Bu makalede yeni nesil dizileme teknolojileri, yeni nesil dizileme sistemlerindeki yeni gelişmeler ve yeni nesil dizileme teknolojisinin uygulama alanları tartışılmıştır.
📌 3 Maddede Bu Makale
🎯
Amaç & Hipotez:Yeni nesil dizileme; genom, transkriptom, DNA-protein etkileşimlerinin geniş kapsamlı analizini ucuz, rutin ve yaygın hale dönüştürdüğünden biyolojik araştırmaları önemli ölçüde hızlandırma potansiyeline sahiptir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Yeni nesil dizileme teknolojisi; mRNA, küçük RNA profili, transkripsiyon faktör bağlanma bölgelerinin genom boyu karakterizasyonu, kromatin yapısı ve metilasyon paterni, atasal DNA mikrobiyolojisi ve metagenomik için yeni ve hızlı yollar sağlar.
💡
Sonuç & Katkı:Bu makalede yeni nesil dizileme teknolojileri, yeni nesil dizileme sistemlerindeki yeni gelişmeler ve yeni nesil dizileme teknolojisinin uygulama alanları tartışılmıştır.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri
Özet
Yeni nesil dizileme; genom, transkriptom, DNA-protein etkileşimlerinin geniş kapsamlı analizini ucuz, rutin ve yaygın hale dönüştürdüğünden biyolojik araştırmaları önemli ölçüde hızlandırma potansiyeline sahiptir. Yeni nesil dizileme teknolojisi; mRNA, küçük RNA profili, transkripsiyon faktör bağlanma bölgelerinin genom boyu karakterizasyonu, kromatin yapısı ve metilasyon paterni, atasal DNA mikrobiyolojisi ve metagenomik için yeni ve hızlı yollar sağlar. Bu makalede yeni nesil dizileme teknolojileri, yeni nesil dizileme sistemlerindeki yeni gelişmeler ve yeni nesil dizileme teknolojisinin uygulama alanları tartışılmıştır.
🔖
Bu Makaleye Atıf Yap
ÜSTEK, D., ABACI, N., SIRMA, S., ÇAKİRİS, A. (2011). Yeni Nesil DNA Dizileme. Experimed, Cilt: 1 - Sayı: 1, 11–18. https://ajindex.com/articles/89156
Margulies M, Egholm M, Airman WE, Attiya S, Bader JS, Bemben LA, et.al. Genome sequencing in microfabricated high-density picolitre reactors. Nature. 2005 Sep 15;437(7057):376-80
Venter JC, Adams MD, Sutton GG, Kerlavage AR, Smith HO, Hunkapiller M. Shotgun sequencing of the human genome. Science 1998, 280,1540-1542
Adams MD, Celniker SE, Holt RA, Evans CA, Gocayne JD, Amanatides PG, Scherer SE, The genome sequence of Drosophila melanogaster. Science. 2000 Mar 24;287(5461):2185-95
Fleischmann RD, Adams MD, White O, Clayton RA, Kirkness EF, Kerlavage AR, Bult CJ, Tomb JF, Dougherty BA, Merrick JM, et al. Whole-genome random sequencing and assembly of Haemophilus influenzae Rd. Science. 1995 Jul28;269(5223):496-512
Sanger F, Nicklen S, and Coulson AR. DNA sequencing with cham-terminating inhibitors. Proc. Natl.Acad. Sei. 1977; 74:5463-5467
Ronaghi M, Nygren M, Lundeberg J, Nyren P. Analyses of secondary structures in DNA by pyrosequencing. Anal Biochem. 1999; Feb 1;267(1):65-71 http://454.com/downloads/my454/documentation/gsflx/method-manuals/GS-FLX-Titanium-emPCR-MethodManual-(Apr2009) Ronaghi M. Pyrosequencing sheds light on DNA sequencing. Genome Res. 2001; Jan;ll(l):3-ll Wheeler DA, Srinivasan M, Egholm M, Shen Y, Chen L, McGuire A, He W, et al. The complete genome of an individual by massively parallel DNA sequencing. Nature 2008; 452: 872-877 N4 Green RE, Krause J, Ptak SE, Briggs AW, Ronan MT, Simons JF, et al. Analysis of one million base pairs of Neanderthal DNA. Nature 2006; 444: 330-336
Gilbert MT, Binladen J, Miller W, Wiuf C, Willerslev E, Poinar H, et al. Recharacterization of ancient DNA miscodinglesions: insights in the era of sequencing-by-synthesis. Nucleic Acids Res. 2007;35(1):1-10 Mardis ER. Next-generation DNA sequencing methods. Annu Rev Genomics Hum Genet 2008; 9: 387^402 Schuster SC. Next-generation sequencing transforms today's biology. Nat. Methods 2008. 5 (1): 16-8 Rusk N. Torrents of sequence. Nature Methods 2011; 8(1)44 Treffer R, Deckert V. Recent advances in singlemolecule sequencing. Current Opinion in Biotechnology 2010; 21( 1): 4-11
Cox-Foster DL, Conlan S, Holmes EC, Palacios G, Evans JD, Moran NA, Quan PL, Briese T, Hornig M, Geiser DM, Martinson V, vanEngelsdorp D, Kalkstein AL, Drysdale A, Hui J, Zhai J, Cui L, Hutchison SK, Simons JF, Egholm M, Pettis JS, Lipkin WI. A metagenomic survey of microbes in honey bee colony collapse disorder. Science. 2007 Oct 12;318(5848):283-7.