Dergiler / Pamukkale Tıp Dergisi / 2023 / Cilt: 16 - Sayı: 2

Glioblastomda prognostik faktörleri tanımlamak için makine öğrenmesi modeli: SEER tabanlı analiz

Machine learning model to identify prognostic factors in glioblastoma: a SEER-based analysis

Sayfa
338–348
Yayın Tarihi
2023-04-05
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bulgular: Hastaların ortanca sağ kalımı 9,00±0,09 ay olarak bulundu.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Amaç: Büyük miktarlardaki karmaşık sağlık hizmeti verilerinin analiz edilmesi ve yorumlanmasında geleneksel istatistiksel yaklaşımlar giderek yetersiz kalmaktadır.
📊
Temel Bulgular & Veri:Bu nedenle hastalık tanımlamasını, tedavi değerlendirmesini, cerrahi planlamayı ve sonuç tahminini geliştirir.
💡
Sonuç & Katkı:Bulgular: Hastaların ortanca sağ kalımı 9,00±0,09 ay olarak bulundu.
🔬Tür:Deneysel Tarla Denemesi
📍Kapsam:2007-2018 · 31663 hasta
⚙️Değişkenler:Makine öğrenmesi · büyük veri · glioblastoma

Özet

Amaç: Büyük miktarlardaki karmaşık sağlık hizmeti verilerinin analiz edilmesi ve yorumlanmasında geleneksel istatistiksel yaklaşımlar giderek yetersiz kalmaktadır. Bununla birlikte, Büyük Verinin makine öğrenmesi ile analiz edilmesi, hasta bilgilerinin depolanmasını, sınıflandırılmasını destekler. Bu nedenle hastalık tanımlamasını, tedavi değerlendirmesini, cerrahi planlamayı ve sonuç tahminini geliştirir. Mevcut çalışma, glioblastomda (GB) prognostik faktörleri tanımlamak için bir risk modeli oluşturmayı amaçlamaktadır. Gereç ve yöntem: Çalışmaya 2007-2018 yılları arasında GB tanısı konan 31663 hasta dahil edilmiştir. Çalışmadaki veriler Surveillance, Epidemiology, and End Results (SEER) veri tabanından alınmıştır. Analizler için genel sağ kalımlar, yaş, ırk, cinsiyet, primer bölge, lateralite, cerrahi ve tanı anındaki tümör boyutu, vital durum ve takip süresi (ay) seçildi. Bulgular: Hastaların ortanca sağ kalımı 9,00±0,09 ay olarak bulundu. Ayrıca tablodaki tüm değişkenler cinsiyet dışında sağ kalım için istatistiksel olarak anlamlı risk faktörleriydi. Bu nedenle, makine öğrenmesi analizi için bağımsız risk faktörleri olarak cerrahi, yaş, lateralite, primer bölge, tümör boyutu, ırk, cinsiyet değişkenleri ve vital durum bağımlı değişken olarak kullanıldı. Makine öğrenmesi sonuçlarına bakıldığında, doğruluk, F-ölçümü ve MCC performans kriterlerine göre Hibrit Model en iyi sonuçları vermiştir. En iyi performansa sahip olan hibrit modele göre 100 hastanın 84'ünde canlı/ölü tanısı sırasıyla 1 ve 2 yıl için doğru olarak yorumlanabilmektedir. Sonuç: Makine öğrenmesi ile oluşturulan model GB hastalarında 1 ve 2 yıllık sağ kalımı öngörmede sırasıyla %84,9 ve %74,1 başarılıydı. Temel fikirlerin tanınması, beyin cerrahlarının Büyük Veriyi anlamalarına ve ilgili sağlık hizmetleri alanındaki olağanüstü miktarda veriyi değerlendirmelerine yardımcı olacaktır.

