KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi / 2021 / Cilt: 32 - Sayı: 2

Geçmişten günümüze Türkiye’de dolaşımda olan Canine adenovirus tip 2 suşlarının genetik incelemesi

Genetic analysis of Canine adenovirus type 2 strains circulating in Turkey from past to present

Fahriye SARAÇ
Veli GÜLYAZ
Mustafa HASÖKSÜZ
Serdar UZAR
İrem GÜLAÇTI
Esra SATIR
Pelin TUNCER-GÖKTUNA
Eray ATIL
Sayfa
111–117
Yayın Tarihi
2021-12-30
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bu çalışma, Türkiye CAV-2 suşları arasındaki olası genetik heterojeniteye dikkat çekmektedir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Canine adenoviruslar (CAV) hem evcil hem de vahşi yaşamda köpek ve tilkilerde enfeksiyona neden olabilmektedir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Canine Adenovirus Tip-1 (CAV-1) infectious canine hepatitis (ICH) enfeksiyonuna ve Canine Adenovirus Tip-2 (CAV-2) infectious canine laryngotracheitis enfeksiyonuna neden olmaktadır.
💡
Sonuç & Katkı:Bu çalışma, Türkiye CAV-2 suşları arasındaki olası genetik heterojeniteye dikkat çekmektedir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:2011 · 32 adet
⚙️Değişkenler:Canine adenovirus tip 2 · moleküler karakterizasyon · virus izolasyonu

Özet

Canine adenoviruslar (CAV) hem evcil hem de vahşi yaşamda köpek ve tilkilerde enfeksiyona neden olabilmektedir. Canine Adenovirus Tip-1 (CAV-1) infectious canine hepatitis (ICH) enfeksiyonuna ve Canine Adenovirus Tip-2 (CAV-2) infectious canine laryngotracheitis enfeksiyonuna neden olmaktadır. Virusun epidemiyolojisi çoğu bölgede yeterince net değildir. Bu amaçla Türkiye'de on yıllık süre zarfında dolaşımda olan suşlar moleküler düzeyde incelendi ve genetik bir heterojenlik olduğu görüldü. Bu incelemeyi yapabilmek için 2011 yılında ishalli barınak köpeklerinden toplanan 32 adet dışkı örneği kullanıldı. İlk olarak, MDCK hücre hattında virus izolasyonu yapıldı ve 4/32 örnekte sitopatojenik etkiler (CPE) gözlendi. İkinci olarak, CPE pozitif dört izolat CAV-2'nin E3 geni yönünden PCR ile pozitif bulundu. Sekans işlemi sonucu elde edilen diziler filogenetik ağaçta aynı alt grup altındaki diğer Türk izolatlarından farklı bir dal üzerine yerleşti. Kısmi E3 gen analizine göre, suşlar arasında yedi amino asitte değişim tespit edildi. Shannon entropi değeri ve ConSurf analizine göre tüm amino asit değişikliklerinin önemli antijenik bölgelerde meydana geldiği belirlendi. Bu çalışma, Türkiye CAV-2 suşları arasındaki olası genetik heterojeniteye dikkat çekmektedir.

Abstract

Canine adenoviruses (CAV) can infect both domestic and wild canid. Canine Adenovirus Type-1 (CAV-1) and Canine Adenovirus Type-2 (CAV-2) are the cause of infectious canine hepatitis and infectious canine laryngotracheitis, respectively. The epidemiology of the virus is not clear enough in the most territory. For this purpose, data on the virus in Turkey, which is a bridge between continents, were examined. Comparing the sequence data of strains circulated in the field over a ten-year period revealed a genetic heterogeneity. To make this comparision total of 32 fecal samples collected from shelter dogs with diarrhea in 2011 was used. Firstly, virus isolation was performed in MDCK cells and cytopathogenic effects were observed in 4/32 samples. Secondly, the supernatant of four isolates were found positive for the E3 gene of CAV-2 by PCR. Strains were placed on a different branch from other Turkish isolates under the same subgroup in the phylogenetic tree. According to partial E3 gene analysis, seven amino acid substitutions were detected between the strains. Due to Shannon entropy value and ConSurf analysis, all of them were indicated as important antigenic sites. This study pointed out the possible genetic heterogeneity among CAV-2 in Turkey.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

