Dergiler / Türk Tarım ve Doğa Bilimleri Dergisi / 2020 / Cilt: 7 - Sayı: 4

Bingöl İlinde Domateste Stolbur ve Yonca Proliferasyon Fitoplazma Enfeksiyonları

Stolbur and Clover Proliferation Phytoplasma Infections in Tomato from Bingöl Province, Turkey

Sayfa
855–866
Yayın Tarihi
2022-11-05
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

P. trifolii”(16SrVI-A) nin ilk raporudur.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Bingöl ilinde yetiştiriciliği yapılan domates (Lycopersicum esculentum L.) tarlalarında fitoplazma benzeri belirtiler dikkat çekmiştir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Simptomlu ve simptomsuz toplam 11 bitkinin yapraklarından muhtemel patojeni belirleyebilmek için genomik DNA izolasyonu yapılmıştır.
💡
Sonuç & Katkı:P. trifolii”(16SrVI-A) nin ilk raporudur.
🔬Tür:Deneysel Tarla Denemesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Bingöl ilinde yetiştiriciliği yapılan domates (Lycopersicum esculentum L.) tarlalarında fitoplazma benzeri belirtiler dikkat çekmiştir. Dikkat çeken belirtiler arasında cadı süpürgesi, rozetleme, mor renkli kıvrılmış ve gevrek yapraklar, üst dallarda küçük yapraklılık ve aşırı uzamış kaliks yer almaktadır. Simptomlu ve simptomsuz toplam 11 bitkinin yapraklarından muhtemel patojeni belirleyebilmek için genomik DNA izolasyonu yapılmıştır. Üniversal primer setleri kullanılarak gerçekleştirilen Nested-PCR testlerinde, 11 örneğin 4’ünde yaklaşık 1200 bp büyüklüğünde DNA bantları elde edilmiştir. R16F2n/R16R2 primerleri ile bant veren örneklerden rastgele ikisi seçilerek uygun bir plasmid vektörde klonlanmıştır. Saflaştırılan rekombinant plasmid DNA’sı çift yönlü olarak dizilenmiştir. 16S rDNA dizisinin moleküler analizleri, infekteli domates örneklerinde ‘Canditatus Phytoplasma solani’ (16SrXII-A grup) (benzerlik katsayısı 1.00) (Ulaşım no: MT279680) ve ‘Canditatus Phytoplasma trifolii’(16SrVI-A grup) (benzerlik katsayısı 1.00) (Ulaşım no: MT279852) doğrulamıştır. Domates örneklerindeki fitoplazma izolatları ‘Bingöl D11’ ve ‘Bingöl D90’ olarak isimlendirilmiştir. Oluşturulan filogenetik dendrogram da her iki patojenin ait olduğu yeri doğrulamıştır. Mevcut bu çalışma Bingöl ilinde domatesi doğal olarak enfekte eden “Ca. P. solani”(16SrXII-A) ve “Ca. P. trifolii”(16SrVI-A) nin ilk raporudur.

Abstract

Phytoplasma-type symptoms were noted in tomato (Lycopersicum esculentum L.) in Bingöl province ofTurkey. The remarkable symptoms include witch’s broom, rosetting, purple curled and crispy leaves, smallleaves in the upper branches and excessively elongated calyx. Genomic DNA isolation was performed toidentify possible pathogens from the leaves of 11 plants with and without symptom. In the Nested-PCR testperformed using universal primer sets, DNA bands of approximately 1200 bp size were obtained in 4 of 11samples. Randomly chosen two DNA bands primed R16F2n/R16R2 were cloned into an appropriate plasmidvector to further characterizations. The recombinant plasmid DNAs purified were sequenced in both directions.Molecular assays of the 16S rRNA sequence confirmed the existence of the “Canditatus Phytoplasma solani”(16SrXII-A group) (similarity coefficient 1.00) (Accession no: MT279680) and the “Canditatus Phytoplasmatrifolii” (16SrVI-A group) (similarity coefficient 1.00) (Accession no: MT279852) in the infected tomato samples.The isolates associated with tomato-phytoplasma were named as ‘Bingöl D11’ and ‘Bingöl D90’ isolates,respectively. The phylogenetic dendrogram created also confirmed where both pathogens belong.This current paper is documented in the first record of “Ca. P. solani” (16SrXII-A) and “Ca. P. trifolii”(16SrVI-A) in naturally diseased tomato in Bingöl of Turkey.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

