Dergiler / Türk Tarım - Gıda Bilim ve Teknoloji dergisi / 2019 / Cilt: 7 - Sayı: 0

Genetiği Değiştirilmiş Organizmaların Tespiti ve Ölçümünde Kullanılan Farklı Gerçek Zamanlı PCR Kimyasallarının Karşılaştırılması

The Comparison of Various Real Time PCR Chemistries Used in Detection and Quantification of Genetically Modified Organisms

Sayfa
133–137
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bu çalışmada, q-PCR kimyaları ekonomikliği, verimliliği ve uygulanabilirliği açısından karşılaştırılmıştır.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Gerçek zamanlı kantitatif polimeraz zincir reaksiyonu (q-PCR), hem gen ekspresyonu analizinde hem de rutin Deoksiribo Nükleik Asit (DNA) ölçümünde nükleik asit miktarının belirlenmesi için kullanılan ileri moleküler bir yöntemdir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Gıda ve yem ürünlerinde genetiği değiştirilmiş organizma (GDO) kalıntıları için etiketleme eşiğinin Japonya’da %5, Avrupa Birliği’nde ise %0,9 olduğu göz önüne alındığında, doğru bir ölçüm metodu şarttır.
💡
Sonuç & Katkı:Bu çalışmada, q-PCR kimyaları ekonomikliği, verimliliği ve uygulanabilirliği açısından karşılaştırılmıştır.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Gerçek zamanlı kantitatif polimeraz zincir reaksiyonu (q-PCR), hem gen ekspresyonu analizinde hem de rutin Deoksiribo Nükleik Asit (DNA) ölçümünde nükleik asit miktarının belirlenmesi için kullanılan ileri moleküler bir yöntemdir. Gıda ve yem ürünlerinde genetiği değiştirilmiş organizma (GDO) kalıntıları için etiketleme eşiğinin Japonya’da %5, Avrupa Birliği’nde ise %0,9 olduğu göz önüne alındığında, doğru bir ölçüm metodu şarttır. GDO bileşenlerinin tespiti, kesin miktar tayini ve besin matrislerinde eser miktardaki kalıntısının tespit edilmesi q-PCR’da mümkündür. Bu amaçla çeşitli q-PCR kimyasalları kullanılmaktadır. Bunlar; interkalasyon boyaları, primer bazlı kimyasallar ve prob bazlı kimyasallar olarak üç gruba ayrılmaktadır. Marketlerde GDO ürünlerinin artan sayısıyla birlikte, her örnek için gerçekleştirilen analiz sayısı ve bu nedenle analiz maliyetleri artmaktadır. Bunun için GDO çalışmalarında, GDO’ların varlığının miktarını belirlemede hızlı ve ekonomik olan uygulanabilir taramalar yapılabilmesi için geliştirilmiş tespit yöntemlerine ihtiyaç duyulmaktadır. Bu çalışmada, q-PCR kimyaları ekonomikliği, verimliliği ve uygulanabilirliği açısından karşılaştırılmıştır.

Abstract

Real-time quantitative polymerase chain reaction (q-PCR) is an advanced molecular method for determining the amount of nucleic acid in both gene expression analysis and routine Deoxyribo Nucleic Acid (DNA) measurement. An accurate measurement method is essential given that the labelling threshold for genetically modified organisms (GMO) residues in food and feed products is 5% in Japan and 0,9% in the European Union. Determination of GMO components, quantification of exact amount and determination of trace amounts in food matrices are possible in q-PCR. Various q-PCR chemicals are used for this purpose. These; intercalation dyes, primary based, chemicals and probe based chemicals. With the increasing number of GMO products in the grocery stores, the number of analyses performed per sample and thus the cost of analysis increase. For this purpose, in GMO studies, improved detection methods are needed to determine the presence of GMOs in order to perform fast and economically feasible scans. In this study, q-PCR chemistries were compared in terms of cost, efficiency and applicability.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

BENER, L., ERSAL, M., YILDIZ, B. İ. (2019). Genetiği Değiştirilmiş Organizmaların Tespiti ve Ölçümünde Kullanılan Farklı Gerçek Zamanlı PCR Kimyasallarının Karşılaştırılması. Türk Tarım - Gıda Bilim ve Teknoloji dergisi, Cilt: 7 - Sayı: 0, 133–137. https://ajindex.com/articles/331017

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (5)

  1. Andersen CB, Holst-Jensen A, Berdal KG, Thorstense T, Tengs T. 2006.
  2. Equal performance of TaqMan, MGB, molecular beacon, and SYBR green-based detection assays in detection and quantification of roundup ready soybean. Journal of agricultural and food chemistry, 54(26): 9658-9663. DOI: org/10.1021/jf061987c. Arslanhan S. 2010.
  3. Türkiye, GDO ile Ekonomik ve Sosyal Açıdan Nasıl Getiri Sağlar? TEPAV Politika Notu. https://www.tepav.org.tr/upload/files/1271313864r1670.Tur kiye_GDO_ile_Ekonomik_ve_Sosyal_Acidan_Nasil_Getiri _Saglar.pdf. Broeders S, Huber I, Grohmann L, Berben G, Taverniers I, Mazzara, Morisset, D. 2014. Guidelines for validation of qualitative real-time PCR methods. Trends in Food Science & Technology, 37(2): 115-126. DOI: org/10.1016/ j.tifs.2014.03.008. Cockerill III, FR. 2003. Application of rapid-cycle real-time polymerase chain reaction for diagnostic testing in the clinical microbiology laboratory. Archives of pathology & laboratory medicine, 127(9): 1112-1120. Volume 127, Issue 9 (September 2003).
  4. Costa JM, Ernault P, Olivi M, Gaillon T, Arar K. 2004. Chimeric LNA/DNA probes as a detection system for real-time PCR. Clinical biochemistry, 37(10): 930-932. DOI: org/10.1016/ j.clinbiochem.2004.05.020. Deisingh AK, Badrie N. 2005. Detection approaches for genetically modified organisms in foods. Food Research International, 38(6): 639-649. DOI: org/10.1016/ j.foodres.2005.01.003. Duck P, Alvarado-Urbina G, Burdick B, Collier B. 1990. Probe amplifier system based on chimeric cycling oligonucleotides. Biotechniques, 9(2): 142-148. PMID:2400595. Gašparič MB, Cankar K, Žel J, Gruden K. 2008. Comparison of different real-time PCR chemistries and their suitability for detection and quantification of genetically modified organisms. BMC biotechnology, 8(1): 26. DOI:10.1186 /1472-6750-8-26. Gašparič MB, Tengs T, La Paz JL, Holst-Jensen A, Pla M, Esteve T, Gruden K. 2010. Comparison of nine different real-time PCR chemistries for qualitative and quantitative applications in GMO detection. Analytical and bioanalytical chemistry, 396(6): 2023-2029. DOI: 10.1007/s00216-009-3418-0. Hernández M, Esteve T, Prat S, Pla M. 2004. Development of real-time PCR systems based on SYBR® Green I, Amplifluor™ and TaqMan® technologies for specific quantitative detection of the transgenic maize event GA21. Journal of Cereal Science, 39(1): 99-107. DOI: org/10.1016/S0733-5210(03)00071-7.
  5. Higuchi R, Fockler, C, Dollinger G, Watson R. 1993. Kinetic PCR analysis: real-time mo