Abstract

Purpose: Analyzing and interpreting large amounts of complex health care data are becoming more insufficient by traditional statistical approaches. However, analyzing Big Data (BD) by machine learning (ML) supports the storage, classification of patient information. Therefore, improves disease identification, treatment evaluation, surgical planning, and outcome prediction. The current study aims to create a competing risk model to identify prognostic factors in glioblastoma (GB). Materials and methods: The study included 31663 patients diagnosed with GB between 2007 and 2018. The data in the study were taken from the Surveillance, Epidemiology, and End Results (SEER) database. Overall survivals (OS), age, race, gender, primary site, laterality, surgery and tumor size at the time of diagnosis, vital status, and follow-up time (months) were selected for the analyzes. Results: The median OS of the patients was found to be 9.00±0.09 months. In addition, all variables in the table were statistically significant risk factors for survival except gender. Therefore, surgery, age, laterality, primary site, tumor size, race, gender variables were used as independent risk factors, and vital status was used as a dependent variable for ML analysis. Looking at the ML results, hybrid model gave the best results according to Accuracy, F-measure, and MCC performance criteria. According to hybrid model, which has the best performance, the diagnosis of alive/dead in 84 and 74 out of 100 patients can be interpreted as correct for 1- and 2-year, respectively. Conclusions: The model created by ML was 84.9% and 74.1% successful in predicting 1- and 2-year survival in GB patients, respectively. Recognition of the fundamental ideas will allow neurosurgeons to understand BD and help evaluate the extraordinary amount of data within the associated healthcare field.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

BAKIRARAR, B., EGEMEN, E., DERE, Ü. A., YAKAR, F. (2023). Glioblastomda prognostik faktörleri tanımlamak için makine öğrenmesi modeli: SEER tabanlı analiz. Pamukkale Tıp Dergisi, Cilt: 16 - Sayı: 2, 338–348. https://ajindex.com/articles/888226

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (12)

  1. Yakar F, Egemen E, Çeltikçi E, et al. The big data awareness of Turkish neurosurgeons: a national survey. J Nervous Sys Surgery 2022;8:9-16.
  2. Hinton GE, Osindero S, Teh YW. A fast-learning algorithm for deep belief nets. Neural Comput 2006;1:1527-1554.
  3. White SE. A review of big data in healthcare: challenges and opportunities. Open Access Bioinf 2014;6:13-18.
  4. Hashem IAT, Yaqoob I, Anuar NB, Mokhtar S, Gani A, Ullah Khan S. The rise of 'Big Data' on cloud computing: review and open research issues. Inf Syst 2015;47:98-115.
  5. Ostrom QT, Cioffi G, Gittleman H, et al. CBTRUS statistical report: primary brain and other central nervous system tumors diagnosed in the United States in 2012-2016. Neuro-Oncology 2019;21:1-100.
  6. Stupp R, Hegi ME, Mason WP, et al. Effects of radiotherapy with concomitant and adjuvant temozolomide versus radiotherapy alone on survival in glioblastoma in a randomized phase III study: 5-year analysis of the EORTC-NCIC trial. Lancet Oncol 2009;10:459-466.
  7. Stupp R, Mason WP, van den Bent MJ, et al. Radiotherapy plus concomitant and adjuvant temozolomide for glioblastoma. N Engl J Med 2005;352:987-996.
  8. Johnson DR, O'Neill BP, Glioblastoma survival in the United States before and during the temozolomide era. J Neuro-Oncol 2012;107:359-364.
  9. Ostrom QT, Gittleman H, Farah P, et al. CBTRUS statistical report: primary brain and central nervous system tumors diagnosed in the United States in 2006-2010. Neuro Oncol 2013;15:1-56.
  10. Thakkar JP, Dolecek TA, Horbinski C, et al. Epidemiologic and molecular prognostic review of glioblastoma. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2014;23:1985-1996.
  11. Filippini G, Falcone C, Boiardi A, et al. Prognostic factors for survival in 676 consecutive patients with newly diagnosed primary glioblastoma. Neuro-Oncol 2008;10:79-87.
  12. González Bonet LG, Piqueras Sánchez C, Roselló Sastre E, Broseta Torres R, de Las Peñas R. Long-term survival of glioblastoma: a systematic analysis of literature about a case. Neurocirugia 2021;33:227-236. https://doi.org/10