Dergiler / Avrupa Bilim ve Teknoloji Dergisi / 2020 / Cilt: 0 - Sayı: 20

Bazı Gernik Buğdaylarında IPBS Retrotranspozon Markörleri Kullanılarak Genetik Çeşitlilik Analizi

Genetic Diversity of Emmer Wheats Using IPBS-RetrotranspozonMarkers

Sayfa
640–646
Yayın Tarihi
2022-10-11
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

AMOVA sonucuna göre gernik ve makarnalık buğdaylarındaki genetik çeşitlilik, popülasyoniçinde %77 varyasyona sahip olduğu tespit edilmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Toplam 21 buğday genotipi (emmer buğdayı olarak adlandırılan 16 Triticum dicoccum L. ve durum buğdayı olarak adlandırılan 5Triticum durum L.) arasındaki genetik çeşitlilik 7 iPBS primeri kullanılarak araştırılmıştır.
📊
Temel Bulgular & Veri:Mevcut çalışmada kullanılan iPBS'ler,buğday genotipleri için 136 banttan 134’ünü polimorfik olarak üretmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:AMOVA sonucuna göre gernik ve makarnalık buğdaylarındaki genetik çeşitlilik, popülasyoniçinde %77 varyasyona sahip olduğu tespit edilmiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Toplam 21 buğday genotipi (emmer buğdayı olarak adlandırılan 16 Triticum dicoccum L. ve durum buğdayı olarak adlandırılan 5Triticum durum L.) arasındaki genetik çeşitlilik 7 iPBS primeri kullanılarak araştırılmıştır. Mevcut çalışmada kullanılan iPBS'ler,buğday genotipleri için 136 banttan 134’ünü polimorfik olarak üretmiştir. Çalışmada kullanılan 7 iPBS primerinin karakterizasyonuortalama polimorfizm bilgi içeriği (PIC = 0.19), heterozigotluk (H = 0.23), polimorfizm oranı (P% = 97.92) ve polimorfizm (19.14)değerleri hesaplanarak belirlenmiştir. Jaccard'ın çeşitlilik değeri, buğday genotipleri için ortalama 0.4677 olarak hesaplanmış ve 0.0222ile 0.7843 arasında değiştiği saptanmıştır. AMOVA sonucuna göre gernik ve makarnalık buğdaylarındaki genetik çeşitlilik, popülasyoniçinde %77 varyasyona sahip olduğu tespit edilmiştir. Öte yandan, popülasyonlar arasındaki genetik varyasyon %23 değeriyle ortadüzeydeyde olduğu bulunmuştur. Popülasyonların genetik çeşitliliğini belirlemek için lokus başına ortalama alel sayısı (Na = 1.269),etkili alel sayısı (Ne = 1.31), Shannon bilgi indeksi (I = 0.29), Nei'nin genetik çeşitlilik seviyesi (h = 0.19) i parametreleri hesaplanmıştır.Ayrıca, Nei'nin tarafsız genetik çeşitlilik seviyesi (uh) 0.218 olarak saptanmıştır. Bu çalışmadan elde edilen sonuçlara göre iPBSmoleküler markörlerinin buğday genotipleri arasındaki genetik ilişkilerin belirlenmesinde faydalı olabileceğini göstermiştir.

Abstract

The genetic diversity among totally 21 wheat genotypes (16 Triticum dicoccum L. called emmer wheat and 5 Triticum durum L. calleddurum wheat) were investigated using 7 iPBS primers. iPBSs used in the current study generated 134 polymorphic from out of 136bands for wheat genotypes. Characterization of the iPBS primers were performerd by calculation meanpolymorphism informationcontent (PIC= 0.19), heterozygosity (H= 0.23), polymorphism ratio (P%= 97.92) and number of average polymorphic (19.14). Jaccard'sdiversity index varied between 0.0222 and 0.7843 with a mean 0.4677 for wheat genotypes. According to the sum of AMOVA, geneticdiversity in emmer and durum wheats was significantly high with 77% variation within the population. On the other hand, geneticvariation among populations was moderate with a value of 23%. Genetic diversity of populations were calculated by parametersincluding the mean number of alleles per locus (Na=1.269), effective allele number (Ne=1.31), Shannon information index (I=0.29),Nei’s genetic diversity level (h=0.19), and Nei’s unbiased genetic diversity level (uh=0.218). Results obtained from this study showedthat iPBS molecular markers could be useful in determination of genetic relationships among wheat genotypes.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

