Dergiler / Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi / 2014 / Cilt: 20 - Sayı: 6

Genotypic and pathogenic Characterization of Newcastle Disease Viruses isolated from domestic ducks in China

Çin’de evcil ördeklerden izole edilen Newcastle Hastalığı Viruslarının genotipik ve patojenik karakterizasyonu

Sayfa
885–892
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bu bulgular Çin’de ördeklerdeki NDV’ün genetik ve moleküler gelişimi hakkında bilgi vermekte ve hastalığın kontrol stratejileri hakkında NDV takibinin önemini ortaya koymaktadır.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Çin’in Guangdong Bölgesindeki ördeklerde Newcastle Hastalığı Virusu (NDV) prevalansını belirlemek amacıyla evcil ördeklerden 10 NDV izole edildi.
📊
Temel Bulgular & Veri:MDT, ICPI ve F proteininin ayrılma yeri dikkate alınarak sekiz izolatın patojenik olduğu belirlendi. 10 izolatın F genlerinin sekansları yapıldı, tüm genler ve onlara ait amino asitler 32 referans türleri ile karşılaştırıldı. 5 izolat genotip VII’de toplanırken (VIId), 3 izolat genotip IX ve 2 izolat genotip olarak sınıfandırıldı.
💡
Sonuç & Katkı:Bu bulgular Çin’de ördeklerdeki NDV’ün genetik ve moleküler gelişimi hakkında bilgi vermekte ve hastalığın kontrol stratejileri hakkında NDV takibinin önemini ortaya koymaktadır.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:2006 Verileri
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Çin’in Guangdong Bölgesindeki ördeklerde Newcastle Hastalığı Virusu (NDV) prevalansını belirlemek amacıyla evcil ördeklerden 10 NDV izole edildi. MDT, ICPI ve F proteininin ayrılma yeri dikkate alınarak sekiz izolatın patojenik olduğu belirlendi. 10 izolatın F genlerinin sekansları yapıldı, tüm genler ve onlara ait amino asitler 32 referans türleri ile karşılaştırıldı. 5 izolat genotip VII’de toplanırken (VIId), 3 izolat genotip IX ve 2 izolat genotip olarak sınıfandırıldı. Subgenotip VIID izolatları 112R-R-Q-K-R-F117 motifine sahipken genotip IX izolatları 112R-R-Q-R-R-F117 motifi gösterdi. 8 NDV izolatı yüksek ICPI sergilerken bunlar NDV’nin velojenik tipi olarak sınıfandırıldı ve bu örnekler 2006 ile 2010 yılları arasında toplandı. 112G-K-Q-G-R-L117 motifine sahip olan genotip I izolatları 2005 yılında toplandı. Bunlar düşük ICPI gösterdi ve NDV’nin lentojenik tipi olarak sınıfandırıldı. Subgenotip VII’nin NDV’leri şimdi dominant olup Guangdong Bölgesindeki ördek çiftliklerinde son zamanlardaki çoğu ND salgınlarında belirlenmiştir. Bu bulgular Çin’de ördeklerdeki NDV’ün genetik ve moleküler gelişimi hakkında bilgi vermekte ve hastalığın kontrol stratejileri hakkında NDV takibinin önemini ortaya koymaktadır.

Abstract

In order to determine the prevalence of Newcaste Disease Virus (NDV) in ducks in Guangdong province of China, 10 NDVs were isolated in domestic ducks. Eight isolates were pathogenic as determined by MDT, ICPI and cleavage site of F protein. The F genes of 10 isolates were sequenced, all the genes and their deduced amino acids were compared with 32 reference strains. 5 isolates were clustered in genotype VII (VIId), 3 isolates were classified as genotype IX and 2 isolates were classified as genotype. The subgenotype VIId isolates possessed the motif 112R-R-Q-K-R-F117, and the genotype IX isolates possessed the motif 112R-R-Q-R-R-F117. The 8 NDV isolates exhibited a high ICPI, they were classified as velogenic type of NDVs and were collected between the years of 2006 and 2010. The genotype I isolates possessing the motif 112G-K-Q-G-R-L117 were collected in 2005, they were exhibited a low ICPI and were classified as lentogenic type of NDVs. The NDVs of subgenotype VII are now dominant and have been implicated in most of the recent ND outbreaks in duck farms in Guangdong province. These findings provide data on genetics and molecular evolution of NDV in ducks in China and emphasize importance of NDV surveillance for improving of strategies for the control of the disease.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

