Dergiler / Türkiye Entomoloji Dergisi / 2020 / Cilt: 44 - Sayı: 3

Globodera rostochiensis (Wollenweber, 1923) Skarbilovich, 1959 (Tylenchida: Heteroderidae)’in Türkiye popülasyonlarının tanımlanması, yaygınlık ve genetik çeşitliliği

Identification, distribution and genetic diversity of Globodera rostochiensis (Wollenweber, 1923) Skarbilovich, 1959 (Tylenchida: Heteroderidae) populations in Turkey

Sayfa
385–397
Yayın Tarihi
2020-09-01
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Globodera rostochiensis'in ikinci dönem larva ve kistlerinin morfolojik ve morfometrik karakterlerinin incelenmesi, Bozdağ ve Ödemiş’ten elde edilen popülasyonlarda arasındaki hafif farklılıkları ortaya koymuştur.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Altın nematod, Globodera rostochiensis (Wollenweber, 1923) Skarbilovich, 1959 (Tylenchida: Heteroderidae) dünyada ekonomik açıdan en önemli patates zararlılarından birisidir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Morfolojik ve moleküler analizler bu nematodun kesin tanısını yapmak ve mücadele stratejilerini oluşturmak amacıyla kullanılmaktadır.
💡
Sonuç & Katkı:Globodera rostochiensis'in ikinci dönem larva ve kistlerinin morfolojik ve morfometrik karakterlerinin incelenmesi, Bozdağ ve Ödemiş’ten elde edilen popülasyonlarda arasındaki hafif farklılıkları ortaya koymuştur.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:2017 Verileri
⚙️Değişkenler:Globodera rostochiensis · ITS · İzmir

Özet

Altın nematod, Globodera rostochiensis (Wollenweber, 1923) Skarbilovich, 1959 (Tylenchida: Heteroderidae) dünyada ekonomik açıdan en önemli patates zararlılarından birisidir. Genellikle patates yetiştirilen alanlarındaki dağılımları ve yoğunluklarını belirlemek amacıyla bu nematod için rutin olarak testler gerçekleştirilmektedir. Morfolojik ve moleküler analizler bu nematodun kesin tanısını yapmak ve mücadele stratejilerini oluşturmak amacıyla kullanılmaktadır. Bu çalışma, İzmir İli’nin Bozdağ ve Ödemiş ilçelerinden 2017 ve 2018 yılları patates yetiştiriciliği sezonlarında alınan toprak örneklerinin %96'sının G. rostochiensis ile enfekte olduğunu göstermiştir. Bulaşık alanlardaki ortalama kist sayısı, 0.01 ila 3.70 kist g-1 toprak arasında değişmiştir. Globodera rostochiensis'in ikinci dönem larva ve kistlerinin morfolojik ve morfometrik karakterlerinin incelenmesi, Bozdağ ve Ödemiş’ten elde edilen popülasyonlarda arasındaki hafif farklılıkları ortaya koymuştur. Tanımlamanın doğruluğunu değerlendirmek için, tüm popülasyonlar için kısmi ribozomal DNA sekansları amplifiye edilmiş, sekanslanmış ve GenBank veritabanına kaydedilmiştir. Morfolojik ölçümler ve filogenetik analizler sonucunda Bozdağ ve Ödemiş'ten elde edilen popülasyonlar arasında küçük farklılıkların olduğu belirlenmiştir. Sekansların GenBank'ta mevcut karşılık gelen G. rostochiensis popülasyonlarıyla karşılaştırılması sonucunda nükleotid benzerliği %99.89-100 oranında görülmüştür. Bu çalışmanın sonuçları, bu zararlıyı daha etkili bir şekilde karantinaya almak için nematodun fizyolojisini, ekolojisini ve biyolojisini daha iyi anlamaya yardımcı olacaktır.

