Dergiler / Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi / 2019 / Cilt: 49 - Sayı: 2

Kan Örneklerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Kompleks Suşlarının Tür Düzeyinde Tanımlanması ve Antifungal Duyarlılıklarının Belirlenmesi

Identification of Candida parapsilosis Complex Strains Isolated from Blood Samples at Species Level and Determination of Their Antifungal Susceptibilities

Sayfa
61–66
Yayın Tarihi
2022-11-05
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

C. parapsilosis türkompleksindeki türler, sekonder alkol dehidrogenaz enzimini kodlayan gen bölgesinin (SADH)“polimeraz chain reaction-restriction fragment length polymorphism” (PCR-RFLP) yöntemiyleincelenmesiyle belirlendi.Bulgular: Bu çalışmada, kan kültürlerinden izole edilen 118 C. parapsilosis tür kompleksi suşundaflukonazol direncinin %26.3 oranında olduğu, amfoterisin B ve anidulafunginde ise direncin yokdenecek kadar az olduğu saptandı.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Amaç: Dünyada ve ülkemizde birçok merkezde, fırsatçı bir enfeksiyon olan kandidemilere ikincisıklıkta neden olan tür Candida parapsilosis tür kompleksidir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Bu çalışmada, laboratuvarımızda kan kültürlerinden izole edilen C. parapsilosis türkompleksi suşlarının antifungal duyarlılıklarının incelenmesi ve tür düzeyinde tanımlamayapılması amaçlanmıştır.Yöntem: Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı stoklarından 118 kanizolatı kullanıldı.
💡
Sonuç & Katkı:C. parapsilosis türkompleksindeki türler, sekonder alkol dehidrogenaz enzimini kodlayan gen bölgesinin (SADH)“polimeraz chain reaction-restriction fragment length polymorphism” (PCR-RFLP) yöntemiyleincelenmesiyle belirlendi.Bulgular: Bu çalışmada, kan kültürlerinden izole edilen 118 C. parapsilosis tür kompleksi suşundaflukonazol direncinin %26.3 oranında olduğu, amfoterisin B ve anidulafunginde ise direncin yokdenecek kadar az olduğu saptandı.
🔬Tür:Laboratuvar & Saha Deneyi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Amaç: Dünyada ve ülkemizde birçok merkezde, fırsatçı bir enfeksiyon olan kandidemilere ikincisıklıkta neden olan tür Candida parapsilosis tür kompleksidir. Bu tür kompleksi içinde yer alanCandida parapsilosis sensu stricto, Candida orthopsilosis ve Candida metapsilosis türleri fenotipikolarak birbirinden ayrılamaz ve tanımlanmaları için çeşitli moleküler yöntemlere gereksinimduyulur. Bu çalışmada, laboratuvarımızda kan kültürlerinden izole edilen C. parapsilosis türkompleksi suşlarının antifungal duyarlılıklarının incelenmesi ve tür düzeyinde tanımlamayapılması amaçlanmıştır.Yöntem: Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı stoklarından 118 kanizolatı kullanıldı. İzolatların flukonazol, vorikonazol, itrakonazol, posakonazol, amfoterisin B veanidulafungine in vitro duyarlılığı CLSI-M27 dokümanına göre saptandı. C. parapsilosis türkompleksindeki türler, sekonder alkol dehidrogenaz enzimini kodlayan gen bölgesinin (SADH)“polimeraz chain reaction-restriction fragment length polymorphism” (PCR-RFLP) yöntemiyleincelenmesiyle belirlendi.Bulgular: Bu çalışmada, kan kültürlerinden izole edilen 118 C. parapsilosis tür kompleksi suşundaflukonazol direncinin %26.3 oranında olduğu, amfoterisin B ve anidulafunginde ise direncin yokdenecek kadar az olduğu saptandı. Antifungal duyarlılığı belirlenen bu suşlar arasındaC. orthopsilosis ve C. metapsilosis türlerine rastlanmadı.Sonuç: Bu çalışma ile merkezimizdeki C. parapsilosis tür kompleksindeki yüksek flukonazol direncininkompleks içindeki türlerle ilişkili olmadığı görüldü. Suşlar arasındaki klonal ilişkinin ve direncingenetik temellerinin araştırılması için ek çalışmaların yapılması gerektiği sonucuna varıldı.