WANG, Z. X., LI, X. W., SUN, M. H., GAO, S. M., LIU, D. W., HE, J., REN, T. (2014). Genotypic and pathogenic Characterization of Newcastle Disease Viruses isolated from domestic ducks in China. Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, Cilt: 20 - Sayı: 6, 885–892. https://ajindex.com/articles/272749

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (12)

  1. Alexander DJ: Newcastle disease and other avian paramyxoviruses. Rev Sci Tech - Office International des Epizooties, 19, 443-462, 2000
  2. Werner O, Oberdorfer A, Kollner B: Characterization of avian paramyxovirus type I strains isolated in Germany during 1992 to 1996. Avian Pathol, 28, 79-88, 1999
  3. Czegledi A, Ujvari D, Somogyi E, Wehmann E, Werner O, Lomniczi B: Third genome size category of avian paramyxovirus serotype 1 (Newcastle disease virus) and evolutionary implications. Virus Res, 120, 36-48, 2006. 4. de Leeuw O, Peeters B: Complete nucleotide sequence of Newcastle disease virus: Evidence for the existence of a new genus within the subfamily paramyxovirinae. J Gen Virol, 80, 131-136, 1999
  4. Kolakofsky D, Roux L, Garcin D, Ruigrok RW: Paramyxovirus mRNA editing, the “rule of six” and error catastrophe: A hypothesis. J Gen Virol, 86, 1869-1877, 2005
  5. Steward M, Vipond IB, Millar NS, Emmerson PT: RNA editing in Newcastle disease virus. J Gen Virol, 74, 2539-2547, 1993
  6. Kim LM, King DJ, Curry PE, Suarez DL, Swayne DE: Phylogenetic diversity among low-virulence newcastle disease viruses from waterfowl and shorebirds and comparison of genotype distributions to those of poultry-origin isolates. J Virol, 81, 12641-12653, 2007
  7. Liu XF, Wan HQ, Ni XX, Wu YT, Liu WB: Pathotypical and genotypical characterization of strains of Newcastle disease virus isolated from outbreaks in chicken and goose focks in some regions of China during 1985-2001. Arch Virol, 148, 1387-1403, 2003
  8. Patti JM, Eduardo LD, Claudio LA: Newcastle disease: Evolution of genotypes and the related diagnostic challenges. Infect Genet Evol, 10, 26-35, 2010
  9. Marin MC, Villegas P, Bennett JD, Seal BS: Virus characterization and sequence of the fusion protein gene cleavage site of recent Newcastle disease virus field isolates from the southeastern United States and Puerto Rico. Avian Dis, 40, 382-390, 1996
  10. Naresh J, Yogesh C, Ashok K C, Marthade A, Patrick TR, Sagar MG: Phylogenetic analysis of Newcastle disease viruses isolated from waterfowl in the Upper Midwest Region of the United States. J Virol, 81, 12641-12653, 2007
  11. Liu XW, Wang XQ, Wu S, Hu SL, Peng Y, Xue F, Liu XF: Surveillance for avirulent Newcastle disease viruses in domestic ducks (Anas platyrhynchos and Cairina moschata ) at live bird markets in Eastern China and characterization of the viruses isolated. Avian Pathol, 38, 377-391, 2009
  12. Lee EK, Jeon WJ, Kwon JH, Yang CB, Choi KS: Molecular ep