Y-kromozomu 17 STR marklrlnln T'Lirkiye’deki polimorfizmi

Moleküler varyans analiz[AMOVA] sonuçları YHRD çevrimiçi araçları kullanılarak RSTşeklinde değerlendirildi.BULGULAR: Türkiye popülasyonunda 218 örnekte aynı haplotiperastlanmadı.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯

Amaç & Hipotez:AMAÇ: Adli araştırmalarda, erkek ve kadın DNA örnekleri genelliklekarışım halde bulunurlar.

📊

Temel Bulgular & Veri:Bu çalışmanın amacı Türkiye populasyonunaait homojen dağılımın gösteren bir Y-STR haplotip veritabanını oluşturmak ve diğer dünya popülasyonlarında öncedenyapılmış Y-STR sonuçlarıyla karşılaştırmaktır.YONTEM: Kan veya ağız içi sürüntü örnekleri 218 sağlıklı,aralarında akrabalık ilişkisi bulunmayan ve çalışmaya gönüllükatılmayı kabul eden Türkiye'deki erkek bireylerden alınmıştır.17 Y-STR lokuslarının haplotip ve alel sıkılıkları AmpFlSTR® YfilerTMPCR Amplification Kiti kullanılarak çoğaltıldı ve ABI 3130cihazında analiz edildi.

💡

Sonuç & Katkı:Moleküler varyans analiz[AMOVA] sonuçları YHRD çevrimiçi araçları kullanılarak RSTşeklinde değerlendirildi.BULGULAR: Türkiye popülasyonunda 218 örnekte aynı haplotiperastlanmadı.

🔬Tür:Laboratuvar & Saha Deneyi

📍Kapsam:218 örnek

⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

AMAÇ: Adli araştırmalarda, erkek ve kadın DNA örnekleri genelliklekarışım halde bulunurlar. Bu tür örneklerin tiplendirilmesindeY-STR kullanılmaktadır. Bu çalışmanın amacı Türkiye populasyonunaait homojen dağılımın gösteren bir Y-STR haplotip veritabanını oluşturmak ve diğer dünya popülasyonlarında öncedenyapılmış Y-STR sonuçlarıyla karşılaştırmaktır.YONTEM: Kan veya ağız içi sürüntü örnekleri 218 sağlıklı,aralarında akrabalık ilişkisi bulunmayan ve çalışmaya gönüllükatılmayı kabul eden Türkiye'deki erkek bireylerden alınmıştır.17 Y-STR lokuslarının haplotip ve alel sıkılıkları AmpFlSTR® YfilerTMPCR Amplification Kiti kullanılarak çoğaltıldı ve ABI 3130cihazında analiz edildi. Gen ve haplotip alel sıklıkları ArlequinSoftware 3.01 kullanılarak hesaplandı. Moleküler varyans analiz[AMOVA] sonuçları YHRD çevrimiçi araçları kullanılarak RSTşeklinde değerlendirildi.BULGULAR: Türkiye popülasyonunda 218 örnekte aynı haplotiperastlanmadı. En yüksek gen çeşitliliği DYS385 /b lokusundagörülürken ve en düşük DYS391 lokusunda gözlendi. Çalışılanpopülasyona en yakın popülasyonlar sırasıyla Güneydoğu Anadolu,Kıbrıslı Türkler ve Çukurova popülasyonları oldu.SONUÇ: Bu çalışma, adli uygulamalarda kullanılan yüksekayrım gücüne sahip ve 17 Y-STR lokusunun Türk popülasyonunaait son verilerini içermektedir.