Abstract

The golden nematode, Globodera rostochiensis (Wollenweber, 1923) Skarbilovich, 1959 (Tylenchida: Heteroderidae) is one of the most economically important pests of potato in the world. Tests for this nematode are routinely performed for outbreaks and densities in potato growing areas. The morphological and molecular analyses for precise determination of the nematode are employed to establish appropriate management strategies. This study showed that 96% of soil samples obtained from Bozdağ and Ödemiş Districts of İzmir Province, during 2017 and 2018 potato growing seasons, were positive for G. rostochiensis. The mean number of cysts ranged from 0.01 to 3.70 cysts g-1 soil in the fields examined. The examination of the morphological and morphometric features of the second-stage juveniles and cysts of the G. rostochiensis revealed slight differences among the populations obtained from Bozdağ and Ödemis. To assess the accuracy of the identification, partial sequences of ribosomal DNA for all populations were amplified, sequenced, and deposited in GenBank. The comparisons of the sequences with those of corresponding G. rostochiensis populations available in GenBank showed 99.89-100% nucleotide similarity. The results of this study will help to better understand the physiology, ecology and biology of the nematode to quarantine this pest more effectively.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ALTAŞ, A., EVLİCE, E., ÖZER, G., DABABAT, A., İMREN, M. (2020). Globodera rostochiensis (Wollenweber, 1923) Skarbilovich, 1959 (Tylenchida: Heteroderidae)’in Türkiye popülasyonlarının tanımlanması, yaygınlık ve genetik çeşitliliği. Türkiye Entomoloji Dergisi, Cilt: 44 - Sayı: 3, 385–397. https://ajindex.com/articles/93036

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (11)

  1. Al-Banna, L., A. T. Ploeg, V. M. Williamson & I. Kaloshian, 2004. Discrimination of six Pratylenchus species using PCR and species-specific primers. Journal of Nematology, 36 (2): 142-146.
  2. Andres, M. F., R. Alonso & A. Alemany, 2006. First report of Globodera rostochiensis in Mallorca Island, Spain. Plant Disease, 90 (9): 1262-1262.
  3. Baldwin, J. G. & M. Mundo-Ocampo, 1991. “Heteroderinae, Cyst and Non-Cyst Forming Nematodes, 275-362”. In: Manual of Agricultural Nematology (Eds. W. R. Nickle & M. Dekker). CRC Press, 1035 pp. Chitwood, D. J., 2003. Research on plant-parasitic nematode biology conducted by the United States Department of Agriculture-Agricultural Research Service. Pest Management Science (formerly Pesticide Science), 59 (6-7): 748-753.
  4. Dale, M. F. B., 1988. Breeding for tolerance to potato cyst nematode. Aspects of Applied Biology, 17 (1): 95-101.
  5. Demirbaş Pehlivan, H., G. Kaşkavalcı, E. B. K. Uludamar, H. Toktay & H. Elekcioğlu, 2020. Identification and prevalence of potato cyst nematodes and root-knot nematodes in the potato production areas of İzmir Province, Turkey. Turkish Journal of Entomology, 44 (2): 259-272.
  6. Enneli, S. & G. Öztürk, 1996.” Important Plant parasitic nematodes damaging potatoes in Central Anatolia Region in Turkey, 396-403”. Proceedings of the Third Turkish National Congress of Entomology (24-28 September 1996,
  7. Ankara, Turkey) Ankara University Printing House, 716 pp. EPPO, 2013. European and Mediterranean Plant Protection Organization. EPPO Bulletin, 43: 471-495. FAOSTAT, 2020. Food and Agriculture Organization Statistical Database. (Web page: http://www.fao.org/faostat/en/#data/QC) (Date accessed: 15 March 2020).
  8. Felsenstein, J., 1985. Confidence limits on phylogenies: An approach using the bootstrap. Evolution, 39 (4): 783-791.
  9. Ferris, V. R., J. M. Ferris & J. Faghihi, 1993. Variations in spacer ribosomal DNA in some cyst-forming species of plant parasitic nematodes. Fundamental and Applied Journal of Nematology, 16 (2): 177-184.
  10. Ferris, V. R., L. I. Miller, J. Faghihi & J. M. Ferris, 1995. Ribosomal DNA comparisons of Globodera from two continents. Journal of Nematology, 27 (3): 273-283.
  11. Fleming, C. C. & T. O. Powers, 1998. “Potato Cyst Nematodes: Species, Pathotypes and Virulence Concepts, 51-57”. In: Potato Cyst Nematodes Biology, Distribution and Control (Eds. R. J. Marksand & B. B. Brodie). CAB International, 424 pp. Ganguly, A. K. & U. Rao, 2003. “Application of Molecular Biology in Nematology, 312-317”. In: Adva