DEMİREL, F. (2022). Bazı Gernik Buğdaylarında IPBS Retrotranspozon Markörleri Kullanılarak Genetik Çeşitlilik Analizi. Avrupa Bilim ve Teknoloji Dergisi, Cilt: 0 - Sayı: 20, 640–646. https://ajindex.com/articles/457841

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (9)

  1. Ali, F., Yılmaz, A., Nadeem, M. A., Habyarimana, E., Subaşı, I., Nawaz, M. A.,. & Chung, G. (2019). Mobile genomic element diversity in world collection of safflower (Carthamus tinctorius L.) panel using iPBS-retrotransposon markers. PloS one, 14(2), e0211985.
  2. Andeden, E. E., Baloch, F. S., Derya, M., Kilian, B., & Özkan, H. (2013). iPBS-Retrotransposons-based genetic diversity and relationship among wild annual Cicer species. Journal of Plant Biochemistry and Biotechnology, 22(4), 453-466.
  3. Arystanbekkyzy, M., Nadeem, M. A., Aktas, H., Yeken, M. Z., Zencirci, N., Nawaz, M. A.,. & Baloch, F. S. (2019). Phylogenetic and taxonomic relationship of turkish wild and cultivated emmer (Triticum turgidum ssp. dicoccoides) revealed by iPBSretrotransposons markers. International Journal of Agriculture and Biology, 21(1), 155-63.
  4. Baloch, F. S., Alsaleh, A., de Miera, L. E. S., Hatipoğlu, R., Çiftçi, V., Karaköy, T.,. & Özkan, H. (2015). DNA based iPBSretrotransposon markers for investigating the population structure of pea (Pisum sativum) germplasm from Turkey. Biochemical Systematics and Ecology, 61, 244-252.
  5. Boczkowska, M., Nowosielski, J., Nowosielska, D., & Podyma, W. (2014). Assessing genetic diversity in 23 early Polish oat cultivars based on molecular and morphological studies. Genetic Resources and Crop Evolution, 61(5), 927- 941. Borna, F., Luo, S., Ahmad, N. M., Nazeri, V., Shokrpour, M., & Trethowan, R. (2017). Genetic diversity in populations of the medicinal plant Leonurus cardiaca L. revealed by interprimer binding site (iPBS) markers. Genetic Resources and Crop Evolution, 64(3), 479-492.
  6. Burkhamer, R. L., Lanning, S. P., Martens, R. J., Martin, J. M., & Talbert, L. E. (1998). Predicting progeny variance from parental divergence in hard red spring wheat. Crop Science, 38(1), 243-248.
  7. Carvalho, A., Lima-Brito, J., Maçãs, B., & Guedes-Pinto, H. (2009). Genetic diversity and variation among botanical varieties of old Portuguese wheat cultivars revealed by ISSR assays. Biochemical Genetics, 47(3-4), 276-294.
  8. Dashchi, S., Abdollahi Mandoulakanı, B., Darvishzadeh, R., & Bernousi, I. (2012). Molecular similarity relationships among Iranian bread wheat cultivars and breeding lines using ISSR markers. Notulae Botanicae Horti Agrobotanici ClujNapoca, 40(2), 254-260.
  9. Demirel, U., Tindas, I., Yavuz, C., Baloch, F. S., & Çaliskan, M. E. (2018). Assessing genetic diversity of potato genotypes using inter-PBS retrotransposon marker system. Plant Genetic Res