KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Çukurova Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi / 2021 / Cilt: 36 - Sayı: 1

Ülkemiz Turnip Mosaic Virus Bamya İzolatının Tüm Genom Analizi

Gözde DEMİR
Savaş KORKMAZ
Sayfa
139–148
Yayın Tarihi
2021-06-30
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bu çalışma ile ülkemizde ilk defa bamyayı enfekte eden bir TuMV izolatının genom düzeyinde moleküler karaktezasyonu gerçekleştirilmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Turnip mosaic virus (TuMV) dünyada konukçusu olduğu bitkilerin yetiştirildiği bölgelerde ekonomik düzeyde zarara neden olmaktadır.
📊
Temel Bulgular & Veri:Genom dizilimi belirlenen bamya TuMV izolatının dünya izolatları ile karşılaştırılması sonucunda nükleotit düzeyinde %77-93, amino asit düzeyinde ise %89-97 oranında benzerliklere sahip olduğu bulunmuştur.
💡
Sonuç & Katkı:Bu çalışma ile ülkemizde ilk defa bamyayı enfekte eden bir TuMV izolatının genom düzeyinde moleküler karaktezasyonu gerçekleştirilmiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:RT-PCR · BENZERLİK · FİLOGENETİK

Özet

Turnip mosaic virus (TuMV) dünyada konukçusu olduğu bitkilerin yetiştirildiği bölgelerde ekonomik düzeyde zarara neden olmaktadır. Dünyada son yıllarda yapılan bir çalışmada virüsün Brassicaceae familyasındaki bitkilerin dışında bamyayı da enfekte ettiği belirlenmiştir. Bu çalışma kapsamında bamyayı enfekte eden bir TuMV izolatının tüm genom dizi analizi yapılmıştır. Genom dizilimi belirlenen bamya TuMV izolatının dünya izolatları ile karşılaştırılması sonucunda nükleotit düzeyinde %77-93, amino asit düzeyinde ise %89-97 oranında benzerliklere sahip olduğu bulunmuştur. Filogenetik analizler sonucunda ise bamya TuMV izolatının basal-B filogenetik grubunda yer aldığı görülmüştür. Bu çalışma ile ülkemizde ilk defa bamyayı enfekte eden bir TuMV izolatının genom düzeyinde moleküler karaktezasyonu gerçekleştirilmiştir.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

DEMİR, G., KORKMAZ, S. (2021). Ülkemiz Turnip Mosaic Virus Bamya İzolatının Tüm Genom Analizi. Çukurova Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi, Cilt: 36 - Sayı: 1, 139–148. https://ajindex.com/articles/219161

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (10)

  1. Akbay, C., Candemir, S., Orhan, E. (2005) Türkiye’de yaş meyve ve sebze ürünleri üretim ve pazarlaması. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Fen ve Mühendislik Dergisi 8 (2): 96-107.
  2. Asare-Bediako, E., Van der Puije, G.C., Taah, K.J., Abole, E.A., Baidoo, A. (2014) Prevalence of okra mosaic and leaf curl diseases and Podagrica spp. damage of okra (Albelmoschus esculentus) plants. International Journal of Current Research and Academic Review 2 (6): 260-271.
  3. Farzadfar, S., Tomitaka, Y., Ikematsu, M., Golnaraghi, A. R., Pourrahim, R., Ohshima, K. (2009) Molecular characterisation of turnip mosaic virus isolates from brassicaceae weeds. European journal of plant pathology 124 (1): 45-55.
  4. Gera, A., Lampel M., Cohen, J., Rosner, A. (2001) Okra (Hibiscus esculentus)—a new host of turnip mosaic virus in Israel. Plant Disease 85 (3): 336. Gökdağ, S., Karanfil, A., Korkmaz, S. (2016) Çanakkale ili ıspanak alanlarındaki şalgam mozaik virüsü ve hıyar mozaik virüsü varlığının belirlenmesi. Bahçe, özel sayı 2: 166-170.
  5. Karanfil, A. (2020). Researchıng of usability of different total nucleic acid isolation methods in detection of potyvirus infections by RT-PCR. International Van Conference on Applied Sciences 43. Karanfil, A., Korkmaz, S. (2019) Bamya bitkisinde şalgam mozaik virüsü (turnip mosaic virus)’nün tespiti ve moleküler karakterizasyonu. Bitki Koruma Bülteni 59 (3): 79-87.
  6. Karanfil, A., Korkmaz, S. (2020) Çanakkale ve Tekirdağ illeri kanola üretim alanlarında önemli virüs hastalıklarının tanılanması ve karakterizasyonu. Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi 57 (1): 53-62.
  7. Korkmaz, S., Karanfil A. (2017). Detection of turnip mosaic virus from brassica plants by serological and molecular methods in Çanakkale, Turkey. 2nd International Balkan Agriculture Congress, 60. Korkmaz, S, Tomitaka, Y., Onder, S., Ohshima, K. (2008) Occurrence and molecular characterization of Turkish isolates of Turnip mosaic virus. Plant Pathology 57 (6): 1155-1162.
  8. Korkmaz, S., Cevik, B., Karanfil, A., Onder, S., Ohshima, K. (2020) Phylogenetic relationships and genetic structure of populations of turnip mosaic virus in Turkey. European Journal of Plant Pathology 156 (2): 559-569.
  9. Lamont, W.J. (1999) Okra-A versatile vegetable crop. HortTechnology 9 (2): 179-184.
  10. Li, R., Mock, R., Huang, Q., Abad, J., Hartung, J., Kinard, G. (2008) A reliable and in expensive method of nucleic acid extraction for the pcr-based detection of diverse plant pathogens. Journal of Virological Methods 154 (