microbiology (Reading, England), 148(Pt 4), 1213–1223. https://doi.org/10.1099/00221287-148-4-1213
  8. Darcan, C., Özkanca, R., İdil. Ö. (2009).
  9. The role of RpoS, H-NS and AcP on the pH-dependent OmpC and OmpF porin expressions of Escherichia coli at different pH, Afrıcan Journal of Bıotechnology 8(9):1845-1854.
  10. Darcan, C. (2012). Expression of OmpC and OmpF porin proteins and survival of escherichia coli under photooxidative stress in black seawater. Aquatic Biology, 17(2), 97–105. https://doi.org/10.3354/AB00458
  11. Darcan, C., & Aydin, E. (2012). Fur- mutation increases the survival time of Escherichia coli under p