Dergiler / Biyolojik Çeşitlilik ve Koruma / 2017 / Cilt: 10 - Sayı: 1

Van Gölü’nün alkalifilik bakteriyel çeşitliliği

Alkaliphilic bacterial diversity of Lake Van/Turkey

Sayfa
92–103
Yayın Tarihi
2017-04-15
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Sonuçlar kommunitede bakterilerin yoğun olduğunu göstermiştir

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Van Gölü Türkiye Doğu Anadolu Bölgesi’nde yer alan, büyük bir havzanın alçak kısmını kaplayan tuzlu bir soda gölüdür.
📊
Temel Bulgular & Veri:Van Gölü’nün önemi Dünya’nın en büyük soda göllerinden bir olmasından ve 607 km3’lük hacmi ile Dünya’nın en büyük 3. kapalı havza gölü olmasından kaynaklanmaktadır.
💡
Sonuç & Katkı:Sonuçlar kommunitede bakterilerin yoğun olduğunu göstermiştir
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Van Gölü · alkalifilik bakteri · ARDRA

Özet

Van Gölü Türkiye Doğu Anadolu Bölgesi’nde yer alan, büyük bir havzanın alçak kısmını kaplayan tuzlu bir soda gölüdür. Van Gölü’nün önemi Dünya’nın en büyük soda göllerinden bir olmasından ve 607 km3’lük hacmi ile Dünya’nın en büyük 3. kapalı havza gölü olmasından kaynaklanmaktadır. Van Gölü ile ilgili bazı biyolojik çalışmalar yapılmasına rağmen mikrobiyal çeşitliliği üzerine araştırmalar yeterli değildir. Bu yüzden bu çalışma Van Gölü'ndeki alkalifilik bakteri çeşitliliği üzerine yapılan araştırmalara bilimsel katkılar sağlamaktadır. Bu amaçla, gölün çevresindeki şehirlerin kıyılara yakın, farklı noktalardan alınan su örneklerine kültür bağımlı ve kültürden bağımsız yöntemler uygulanmıştır. Kültür çalışmaları için 10 farklı besi yeri kullanılmıştır. Bakteriyel çeşitlilik, 16 S rRNA geninin PCR ile çoğaltılması, dizileme ve NCBI veri tabanı kullanılarak incelenmiştir. Sonuçlar, Proteobacteria özellikle Gammaproteobacteria ve Actinobacteria filumlarının baskın bir şekilde bulunduğunu göstermiştir. Mikrobiyal populasyonları belirlemek için kültür bağımsız yöntemler olan DGGE Denatüre Edici Gradiyent Jel Elektroforezi ve FISH Fluoresan In Situ Hibridizasyon kullanılmıştır. Sonuçlar kommunitede bakterilerin yoğun olduğunu göstermiştir

Abstract

Lake Van, situated in Turkey's eastern Anatolian region, is a saline soda lake and it covers the lowest part of a vast basin. The importance of Lake Van comes from being one of the largest soda lakes and third largest endorheic lake on Earth with a volume of 607 km3. Although several biological studies have been done for Lake Van, research on microbial diversity of the lake is still missing. This paper contributes to scientific knowledge by research on alkaliphilic bacterial diversity of Lake Van. In this regard, culture-dependent and culture-independent methods were applied to the samples, which were taken from different locations close to the shores of surrounding cities. Isolation was performed on 10 different media. Bacterial diversity was analyzed by 16S rRNA gene PCR amplification, sequencing and blast analysis against NCBI database. Results showed that members of Proteobacteria especially Gammaproteobacteria and Actinobacteria phylums were represented dominantly. Culture-independent DGGE Denaturing Gradient Gel Electrophoresis and FISH Fluorescence In-Situ Hybridization methods were also used to detect the microbial populations in Lake Van. The results showed that the community was dominated by Bacteria

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

POYRAZ, N., MUTLU, M. B. (2017). Van Gölü’nün alkalifilik bakteriyel çeşitliliği. Biyolojik Çeşitlilik ve Koruma, Cilt: 10 - Sayı: 1, 92–103. https://ajindex.com/articles/744488

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (10)

  1. Altschul, S. F., Gish, W., Miller, W., Myers, E. W., Lipman, D. J. (1990). Basic local alignment search tool. Journal of molecular biology, 215 (3), 403-410.
  2. Amann, R. I., Binder, B. J., Olson, R. J., Chisholm, S. W., Devereux, R., Stahl, D. A. (1990). Combination of 16S rRNA-targeted oligonucleotide probes with flow cytometry for analyzing mixed microbial populations. Applied and environmental microbiology, 56 (6), 1919-1925. Antón, J., Llobet‐Brossa, E., Rodríguez‐Valera, F., Amann, R. (1999). Fluorescence in situ hybridization analysis of the prokaryotic community inhabiting crystallizer ponds. Environmental Microbiology, 1 (6), 517-523.
  3. Antony, C. P., Murrell, J. C., Shouche, Y. S. (2012). Molecular diversity of methanogens and identification of Methanolobus sp. as active methylotrophic Archaea in Lonar crater lake sediments. FEMS microbiology ecology, 81 (1), 43-51.
  4. Bell, K. S., Philp, J. C., Aw, D. W. J., Christofi, N. (1998). The genus Rhodococcus. Journal of Applied Microbiology, (2), 195-210.
  5. Berber, İ. and Yenidünya, E. (2005). Identification of alkaliphilic Bacillus species isolated from Lake Van and its surroundings by computerized analysis of extracellular protein profiles. Turkish Journal of Biology, (3), 181-188.
  6. Bilgili, A., Sağmanlıgil, H., Çetinkaya, N., Yarsan, E., Türel, İ. (1995). Van gölü suyunun doğal kalitesi ve buradan avlanan İnci kefali (Calcalburnus tarichii, Pallas 1811) örrneklerinde bazı ağır metal düzeyleri. A Ü Vet Fak Derg, 42. Çiftçi, Y., Isik, M. A., Alkevli, T., Yeşilova, Ç. (2008). Van Gölü Havzasının Çevre Jeolojisi. Jeoloji Mühendisliği Dergisi, 32 (2), 45-77.
  7. Cifuentes, A., Antón, J., Benlloch, S., Donnelly, A., Herbert, R. A., Rodríguez-Valera, F. (2000). Prokaryotic diversity in Zostera noltii-colonized marine sediments. Applied and environmental microbiology, 66 (4), 1715-1719.
  8. Cukur, D., Krastel, S., Schmincke, H. U., Sumita, M., Çağatay, M. N., Meydan, A. F., Damcı E., Stockhecke, M. (2014). Seismic stratigraphy of lake Van, eastern Turkey. Quaternary Science Reviews, 104, 63-84.
  9. Danulat, E. and Kempe, S. (1992). Nitrogenous waste excretion and accumulation of urea and ammonia in Chalcalburnus tarichi (Cyprinidae), endemic to the extremely alkaline Lake Van (Eastern Turkey). Fish physiology and biochemistry, 9 (5-6), 377-386.
  10. Dereeper, A., Audic, S., Claverie, J. M., Blanc, G. (2010). BLAST-EXPLORER helps you building datasets for phylogenetic analysis. BMC evolutionary biology, 10 (1), 8. Dereeper, A., Guignon