KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Sinop Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi / 2022 / Cilt: 7 - Sayı: 1

Fasulye Tohumlarında Fasulye Adi Mozayik Virüsü’nün Immunocapture RT-PCR ve DAS-ELISA Yöntemleriyle Teşhisi

Detection of Bean Common Mosaic Virus in Bean Seeds by Immunocapture RT-PCR and DAS-ELISA Methods

Handan ÇULAL KILIÇ
Ahmet ÇAT
Sayfa
1–7
Yayın Tarihi
2022-06-29
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

IC-RT-PCR yönteminde spesifik primerler ile kılıf protein geninin yaklaşık 850 bp’lik bir kısmı amplifiye edilmiş ve BCMV’ne özgü beklenen seviyede bant elde edilmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Bu çalışmada, 2016 yılında Isparta ve Antalya illerinde fasulye tohumlarında Fasulye adi mozayik virüsü (Bean common mosaic virus: BCMV)’nün belirlenmesi amacıyla yapılmıştır.
📊
Temel Bulgular & Veri:Bu amaçla araştırma alanından 106 tohum örneği toplanmıştır.
💡
Sonuç & Katkı:IC-RT-PCR yönteminde spesifik primerler ile kılıf protein geninin yaklaşık 850 bp’lik bir kısmı amplifiye edilmiş ve BCMV’ne özgü beklenen seviyede bant elde edilmiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:2016 · 93 örnek
⚙️Değişkenler:BCMV · fasulye · tohum

Özet

Bu çalışmada, 2016 yılında Isparta ve Antalya illerinde fasulye tohumlarında Fasulye adi mozayik virüsü (Bean common mosaic virus: BCMV)’nün belirlenmesi amacıyla yapılmıştır. Bu amaçla araştırma alanından 106 tohum örneği toplanmıştır. Tohum örnekleri biyolojik, serolojik ve moleküler çalışmalar için kullanılmıştır. DAS-ELISA testi sonucunda tohum örneklerinde BCMV’nün hastalık oranı %87.73 olarak belirlenirken, Immunocapture ters transkripsiyon polimeraz zincir reaksiyonu (IC-RT-PCR) yönteminde örneklerdeki hastalık oranı %90.56 olarak belirlenmiştir. Yürütülen çalışmalar sonucunda toplam 96 tohum örneğinde (%90.56) BCMV belirlenmiştir. DAS-ELISA yöntemi ile 93 örnek BCMV ile pozitif belirlenirken; IC-RT-PCR yöntemi ile 96 örnek BCMV ile enfekteli bulunmuştur. IC-RT-PCR yönteminde spesifik primerler ile kılıf protein geninin yaklaşık 850 bp’lik bir kısmı amplifiye edilmiş ve BCMV’ne özgü beklenen seviyede bant elde edilmiştir.

Abstract

This study was carried out in bean seeds in Isparta and Antalya provinces to determine Bean common mosaic virus (BCMV) in 2016. For this purpose; 106 seed samples were collected from the research area. Seed samples were used for biological, serological, and molecular methods. The virus incidence, as a percentage of seeds samples for BCMV, was found 87.73% by DAS-ELISA and 90.56% by Immunocapture Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction (IC-RT-PCR) methods. As a result of the study, BCMV was detected in a total of 96 (90.56%) seed samples. 93 samples were detected positive with the DAS-ELISA method, while 96 samples were found to be infected with BCMV using the IC-RT-PCR method. In the IC-RT-PCR method, approximately 850 bp of the coat protein gene was amplified with specific primers and BCMV specific bands were obtained at the expected levels.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

KILIÇ, H. Ç., ÇAT, A. (2022). Fasulye Tohumlarında Fasulye Adi Mozayik Virüsü’nün Immunocapture RT-PCR ve DAS-ELISA Yöntemleriyle Teşhisi. Sinop Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi, Cilt: 7 - Sayı: 1, 1–7. https://ajindex.com/articles/415060

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (8)

  1. Loebenstein, G., & Thottappilly, G. (2004). Virus and virus-like diseases of major crops in developing countries. Dordrecht, Kluwer Academic Publishing. 840. TUIK (2016, October). Crop Production Statistics. http://tuikrapor.tuik.gov.tr/reports.
  2. Nyvall, R.F. (1989). Field Crop Diseases Handbook. New York, Van Nostrand Reinhold, 791. Matthews, R.E.F. (1991). Plant Virology. Academic Press Publishing. Kumar, C. A., Khetarpal, R. K., Parakh, D.B., Singh, S., & Nath, R. (1994). In Check list on seed transmitted viruses, Leguminous hosts. National Bureau of Plant Genetic Resources, New Delhi. Guzel, O., & Arli-Sökmen, M. (2003). Determination of some viruses infecting common bean (Phaseolus vulgaris L.) and their incidences in seed lots in Samsun Province. Journal of Turkish Phytopathology, 32(2), 99-106.
  3. Ghorbani, S.G.M., Shahraeena, N., & Elahinia, S.A. (2010) Distribution and impact of virus associated diseases of common bean (Phaseolus vulgaris L.) in Northern Iran, Archives of Phytopathology and Plant Protection, 43(12), 1183–1189. https://doi.org/: 10.1080/03235400802366834 Omar, R. A, Mehiar, F. F., Zayed, E., & Deit, A. A. (1985). Biological studies on some seed-borne viruses and their effect on vegetative growth and yield component of the host plant, Acta Phytopathologica Academiae Scientiarum Hungaricae, 20(3), 80-85.
  4. Drijfhout, E., & Morales, F. J. (2005). Compendium of bean diseases. In H. Schwartz, J.R. Steadman, R. Hall & R.L. Foster, (Ed), Bean mosaic virus, (pp. 63–64).
  5. Fidan, U., & Yorganci, U. (1990). Investigation on the detection and seed transmission of the virus diseases occuring on the pulse crops in Aegean Region. Seed transmission of virus diseases by grower seeds and seeds of artificial infected pulse crops, Journal of Turkish Phytopathology, 19(1), 1-6.
  6. Kutluk-Yilmaz, N.D., Gumus, M., & Erkan, S. (2002). Studies on determination of virus diseases in the seeds of bean from Tokat Province. Ege University, Journal of Agriculture Faculty, 38(3), 49-55.
  7. Naghavi, A., Habibi M.K., & Firouzabadi, F. N. (2008). Detection and identification of some soybean viral mosaic viruses, using molecular techniques in Lorestan Province, Southwest of Iran, Asian Journal of Plant Science, 7(6), 557-562. https://doi.org/ 10.3923/ajps.2008.557.562 Bhadramurthy, V., & Bhat, A.I. (2009). Biological and molecular characterization of Bean common mosaic virus associated with vanilla in India. Indian Journal of Virology, 20(2), 70-77.
  8. Udayashankar, A.C., Chandra-Na