Abstract

OBJECTIVE: Y- STR typing is useful forensic investigation tool as it often involves mixture of male and female DNA. The aims of the present study were to type 17 Y-STR loci in order to establish proper Y-STR haplotype database with homogenous distribution of the Turkish population and compare our results with previously published Y-STR researches about Turkish and other worldwide populations. METHODS: The blood or buccal swab samples were collected from 218 healthy, unrelated male individuals in Turkey with their informed consent. DNA samples were amplified using the 17 YSTR loci AmpFlSTR Y-filer Amplification Kit and analyzed on ABI 3130 [both Applied Biosystems]. Haplotype frequencies were estimated by gene counting. Gene haplotype diversities and allele frequencies were calculated using the Arlequin Software 3.01. Analyses of Molecular Variance [AMOVAI results were assessed in the form of RST values using the YHRD online tool. RESULTS: Among 218 samples of Turkey dataset, all of the haplotypes were unique. The highest gene diversity was determined at DYS385 and the lowest was at DYS391 locus. The closest populations were Southeastern Anatolia, Turkish Cypriot and Cukurova populations respectively. CONCLUSION: This study indicates recent population data of 17 YSTR markers in Turkish population with high discrimination power for forensic applications.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

BÜLBÜL, Ö., FİLOĞLU, G., ALTUNCUL, H., ZORLU, T., MERTOĞLUZ, E., RAYİMOĞLUL, G., SALİH, C. (2022). Y-kromozomu 17 STR marklrlnln T'Lirkiye’deki polimorfizmi. Adli Tıp Dergisi, Cilt: 30 - Sayı: 3, 216–220. https://ajindex.com/articles/428709

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

Yeni Sekmede Aç ↗

↗Yeni Sekme

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (13)

Aras B, Polat RK. Turkey and the Middle East: frontiers of the new geographic imagination. Australian Journal of Inter— national Affairs 2007; 61[4]:471—88
Kaya |. Social Theory and Later Modernities: The Turkish Experience. Liverpool University Press. 2004;57—8
Underhill PA, Kivisild T. Use of chromosome and mito— chondrial DNA population structure in tracing human migra— tions. Annu Rev Genet 2007;41:539—64
Roewer L, Kayser M, de Knijff P, Anslinger K, Betz A, Caglia A, Corach D, Füredi S, Henke L, Hidding etal. new method for the evaluation of matches in non—recombining genomes: application to Y—chromosomal short tandem repeat [STR] hap— lotypes in European males. Forensic Sci Int 2000;114:31—43
Roewer L, Krawczak M, Willuweit S, Nagy M, Alves C, Amor— im A, Anslinger K, Augustin C, Betz A, Bosch et al. Online ref— erence database of European Y—chromosomal short tandem repeat [STR] haplotypes. Forensic Sci Int 2001;1 18:103—11
Walsh PS, Metzger DA, Higuchi R. Chelex 100 as medium for simple extraction of DNA for PCR—based typing from fo— rensic material. Biotechniques 1991;10[4]:506—13
Gusmâo L, Butler JM, Carracedo A, Gill P, Kayser M, Mayr WR, Morling N, Prinz M, Roewer L, Tyler—Smith et al. DNA Commission of the International Society of Forensic Genet— ics [ISFG]: an update of the recommendations on the use of Y—STRs in forensic analysis. Forensic Sci Int 2006;157:187—97
Nei M. Molecular Evolutionary Genetics, Columbia Univer— sity Press, New York,1987;176—9
Kovatsi L, Saunier J, Irwin JA. Population genetics of Y— chromosome STR5 in population of Northern Greeks. Fo— rensic Sci Int Genetics 2009;4[1]:eZ1—2
Fernandes AT, Gonçalves R, Gomes S, Filon D, Nebel A, Faerman M, Brehm A. Y—chromosomal STRs in two popula— tions from Israel and the Palestinian Authority Area: Christian and Muslim Arabs. Forensic Sci Int Genet 2011 Nov;5[5]:561—2
Budowle B, Ge J, Aranda XG, Planz JV, Eisenberg AJ, Chakraborty R. Texas population substructure and its impact on estimating the rarity of STR haplotypes from DNA evi— dence. Forensic Sci 2009;54[5]:1016—21
Coble MD, Hill CR, Butler JM. Haplotype data for 23 Y— chromosome markers in four U.S. population groups Foren— sic Sci Int Genet 2013;7[3]:e66—8
Jakovski Z, Nikolova K, Jankova Ajanovska R, Marjanovic D, Pojskic N, Janeska B. Genetic data for 17 Y—chromosomal STR loci in Macedonians in the Republic of Macedonia, Foren— sic Sci Int Genet 2011;5[4]:e108—11. 14.