USTA, M., GÜLLER, A. (2022). Bingöl İlinde Domateste Stolbur ve Yonca Proliferasyon Fitoplazma Enfeksiyonları. Türk Tarım ve Doğa Bilimleri Dergisi, Cilt: 7 - Sayı: 4, 855–866. https://ajindex.com/articles/655360

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (10)

  1. Afat, F. 2004. Çanakkale İlinde Domates Stolbur Hastalığının Yaygınlık Durumunun Belirlenmesi ve Hastalığın Aşı Yoluyla, Küskütle ve Tohumla Taşınma Oranlarının Saptanması. Y. Lisans Tezi. Çanakkale Üniversitesi,
  2. Ziraat Fakültesi, Bitki Koruma Bölümü. 58 sayfa. Alp, Ş., Usta, M., Sipahioğlu H.M., Güller A. 2016. “First report of “Canditatus Phytoplasma solani” on a new host marigold (Tagetes erecta L.)” Turkish Journal of Agriculture and Forestry, 40: 311-318.
  3. Al-Subhi, A.M., Hogenhout, S.A., Al-Yahyai, R.A., AlSadi, A.M. 2017. Classification of a new phytoplasma subgroup 16SrII-W associated with Crotalaria witches’ broom diseases in Oman based on multigene sequence analysis. BMC Microbiology, 17(1): 221 DOI 10.1186/s12866-017-1130-3.
  4. Alvarez, E., Mejía, J.F., Contaldo, N., Paltrinieri, S., Duduk, B., Bertaccini, A. 2014. ‘Canditatus Phytoplasma asteris’ strains associated with oil palm lethal wilt in Colombia. Plant Disease, 98: 311-318.
  5. Amaral-Mello, A.P., Bedendo, I.P., Kitajima, E.W., Ribeiro,.LF., Kobori, R. 2006. Tomato big bud associated with a phytoplasma belonging to group 16Sr III in Brazil, International Journal of Pest Management, 52 (3): 233-237.
  6. Anfoka, G., Khalil, AB., Fattash, I. 2003. Detection and Molecular Characterization of a Phytoplasma Associated with Big Bud Disease of Tomatoes in Jordan. Journal of Phytopathology, 151(4): 223-227
  7. Arocha, Y., Antesana, O., Montellano, E., Franco, P., Plata, G., Jones, P. 2007. ‘Canditatus Phytoplasma lycopersici’, a phytoplasma associated with ‘hoja de perejil’ disease in Bolivia. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 57: 1704– 1710. Arocha, Y., López, M., Piñol, B., Fernández, M., Picornell, S., Almeida, R., Palenzuela, I., Wilson, M.R., Jones, P. 2005. ‘Canditatus Phytoplasma graminis’ and ‘Canditatus Phytoplasma caricae’, two novel phytoplasmas associated with diseases of sugarcane, weeds and papaya in Cuba. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 55: 2451–2463.
  8. Azza, G.F., Eman, A.H.M. 2016. Detection of stolbur phytoplasma in tomato by a specific DNA hybridization. Research Journal of Biotechnology, 11 (6): 30-34.
  9. Belli, G., Bianco, P.A., Conti, M. 2010. Grapevine yellows in Italy: past, present and future. Journal of Plant Pathology, 92(2): 303-326.
  10. Bertaccini, A., Franova, J., Botti, S., Tabanelli, D. 2005 Molecular characterization of phytoplasmas in lilies with fasciation in the Czech Republic. FEMS Microbiology Letters, 249: 79–85. B