Dergiler / Türk Biyokimya Dergisi / 2013 / Cilt: 38 - Sayı: 1

Gastrointestinal stromal tümörlerde c-kit proto-onkogeni (KIT) mutasyon sıklıkları: Türkiye’nin Ege Bölgesi kaynaklı populasyon çalışması

The frequencies of c-kit proto-oncogene (KIT) mutations in gastrointestinal stromal tumours: a population based study from Aegean Region of Turkey

Sayfa
5–12
Yayın Tarihi
2022-11-05
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bulgular: Olguların KIT geni ekzon 9, 11, 13 ve 17 mutasyon sıklıkları sırasıyla % 8.3, % 47.5, % 11.7 ve % 1.7 olarak saptandı.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Amaç: Biyolojik davranışın oldukça değişken olduğu gastrointestinal stromal tümörlerde c-kit proto-onkogeni (KIT) ekzon 9, 11, 13 ve 17 aktivasyon mutasyonları tümörün klinik davranışı ile ilişkilidir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Bu çalışmanın amacı Türk popülâsyonunda ilk kez gastrointestinal stromal tümörlerde KIT geni ekzon 9, 11, 13 ve 17 mutasyonlarının dağılımlarının belirlenmesi ve histopatolojik özellikler ile ilişkilendirilmesidir.Gereç ve Yöntemler: 2006-2010 yılları arasında gastrointestinal stromal tümör tanısı almış altmış hastanın formalinle fikse edilmiş parafine gömülmüş tümör dokularından, spin kolon yöntemi kullanılark DNA izole edilmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:Bulgular: Olguların KIT geni ekzon 9, 11, 13 ve 17 mutasyon sıklıkları sırasıyla % 8.3, % 47.5, % 11.7 ve % 1.7 olarak saptandı.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:2006-2010 Verileri
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Amaç: Biyolojik davranışın oldukça değişken olduğu gastrointestinal stromal tümörlerde c-kit proto-onkogeni (KIT) ekzon 9, 11, 13 ve 17 aktivasyon mutasyonları tümörün klinik davranışı ile ilişkilidir. Bu çalışmanın amacı Türk popülâsyonunda ilk kez gastrointestinal stromal tümörlerde KIT geni ekzon 9, 11, 13 ve 17 mutasyonlarının dağılımlarının belirlenmesi ve histopatolojik özellikler ile ilişkilendirilmesidir.Gereç ve Yöntemler: 2006-2010 yılları arasında gastrointestinal stromal tümör tanısı almış altmış hastanın formalinle fikse edilmiş parafine gömülmüş tümör dokularından, spin kolon yöntemi kullanılark DNA izole edilmiştir. Elde edilen DNA'lar kapiller elektroforez tabanlı DNA dizileme sisteminde KIT geni ekzon 9, 11, 13 ve 17 mutasyonlarının varlığı açısından dizilendi. Bulgular: Olguların KIT geni ekzon 9, 11, 13 ve 17 mutasyon sıklıkları sırasıyla % 8.3, % 47.5, % 11.7 ve % 1.7 olarak saptandı. Klinikopatolojik özellikler ile mutasyon durumu arasındaki ilişki analizine göre, genel mutasyon ve ekzon 11 mutasyon varlığı erkeklerde kadınlara göre anlamlı olarak fazlaydı (p=0.004 ve p=0.003). İnce bağırsak tümörlerinde mutasyon oranı da mide tümörlerine göre fazlaydı (p=0.05).Sonuç: Sonuç olarak bu çalışma Türk gastrointestinal stromal tümör olgularının moleküler sonuçlarının sunulduğu ilk çalışmadır. Olgularımız diğer çalışmalarla karşılaştırıldığında farklı mutasyon eğilimlerine sahiptir ve bu durum kanser yönetiminde genotipleme araçlarının kullanılması ile yoğunlaşan bireyselleştirilmiş tıbbın önemini açığa çıkarmaktadır. Gastrointestinal stromal tümörlerde tümör davranışı ile ilişkili moleküler özelliklerin tanımlanması tanı ve sağaltım süreçlerinin yönetiminde önemlidir