SARAÇ, F., GÜLYAZ, V., HASÖKSÜZ, M., UZAR, S., GÜLAÇTI, İ., SATIR, E., TUNCER-GÖKTUNA, P., ATIL, E. (2021). Geçmişten günümüze Türkiye’de dolaşımda olan Canine adenovirus tip 2 suşlarının genetik incelemesi. Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi, Cilt: 32 - Sayı: 2, 111–117. https://ajindex.com/articles/382857

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (10)

  1. Abdelmagid OY, Larson L, Payne L, Tubbs A, Wasmoen T, Schultz R R. (2004) Evaluation of the efficacy and duration of immunity of a canine combination vaccine against virulent parvovirus, infectious canine hepatitis virus, and distemper virus experimental challenges. Vet Ther. 5,:173-186.
  2. Andrukonis A, Brown KM, Hall NJ, Protopopova A. (2021) Intake vaccinations reduced signs of canine respiratory disease during an outbreak at an animal shelter. Front Vet Sci. 8,:627580. https://doi.org/10.3389/fvets.2021.627580
  3. Ashkenazy H, Erez E, Martz E, Pupko T, Ben-Tal N. (2010) ConSurf 2010: Calculating evolutionary conservation in sequence and structure of proteins and nucleic acids. Nucleic Acids Res. 38 (Web Server issue): W529–-W533. https://doi.org/10.1093/nar/gkq399
  4. Ashkenazy H, Abadi S, Martz E, Chay O, Mayrose I, Pupko T, Ben-Tal N. (2016) ConSurf 2016: An improved methodology to estimate and visualize evolutionary conservation in macromolecules. Nucleic Acids Res. 44 (W1): W344-–W350. https://doi.org/10.1093/nar/gkw408
  5. Balboni A, Verin R, Morandi F, Poli A, Prosperi S, Battilani M. (2013) Molecular epidemiology of canine adenovirus type 1 and type 2 in free-ranging red foxes (Vulpes vulpes) in Italy. Vet Mic. 162,:551-–557. https://doi.org/10.1016/j.vetmic.2012.11.015
  6. Balboni A, Mollace C, Giunti M, Dondi F, Prosperi S, Battilani M. (2014) Investigation of presence of canine adenovirus (CAV) in owned dogs in Northern Italy. Res Vet Sci. 97,:631-636. https://doi.org/10.1016/j.rvsc.2014.10.010
  7. Barthold SW, Lairmore MD, Bowen RA, Parrish CR, Hedrick RP, Saif LJ, Knowles DP, Swayne DE. (2011) Adenoviridae. In: Maclachlan NJ, Dubovi EJ. (Eeds). Fenner’s Veterinary Virology, 4Fourth edition. Academic Press, United States, pp. 203-212.
  8. Benetka V, Weissenbock H, Kudielka I, Pallan C, Rothmuller G, Mostl K. (2006) Canineadenovirus type 2 infection in four puppies with neurological signs. Vet Rec. 158,:91–-94. https://doi.org/10.1136/vr.158.3.91
  9. Bulut O, Yapici O, Avci O, Simsek A, Atli K, Dik I, Yavru S, Hasırcıoglu S, Kale M, Mamak N. (2013) The serological and virological investigation of canine adenovirus infection on the dogs. Scientific World Journal. 587024. https://doi.org/10.1155/2013/587024
  10. Buonavoglia C, Martella V. (2007) Canine respiratory viruses. Veterinary Research. 38,: 355-373. https://doi.org/ 10.1051/vetres:2006058 Can Şahna K, Aslan Ö. (2015) Köpek idrar ve plazma örneklerinde canine adenovirus (CAV) antijeninin ELISA ile araştırılması. Harr