KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi / 2015 / Cilt: 21 - Sayı: 4

The Comparative Analysis of Phenotypic and Genotypic Properties of Aeromonas sobria Strains Isolated from Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum, 1972)

Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss, Walbaum, 1972) İzole Edilen Aeromonas sobria Suşlarının Fenotip ve Genotip Yönünden Karşılaştırmalı Analizi

ALPER ÇİFTCİ
ERTAN EMEK ONUK
GÜLAY ÇİFTCİ
ARZU FINDIK
Mehtap Ünlü SÖĞÜT
TİMUR GÜLHAN
Sayfa
585–592
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Sonuç olarak, Türkiye izolatı A. sobria suşlarının fenotipik ve genotipik olarak çeşitlilik gösterdiği ve çalışmada kullanılan tiplendirme metodlarının ikili veya üçlü kombinasyonlar halinde kullanılmasının suş ayrımında daha faydalı olduğu belirlenmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Bu araştırmada Aeromonas sobria (A. sobria) izolatlarının antibiyotiplendirme, tüm hücre proteinlerinin sodyum dodesilsulfat-poliakrilamid jel electroforezi (SDS-PAGE) ile analizi, rastgele çoğaltılmış polimorfik DNA (RAPD) PCR ile genotiplendirme ile fenotipik ve genotipik karakterizasyonu amaçlanmıştır.
📊
Temel Bulgular & Veri:İzolatlar antibiyotik duyarlılık sonuçlarına göre 12 farklı antibiyotip ve SDS-PAGE profiline göre 4 farklı proteotipe sahip oldukları belirlenmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:Sonuç olarak, Türkiye izolatı A. sobria suşlarının fenotipik ve genotipik olarak çeşitlilik gösterdiği ve çalışmada kullanılan tiplendirme metodlarının ikili veya üçlü kombinasyonlar halinde kullanılmasının suş ayrımında daha faydalı olduğu belirlenmiştir.
🔬Tür:Laboratuvar & Saha Deneyi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Bu araştırmada Aeromonas sobria (A. sobria) izolatlarının antibiyotiplendirme, tüm hücre proteinlerinin sodyum dodesilsulfat-poliakrilamid jel electroforezi (SDS-PAGE) ile analizi, rastgele çoğaltılmış polimorfik DNA (RAPD) PCR ile genotiplendirme ile fenotipik ve genotipik karakterizasyonu amaçlanmıştır. Bu amaçla otuzaltı adet A. sobria izolatı incelenmiştir. İzolatlar antibiyotik duyarlılık sonuçlarına göre 12 farklı antibiyotip ve SDS-PAGE profiline göre 4 farklı proteotipe sahip oldukları belirlenmiştir. İzolatların 13 farklı genotipe sahip oldukları saptanmıştır. Sonuç olarak, Türkiye izolatı A. sobria suşlarının fenotipik ve genotipik olarak çeşitlilik gösterdiği ve çalışmada kullanılan tiplendirme metodlarının ikili veya üçlü kombinasyonlar halinde kullanılmasının suş ayrımında daha faydalı olduğu belirlenmiştir. Çalışmada elde edilen sonuçların balıklarda A. sobria infeksiyonlarının antibiyotik tedavi seçeneklerinin belirlenmesi konusunda faydalı olmakla birlikte, konu ile ilgili olarak yapılacak olan aşı ve teşhis kiti geliştirilmesi çalışmalarına öncülük edeceği düşünülmektedir.

