KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Hacettepe Journal of Biology and Chemistry / 2018 / Cilt: 46 - Sayı: 3

Yeni Urasil Türevi Organik Bir Molekülün Sentezi, Yapısal Hesaplamaları ve Moleküler Modelleme Çalışmaları

Synthesis, Structural Calculations and Molecular Docking Studies of a Novel Uracil Derived Organic Molecule

Gamze KOZ
Sayfa
373–380
Yayın Tarihi
2022-10-17
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bileşiğin, molekül orbitalleri ve kimyasal reaktivite parametreleri gibi fizikokimyasal özellikleri incelendi.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Urasil türevi yeni bir bileşik, (E)-5-((3-klor-2-hidroksibenziliden)amino)pirimidin-2,4 (1H,3H)-dion, sentezlendi ve spektroskopik yöntemler kullanılarak yapı tayini gerçekleştirildi.
📊
Temel Bulgular & Veri:Molekülün DNA ile olan etkileşimi, bilgisayar destekli yöntemler ile araştırıldı ve oluk bağlayıcı olarak davranabileceği belirlendi.
💡
Sonuç & Katkı:Bileşiğin, molekül orbitalleri ve kimyasal reaktivite parametreleri gibi fizikokimyasal özellikleri incelendi.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Urasil türevi yeni bir bileşik, (E)-5-((3-klor-2-hidroksibenziliden)amino)pirimidin-2,4 (1H,3H)-dion, sentezlendi ve spektroskopik yöntemler kullanılarak yapı tayini gerçekleştirildi. Molekülün DNA ile olan etkileşimi, bilgisayar destekli yöntemler ile araştırıldı ve oluk bağlayıcı olarak davranabileceği belirlendi. Bileşiğin, molekül orbitalleri ve kimyasal reaktivite parametreleri gibi fizikokimyasal özellikleri incelendi.

Abstract

Anovel uracil derived compound, (E)-5-((3-chloro-2-hydroxybenzylidene)amino) pyrimidine-2,4(1H,3H)- dione, was synthesized and characterized using spectroscopic techniques. The interaction of the molecule with DNA was explored using computational methods which revealed that the molecule could act as a groove binder. The physicochemical properties of the molecule such as frontier molecule orbitals and chemical reactivity parameters were also investigated.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

KOZ, G. (2022). Yeni Urasil Türevi Organik Bir Molekülün Sentezi, Yapısal Hesaplamaları ve Moleküler Modelleme Çalışmaları. Hacettepe Journal of Biology and Chemistry, Cilt: 46 - Sayı: 3, 373–380. https://ajindex.com/articles/529057

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (5)

  1. Y. Kaya, V. T. Yilmaz, T. Arslan, O. Buyukgungor, Experimental and theoretical DFT studies of structure, spectroscopic and fluorescence properties of a new imine oxime derivative, Journal of Molecular Structure, 1024 (2012) 65-72.
  2. O. Trott, A. J. Olson, AutoDock Vina: Improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization, and multithreading, J. Comput. Chem., 31 (2010) 455. S. Jaime-Figueroa, A. Zamilpa, A. Guzma´n, D. J. Morgans,Jr., N-3-Alkylation of uracil and derivatives via N-1-boc protection, Synthetic Communications, 31 24 (2001) 3739-3746.
  3. R. Satheeshkumar, R. Shankar, W. Kaminsky, S. Kalaiselvi, V.V. Padma, K.J.R. Prasad, Theoretical and experimental investigations on molecular structure of 7-chloro-9-phenyl-2,3-dihydroacridin-4(1H)-one with cytotoxic studies, J. Mol. Struct. 1109 (2016) 247. T. J. Beaula, P. Muthuraja, M. Sethuram, M. Dhandapani, V.K. Rastogi, V. Bena Jothy, Biological and spectral studies of O-Tolyl Biguanide: Experimental and theoretical approach, J. Mol. Struct. 1128 (2017) 290. R. G. Parr, L. Szentpaly, S. Liu, Electrophilicity Index, J. Am. Chem. Soc.,121 (1999) 1922.
  4. R. G. Pearson, The electronic chemical potential and chemical hardness, Journal of molecular Structure: Theochem, 255 (1992) 261. A.D. Becke, Density functional thermochemistry III, The role of exact Exchange, J. Chem. Phys., 98, (1993), 5648-5652.
  5. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, Jr. J. A. Montgomery, T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, O. D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. AlLaham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. C. Wong, C. Gonzalez, J. A. Pople, Gaussian 03, Revisi