Abstract

Objective: Candida parapsilosis species complex is the second most common cause of candidiasis which is an opportunistic infection, in many centers in the world and in our country. Candida parapsilosis sensu stricto, Candida orthopsilosis and Candida metapsilosis within this species complex are indistinguishable from each other phenotypically and various molecular methods are needed for their identification. In this study, we aimed to investigate the antifungal susceptibility of C. parapsilosis species complex isolated from blood cultures in our laboratory and to identify them at species level. Method: A total of 118 blood isolates from the stock culture of Uludağ University Faculty of Medicine Department of Microbiology were used. The in vitro sensitivity of the isolates to fluconazole, voriconazole, itraconazole, posaconazole, amphotericin B and anidulafungin was determined according to the CLSI-M27 document. The species in the C. parapsilosis species complex were determined by the investigation of the gene region encoding the secondary alcohol dehydrogenase enzyme (SADH) using “polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism” (PCR-RFLP) method. Results: In this study, fluconazole resistance was found to be 26.3% in the 118 C. parapsilosis species complex isolated from blood cultures, and the resistance to amphotericin B and anidulafungin was almost none. There were no C. orthopsilosis and C. metapsilosis species among these strains. Conclusion: In this study, it was shown that high fluconazole resistance in C. parapsilosis species complex in our center was not associated with different species in the complex. It is concluded that additional studies should be done to search for clonal relationship between strains and genetic basis of resistance.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ENER, B., AĞCA, H., CİLO, B. D. (2022). Kan Örneklerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Kompleks Suşlarının Tür Düzeyinde Tanımlanması ve Antifungal Duyarlılıklarının Belirlenmesi. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, Cilt: 49 - Sayı: 2, 61–66. https://ajindex.com/articles/635588

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (12)

  1. Eggimann P, Garbino J, Pittet D. Epidemiology of Candida species infections in critically ill nonimmunosuppressed patients. Lancet Infect Dis. 2003;3(11):685-702.
  2. Wisplinghoff H, Bischoff T, Tallent SM, Seifert H, Wenzel RP, Edmond MB. Nosocomial bloodstream infections in US hospitals: analysis of 24,179 cases from a prospective nationwide surveillance study. Clin Infect Dis. 2004;39(3):309-17.
  3. Tortorano AM, Peman J, Bernhardt H, et al. Epidemiology of candidemia in Europe: results of 28-month European Confederation of Medical Mycology (ECMM) hospital-based surveillance study. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2004;23(4):317-22.
  4. Diekema DJ, Pfaller MA. Nosocomial candidemia: an ounce of prevention is better than a pound of cure. Infect Control Hosp Epidemiol. 2004;25(8):624-6.
  5. Yapar N, Uysal U, Yücesoy M, Çakır N, Yüce A. Nosocomial bloodstream infections associated with Candida species in a Turkish university hospital. Mycoses. 2005;49(2):134-8.
  6. Çelebi S, Hacımustafaoğlu M, Özdemir O, Özkaya G. Nosocomial candidemia in children: results of a 9-year study. Mycoses. 2008;51(3):248-57.
  7. Bakır M, Çerikcioğlu N, Bartaon R, Yağcı. Epidemiology of candidemia in a Turkish tertiary care hospital. APMIS. 2006;114(9):601-10.
  8. Gürcüoğlu E, Ener B, Akalın H, et al. Epidemiology of nosocomial candidaemia in a university hospital: a 12-year study. Epidemiol Infect. 2010;138(9):1328-35.
  9. Nosek J, Holesova Z, Kosa P, Gacser A, Tomaska L. Biology and genetics of the pathogenic yeast Candida parapsilosis. Curr Genet. 2009;55(5):497-509.
  10. Trofa D, Gácser A, Nosanchuk JD. Candida parapsilosis: an emerging fungal pathogen. Clin Microbiol Rev. 2008;21(4):606-25.
  11. Tavanti A, Davidson AD, Gow NAR, Maiden MCJ, Odds FC. Candida orthopsilosis and Candida metapsilosis spp. nov. to replace Candida parapsilosis groups II and III. J Clin Microbiol. 2005;43(1):284-92.
  12. Lockhart SR, Messer SA, Pfaller MA, Diekema DJ. Geographic distribution and antifungal susceptibility of the newly described species