Abstract

Phenotypic and molecular characterization of Aeromonas sobria (A. sobria) isolates by antibiotyping, sodium dodecylsulphate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) analysis of whole cell proteins, random amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction (RAPD-PCR) was aimed in this study. For this aim, thirty-six A. sobria isolates were analysed. Isolates were divided into 12 different antibiotypes and 4 proteotypes according to their antibiotic susceptibilities and SDS-PAGE patterns, respectively. Thirteen RAPD types were observed among all isolates. In conclusion, the use of double or triple combination of typing methods in this study was found to be more useful for discriminating the strains. The results obtained from this study may give information about phenotypic and genotypic variability of the A. sobria strains isolated from different regions of Turkey and can be helpful to control disease in fish through guiding the antibiotic therapy and giving information that will be useful to development vaccine.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ÇİFTCİ, A., ONUK, E. E., ÇİFTCİ, G., FINDIK, A., SÖĞÜT, M. Ü., GÜLHAN, T. (2015). The Comparative Analysis of Phenotypic and Genotypic Properties of Aeromonas sobria Strains Isolated from Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum, 1972). Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, Cilt: 21 - Sayı: 4, 585–592. https://ajindex.com/articles/272639

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (6)

  1. Roberts R: Motile aeromonad septicemia. In, Inglis V, Roberts RJ, Bromage NR (Eds): Bacterial Diseases of Fish. 143-155. Blackwell Scientific Publications, Oxford, 1993
  2. Camus AC, Durborow RM, Hemstreet WG, Thune RL, Hawke JP: Aeromonas bacterial infections-motile aeromonad septicemia. SRAC Publication No. 478, 1998
  3. Ghenghesh KS, Ahmed SF, El-Khalek RA, Al-Gendy A, Klena J: Aeromonas-associated infections in developing countries. J Infect Dev Count, 2, 81-98, 2008. DOI: 10.3855/jidc.277 4. Abulhamd A: Genetic diversity and antimicrobial susceptibility of motile aquatic aeromonads. Int J Chem Eng Appl, 1 (1): 90-95, 2010
  4. Beaz-Hidalgo R, Alperi A, Buján N, Romalde JL, Figueras MJ: Comparison of phenotypical and genetic identification of Aeromonas strains isolated from diseased fish. Syst Appl Microbiol, 33, 149-153, 2010. DOI: 10.1016/j.syapm.2010.02.002 6. Beaz-Hidalgo R, Figueras MJ: Molecular detection and characterization of furunculosis and other aeromonas fish infections. In, Carvalho E (Ed): Health and Environment in Aquaculture. InTech, 2012. DOI: 10.5772/29901 7. Kozińska A: Dominant pathogenic species of mesophilic aeromonads isolated from diseased and healthy fish cultured in Poland. J Fish Dis, 30, 293-301, 2007. DOI: 10.1111/j.1365-2761.2007.00813.x 8. Li Y, Cai SH: Identification and pathogenicity of Aeromonas sobria on tail-rot disease in juvenile tilapia Oreochromis niloticus. Current Microbiol, 62, 623-627, 2011. DOI: 10.1007/s00284-010-9753-8 9. Ghori SA, Grubb WB: Applications of molecular methods for typing bacteria. In, Ahmed N, Qureshi FM, Khan OY (Eds): Industrial and Environmental Biotechnology. 157-174. Horizon Scientific Press, UK, 2001
  5. Das A, Rathore A, Janani C, Hemanth C, Balakrishnan RA: Diagnosis of motile Aeromonas sobria from cat fishes with septicemia by PCR. IOSR J Agricult Vet Sci, 2 (6): 87-91, 2013
  6. Lee C, Cho JC, Lee SH, Lee DG, Kim SJ: Distribution of Aeromonas spp. as identified by 16S rDNA restriction fragment length polymorphism analysis in a trout farm. J Appl Microbiol, 93, 976-985, 2002. DOI: 10.1046/j.1365-2672.2002.01775.x 12. Szczuka E, Kaznowski A: Typing of clinical and environmental Aeromonas sp. strains by random amplified polymorphic DNA PCR, repetitive extragenic palindromic PCR, and enterobacterial repetitive intergenic consensus sequence PCR. J Clin Microbiol, 42, 220-228, 2004. DOI: 10.1128/JCM.42.1.220-228.2004 13. Yousr AH, Napis S, Rusul GRA, Alitheen NB, Son R: Molecular typ