Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar
AI InsightOur study suggests that the use of ABS prior to etoposide treatment can increase the response of melanoma cell lines because of the alteration of OXPHOS genes.
📌 3 Maddede Bu Makale
Özet
The development of resistance towards chemotherapeutic drugs has become an obstacle in treatment of cancer. Ankaferd Hemostat [ABS] has shown to suppress the proliferation of melanoma cells, but little is known about its’ mechanism. In this study, we demonstrate that ABS can make some melanoma cell lines such as A2058 more sensitive towards etoposide by altering the genes involved in oxidative phosphorylation [OXPHOS] pathway. ABS treatment has shown to increase the sensitivity of A2058 towards etoposide and showed no effect for SK-MEL-5. Previously known to be more resistant to etoposide, SK-MEL-30 showed least amount of sensitivity to ABS. We found mitochondrion cluster to be the most relevant to genes altered by ABS. To validate our claim, we compared two sets of melanoma cell lines; A375 with A2058 and A375 with SK-MEL-2. The clusters that we obtained from A375 and A2058 comparison did contain mitochondrial related clusters, their corresponding p value was not significant. Whereas, the clusters from A375 and SK-MEL-2 comparison contain 72 genes in ‘oxidoreductase’ cluster with enrichment score of 2.52. To get insight of the oxidoreductase cluster, we put the genes in that cluster to Enrichr. We found that majority of the genes among oxidoreductase cluster participate in oxidative phosphorylation and electron transport chain. Our study suggests that the use of ABS prior to etoposide treatment can increase the response of melanoma cell lines because of the alteration of OXPHOS genes.
Abstract
Kemoterapötik ilaçlara karşı direnç gelişimi, kanser tedavisinde bir engel haline gelmiştir. Ankaferd Hemostat’ın (ABS), melanom hücrelerinin proliferasyonunu baskıladığı gösterilmiştir; ancak mekanizması hakkında çok az şey bilinmektedir. Bu çalışmada, ABS’nin oksidatif fosforilasyon (OXPHOS) yolağında yer alan genleri değiştirerek, A2058 gibi bazı melanom hücre dizilerini etoposide karşı daha duyarlı hale getirilebileceğini gösterdik. Bu çalışmada, ABS tedavisinin A2058’in etoposide duyarlılığını arttırdığı gösterildi, ancak SKMEL-5 için herhangi bir etki gösterilemedi. Daha önce etoposide daha dirençli olduğu bilinen SK-MEL-30, bizim çalışmamızda ABS’ye karşı en az hassasiyet gösterdi. Analizimiz sonucunda, mitokondri kümelerinin ABS tarafından değiştirilen genlerle ilişkili olduğunu gördük. İddiamızı doğrulamak için iki set melanom hücre çizgisini (A375’i A2058 ile ve A375’i SK-MEL-2 ile) karşılaştırdık. A375 ve A2058 karşılaştırmasından elde ettiğimiz kümeler mitokondriyal ilişkili kümeler içermekteydi, ancak p değerleri anlamlı değildi. Öte yandan, A375 ve SK-MEL-2 karşılaştırmasından elde edilen kümeler, 2.52 zenginleştirme skoruna sahip ‘oksidoredüktaz’ kümesinde 72 gen içermekteydi. Oksidoredüktaz kümesini analiz etmek için, bu kümedeki genleri Enrichr’e koyduk. Oksidoredüktaz kümesi içindeki genlerin çoğunun oksidatif fosforilasyona ve elektron taşıma zincirine katıldığını bulduk. Sonuç olarak bu çalışma, etoposit tedavisinden önce ABS kullanımının, OXPHOS genlerinin değişmesi nedeniyle melanom hücre çizgilerinin tepkisini artırabileceğini öne sürmektedir.