KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Hacettepe Journal of Biology and Chemistry / 2019 / Cilt: 47 - Sayı: 2

Naproksen Türevi ile ct-DNA’nın Etkileşim Özellikleri

Naproxen Derivative Interaction Properties with ct-DNA

Tuğba TAŞKIN TOK
Nuriye AKBAY
Zeynep KÖKSAL
Ayşe UZGOREN BARAN
Sayfa
177–184
Yayın Tarihi
2022-10-17
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Deneysel sonuçlar, naproksen türevi ile ct-DNA arasında oluğa bağlanma sonucunda statik sönüm gerçekleştiğini ortaya koymuştur.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Naproksenin bir türevi (NH) ile ct-DNA’nın etkileşim türü absorpsiyon ve floresans spektroskopisi ile incelendi.
📊
Temel Bulgular & Veri:Hesaplamalı yöntemler de etkileşimin daha detaylı anlaşılması için kullanılmıştır.
💡
Sonuç & Katkı:Deneysel sonuçlar, naproksen türevi ile ct-DNA arasında oluğa bağlanma sonucunda statik sönüm gerçekleştiğini ortaya koymuştur.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Naproksenin bir türevi (NH) ile ct-DNA’nın etkileşim türü absorpsiyon ve floresans spektroskopisi ile incelendi. Deneysel sonuçlar, naproksen türevi ile ct-DNA arasında oluğa bağlanma sonucunda statik sönüm gerçekleştiğini ortaya koymuştur. Hesaplamalı yöntemler de etkileşimin daha detaylı anlaşılması için kullanılmıştır. Moleküler kenetlenme hesaplamaları, NH ve ct-DNA arasındaki etkileşimin oluğa tutunma üzerinden olduğunu göstermiştir. Spektral verilere ek olarak, kenetlenme çalışmaları NH-A_DNA ve NH-B_DNA komplekslerinin her bir DNA izomerine özgü farklı etkileşim ve konformasyon eğilimlerine sahip olduğunu göstermiştir.

Abstract

Interaction mode of a naproxen derivative (NH) with ct-DNA was explored by absorption and fluorescence spectroscopy.The experimental results revealed the static quenching as a result of groove binding between the naproxen derivativeand ct-DNA. Computational studies were carried out to a deeper understanding of the interactions. Molecular dockingcalculations showed that the interaction between NH and ct-DNA is resulted by groove binding. In addition to spectral data,docking studies revealed that NH-A_DNA and NH-B_DNA complexes had different interaction and conformational trendsto each DNA isomer.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

TOK, T. T., AKBAY, N., KÖKSAL, Z., BARAN, A. U. (2022). Naproksen Türevi ile ct-DNA’nın Etkileşim Özellikleri. Hacettepe Journal of Biology and Chemistry, Cilt: 47 - Sayı: 2, 177–184. https://ajindex.com/articles/527417

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (13)

  1. M.A. Husain, Z. Yaseen, S.U. Rehman, T. Sarwar, and M. Tabish, Naproxen Intercalates with DNA and Causes Photocleavage Through ROS Generation, The FEBS Journal, 24 (2013) 65 69–6580
  2. K. Gurova, New hopes from old drugs: revisiting DNAbinding small molecules as anticancer agents, Future Oncol., 5 (2009) 1685–1704
  3. D.R. Boer, A. Canals, and M. Coll, DNA-binding drugs caught in action: the latest 3D pictures of drug-DNA complexes, Dalton Trans., 3 (2009) 399-414
  4. U. Pindur, M. Jansen, and T. Lemster, Advances in DNAligands with groove binding, intercalating and/or alkylating activity: chemistry, DNA-binding and biology, Curr. Med. Chem., 12 ( 2005) 2805-2847
  5. L. Strekowskı and B. Wılson, Noncovalent interactions with DNA: an overview, Mutat Res-Fund Mol M., 623 (2007) 3–13
  6. J. Li, B. Li, Y. Wu, S. Shuang, C. Dong, and M. Choi, Luminescence and binding properties of two isoquinoline alkaloids chelerythrine and sanguinarine with ctDNA, Spectrochim Acta A Mol. Biomol. Spectrosc., 95 (2012) 80–85
  7. Y. Temerk, M. Ibrahim, H. Ibrahim, and M. Kotb, Interactions of an anticancer drug Formestane with single and doublestranded DNA at physiological conditions, J. Photochem. Photobiol. B., 149 (2012) 27–36
  8. L. J. Marnett and A. S. Kalgutkar, Design of selective inhibitors of cyclooxygenase-2 as nonulcerogenic anti-inflammatory agents, Curr. Opin. Chem. Biol., 2 (1998) 482–490
  9. A.S. Kalgutkar, A.B. Marnett, B.C. Crews, R.P. Remmel, and L. J. Marnett, Ester and amide derivatives of the nonsteroidal antiinflammatory drug, indomethacin, as selective cyclooxygenase-2 inhibitors, J. Med. Chem., 43 (2000) 2860–2870
  10. Y.C. Kim, Y. Karton, X.D. Ji, N. Melman, J. Linden, and K. A. Jacobson, Acyl‐hydrazide derivatives of a xanthine carboxylic congener (XCC) as selective antagonists at human A2B adenosine receptors, Drug Dev. Res., 47 (1999) 178–188
  11. M. Nakka, M.S. Begum, B.F.M. Varaprasad, L.V. Reddy, A. Bhattacharya, M. Helliwell, Naproxen and ibuprofen based acyl hydrazone derivatives: Synthesis, structure analysis and cytotoxicity studies. J. Chem. Pharm. Res., 2 (2010) 393-409
  12. D. Sarigol, A. Uzgoren-Baran, B.C. Tel, E.I. Somuncuoglu, I. Kazkayasi, K. Ozadali-Sari, et al., Novel thiazolo [3, 2-b]-1, 2, 4-triazoles derived from naproxen with analgesic/antiinflammatory properties: Synthesis, biological evaluation and molecular modeling studies, Bioorg. Med. Chem., 23 (2015) 2518–2528
  13. S. Ozkan, T. Taskin Tok, A. Uzgoren Baran, and N. Akbay