Dergiler / Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi / 2013 / Cilt: 19 - Sayı: 1

Genetic variability of CSN1S1 gene in goat populations raised in southeastern region of Turkey

Güneydoğu anadolu bölgesi’nde yetiştirilen keçilerde alfa-s1-kazein (CSN1S1) genindeki genetik çeşitlilik

Sayfa
147–152
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Çalışma sonucunda özellikle Kilis ve Şanlıurfa populasyonlarında değişik yetiştirme hedefleri açısından seleksiyon yapılabilecek düzeyde genetik çeşitliliğin bulunduğu kanaatine varılmıştır.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Bu çalışmanın amacı güneydoğu anadolu bölgesinde yetiştirilen keçilerde alfa-s1-kazeini kodlayan CSN1S1 genindeki çeşitliliğin araştırılmasıdır.
📊
Temel Bulgular & Veri:Türkiye’nin Kilis (n=60) Şanlıurfa (n=56) ve Siirt (n=55) illerinde yetiştirilen keçilerden kan örnekleri toplanmıştır.
💡
Sonuç & Katkı:Çalışma sonucunda özellikle Kilis ve Şanlıurfa populasyonlarında değişik yetiştirme hedefleri açısından seleksiyon yapılabilecek düzeyde genetik çeşitliliğin bulunduğu kanaatine varılmıştır.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:seleksiyon · Türkiye · alleller

Özet

Bu çalışmanın amacı güneydoğu anadolu bölgesinde yetiştirilen keçilerde alfa-s1-kazeini kodlayan CSN1S1 genindeki çeşitliliğin araştırılmasıdır. Türkiye’nin Kilis (n=60) Şanlıurfa (n=56) ve Siirt (n=55) illerinde yetiştirilen keçilerden kan örnekleri toplanmıştır. Kan örneklerinden fenol-kloroform yöntemi ile DNA izolasyonu yapılmıştır. Keçilerin genotipleri polimeraz zincir reaksiyonu (PCR), allel spesifik PCR ve kesim bölgesi polimorfizmi yöntemleri ile belirlenmiştir. Kilis ve Şanlıurfa populasyonlarında A*, B*, F ve N allelleri gözlenirken Siirt populasyonunda sadece A* ve B* allelleri bulunmuştur. A*, B*, F and N allellerinin frekansları sırasıyla Kilis keçilerinde 0.375, 0.367, 0.017 ve 0.242, Şanlıurfa populasyonunda 0.632, 0.208, 0.009 ve 0.151, Siirt populasyonunda ise 0.782, 0.218, 0.000 ve 0.000, rolarak hesaplanmıştır. İncelenen populasyonlarda CSN1S1 E ve 01 allelleri gözlenmemiştir. Beklenen ve gözlenen genotip frekansları arasında önemli bir farklılık bulunmamıştır (P>0.05). Çalışma sonucunda özellikle Kilis ve Şanlıurfa populasyonlarında değişik yetiştirme hedefleri açısından seleksiyon yapılabilecek düzeyde genetik çeşitliliğin bulunduğu kanaatine varılmıştır.

Abstract

The objective of this study was to investigate genetic variability of CSN1S1 gene coding for alpha-s1-casein in goat populations raised in Southeastern Region of Turkey. Blood samples were collected from goats raised in Kilis(n=60), Sanliurfa (n=56), and Siirt (n=55) provinces of Turkey. From the blood samples DNA was isolated by using phenol-chloroform extraction. Genotypes of animals were determined by using polymerase chain reaction (PCR), allele specific PCR or PCR and restriction fragment length polymorphism methods. In Kilis and Sanliurfa populations CSN1S1 A*, B*, F and N alleles were observed, while in Siirt population only A* and B* alleles were found. Frequencies of A*, B*, F and N alleles were 0.375, 0.367, 0.017 and 0.242 in Kilis, 0.632, 0.208, 0.009 and 0.151in Sanliurfa and 0.782, 0.218, 0.000 and 0.000 in Siirt populations, respectively. CSN1S1 E and 01 alleles were not observed among the populations studied. Observed and expected genotype frequencies did not differ significantly (P>0.05). The results of this study suggested that there were sufficient genetic variability of CSN1S1 gene especially in Sanliurfa and Kilis populations in order to select individuals for different breeding purposes.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

BOZKAYA, F., GÜRLER, Ş., YERTÜRK, M. (2013). Genetic variability of CSN1S1 gene in goat populations raised in southeastern region of Turkey. Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, Cilt: 19 - Sayı: 1, 147–152. https://ajindex.com/articles/272855

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (14)

  1. Haenlein GFW: Goat milk in human nutrition. Small Rumin Res, 51, 155-163, 2004
  2. Cosenza G, Paciullo A, Colimono L, D’Avino A, Mancusi A, Ramunno L: Genotyping at the CSN1S1 locus by PCR-RFLP and AS-PCR in a Neapolitan goat population. Small Rumin Res, 74, 84-90, 2008
  3. Ramunno L, Cosenza G, Rando A, Pauciullo A, Illario R, Gallo D, Berardino D, Masina P: Comparative analysis of gene sequence of goat CSN1S1 F and N alleles and characterization of CSN1S1 transcript variants in mammary gland. Gene, 345, 289-299, 2005
  4. Leroux C, Mazure N, Martin P: Mutations away from splice site recognition sequences might cis-modulate alternative splicing of goat αs1-casein transcripts. J Biol Chem, 267, 6147-6157, 1992
  5. Jansa-Perez M, Leroux C, Sanchez A, Martin P: Occurence of a LINE sequence in the 3’ UTR of the goat αs1-casein E- encoding allele associated with reduced protein synthesis level. Gene, 147, 179-187, 1994
  6. Marletta D, Criscione A, Bordonaro S, Guastella AM, D’Urso G: Casein polymorphism in goat’s milk. Lait, 87, 491-504, 2007
  7. Bevilacqua C, Ferranti P, Garro G, Veltri C, Lagonigro R, Leroux C, Pietrola E, Addeo F, Pilla F, Chianese L, Martin P: Interallelic recombination is probably responsible for the occurrence of a new αs1-casein variant found in the goat species. Eur J Biochem, 269, 1293-1303, 2002
  8. Grosclaude F, Mahe MF, Brignon G, DiStasio L, Jeunet R: A Mendelian polymorphism underlying quantitative variations of goat as1-casein. Genet Sel Evol, 19, 399-412, 1987
  9. Ramunno L, Cosenza G, Pappalardo M, Pastore N, Gallo D, Digregorio P, Masina P: Identification of the goat CSN1S1F allele by means of PCR-RFLP method. Anim Genet, 31, 342-343, 2000
  10. Cosenza G, Illario R, Rando A, Digregorio P, Masina P, Ramunno L: Molecular characterization of the goat CSN1S101 allele. J Dairy Res, 70, 237- 240, 2003
  11. Ambrosoli R, DiStasio L, Mazzocco P: Content of alphas1-casein and coagulation properties in goat milk. J Dairy Sci, 71, 24-28, 1988
  12. Clark S, Sherbon JW: Alphas1-CN, milk composition and coagulation properties of goat milk. Small Rumin Res, 38, 123-134, 2000
  13. Serradilla JM: The goat αs1-casein gene: A paradigm of the use of a major gene to improve milk quality? Options Mediteraneennes, Seminaires Mediteraneens, Serie A, 55, 99-106, 2002
  14. Chessa S, Chiatti F, Rignanese D, Ibeagha-Awemu EM, Özbeyaz C, Hassan YA, Baig MM, Erhardt G, Caroli A: The casein genes in goat breeds from different Continents: analysis by Polym