Abstract

Objectives: The c-kit proto-oncogene (KIT) exon 9, 11, 13 and 17 activation mutations are associated with clinical behaviour in gastrointestinal stromal tumors with highly variable biological behaviour. The purpose of this study is to determine the frequency of KIT gene exon 9, 11, 13 and 17 mutations and associate them with histopathologic features for the first time in the Turkish population.Materials and Methods: DNAs were isolated from formalin fixed paraffin embedded tumour tissues of sixty patients diagnosed with gastrointestinal stromal tumor between 2006 and 2010, by spin column method. Isolated DNAs were sequenced by DNA sequencing system based on capillary electrophoresis for the presence of mutations in KIT gene exons 9, 11, 13 and 17.Results: KIT mutations frequencies determined for exon 9, 11, 13 and 17 were 8.3%, 47.5%, 11.7% and 1.7%, respectively. Correlation analysis revealed the presence of overall mutations and exon 11 mutations of males to be higher than those of females (p=0.004 and p=0.003). Small intestine tumor mutation frequency was higher than gastric tumors (p=0.05).Conclusion: This study represents the first mutational results from Turkish gastrointestinal stromal tumor patients. Our cases showed different mutational trends when compared to other reports, indicating the significance of personalized medicine, which could be intensified by the use of genotyping tools in cancer management. Redefining the molecular features associated with tumor behaviour is important for management of diagnostic and therapeutic processes in gastrointestinal stromal tumors

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ÇALIBAŞI, G., ÖZTOP, İ., YILMAZ, U., SAĞOL, Ö., ATİLA, K., BASKIN, Y., ELLİDOKUZ, H. (2022). Gastrointestinal stromal tümörlerde c-kit proto-onkogeni (KIT) mutasyon sıklıkları: Türkiye’nin Ege Bölgesi kaynaklı populasyon çalışması. Türk Biyokimya Dergisi, Cilt: 38 - Sayı: 1, 5–12. https://ajindex.com/articles/621263

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (13)

  1. Hirota S, Isozaki K, Moriyama Y, Hashimoto K, Nishida T, et al. Gain-of-function mutations of KIT in human gastrointestinal stromal tumors. Science 1998; 279:577-80
  2. Nilsson B, Bumming P, Medis-Kindblom JM, Oden A, Dortok A, et al. Gastrointestinal stromal tumours: The incidence, prevalence, clinical course, and prognostication in the preimatinib mesylate era-A population-based study in western Sweden. Cancer 2005; 103:821-829
  3. Tryggvason G, Gislason HG, Magnusson MK, Jonasson JG. Gastrointestinal stromal tumors in Iceland, 1990–2003: The Icelandic GIST study, a population-based incidence and pathologic risk stratification study. Int J Cancer 2005; 117:289-293
  4. Miettinen M, Lasota J. Histopathology of Gastrointestinal Stromal Tumor. Journal of Surgical Oncology 2011; 104:865–873
  5. Gomes AL, Gouveia A, Capelinha AF, de la Cruz D, Silva P, et al. Molecular alterations of KIT and PDGFRA in GISTs: evaluation of a Portuguese series. J Clin Pathol 2008; 61(2):203-8
  6. Braconi C, Bracci R, Bearzi I, Bianchi F, Costagliola A, et al. KIT and PDGFRalpha mutations in 104 patients with gastrointestinal stromal tumors (GISTs): a population-based study. Ann Oncol 2008; 19(4):706-10
  7. Roskoski R. Structure and regulation of Kit protein-tyrosine kinase-the stem cell factor receptor. Biochem Biophys Res Commun 2005; 338:1307-15
  8. Ronnstrand L. Signal transduction via the stem cell factor receptor/KIT. Cell Mol Life Sci 2004; 61:2535-48
  9. Miettinen M, Lasota J. Gastrointestinal stromal tumors: review on morphology, molecular pathology, prognosis, and differential diagnosis. Arch Pathol Lab Med 2006; 130:1466-78
  10. Tamborini E, Bonadiman L, Greco A, Albertini V, Negri T, et al. A new mutation in the KIT ATP pocket causes acquired resistance to imatinib in a gastrointestinal stromal tumor patient. Gastroenterology 2004; 127:294-9
  11. Tornillo L, Terracciano LM. An update on molecular genetics of gastrointestinal stromal tumours. J Clin Pathol 2006; 59:557-63
  12. Joensuu H, Ronald P. DeMatteo RP. The Management of Gastrointestinal Stromal Tumors: A Model for Targeted and Multidisciplinary Therapy of Malignancy. Annu. Rev Med 2012; 63:10.1-10.12 [13] Antonescu CR, Sommer G, Sarran L, Tschernyavsky SJ, Riedel E, et al. Association of KIT exon 9 mutations with nongastric primary site and aggressive behavior: KIT mutation analysis and clinical correlates of 120 gastrointestinal stromal tumors. Clin Cancer Res 2003; 9(9):3329-37
  13. Ernst SI,