KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Gaziosmanpaşa Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi / 2018 / Cilt: 35 - Sayı: 3

Bazı Elma (Malus domestica Borkh.) Genotiplerinin SSR’lara (Simple Sequence Repeats) Dayalı Genetik Karakterizasyonu

ALİ EMRE AKPINAR
Serdar ALTINTAŞ
Sümeyye ALTUNOK
Mehmet Emin AKÇAY
Merve Dilek KARATAŞ
ALİ ERGÜL
Sayfa
268–277
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Elde edilen verilerde benzer ve sinonim genotiplere rastlanmazken, Tavşanbaşı, Tokat, Yaz Elması ve Demir gruplarında homonim durum tespit edilmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Türkiye, alan ve üretim potansiyelinin yanında, zengin bir elma genetik çeşitliliğine sahiptir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Ancak, farklı isimlendirmelerden ve çeşit içi varyasyonlardan kaynaklanan çeşit karmaşası yaşanmaktadır.
💡
Sonuç & Katkı:Elde edilen verilerde benzer ve sinonim genotiplere rastlanmazken, Tavşanbaşı, Tokat, Yaz Elması ve Demir gruplarında homonim durum tespit edilmiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Elma (Malus domestica) · SSR · moleküler tanımlama

Özet

Türkiye, alan ve üretim potansiyelinin yanında, zengin bir elma genetik çeşitliliğine sahiptir. Ancak, farklı isimlendirmelerden ve çeşit içi varyasyonlardan kaynaklanan çeşit karmaşası yaşanmaktadır. Bu nedenle, yetiştiricilikte kullanılmayan bazı eski elma çeşitlerinin kaybolma riski görülmektedir. Ülkemiz bitki gen kaynaklarının tanımlanması amacıyla; meyve türlerindeki tanımlamaların morfolojik özelliklere dayandığı, DNA düzeyinde yürütülen çalışmalar ise sınırlı sayıda olduğu görülmektedir. Bu çalışmada, söz edilen olumsuzlukların azaltılması amacıyla, “Atatürk Bahçe Kültürleri Araştırma Enstitüsü-Yalova” elma koleksiyonundan alınan 35 yerli ve 2 referans elma genotipi, 17 SSR (Simple Sequence Repeats) markör kullanılarak tanımlanmıştır. Elde edilen verilerde benzer ve sinonim genotiplere rastlanmazken, Tavşanbaşı, Tokat, Yaz Elması ve Demir gruplarında homonim durum tespit edilmiştir. CH01d08 lokusu, tanımlama olasılığı en yüksek lokus olarak göze çarparken, genotipler arası en yüksek benzerlik oranı %94 olarak tespit edilmiştir. Ülkemiz elma kaynaklarının SSR düzeyinde tanımlanmasına yönelik, gerçekleştirilen bu çalışma bulguları, ileride yürütülecek diğer çalışmalara ön veri oluşturacaktır. Aynı zamanda, bitki genetiği (genetik haritalama, gen klonlama vb.), ıslahı (kombinasyon ıslahında kullanılacak olan ebeveynlerin genetik benzerliklerinin belirlenmesi, mevcut çeşitlerde ana-baba-hibrid olası ilişkilerinin ortaya çıkarılması vb.) ve yetiştiricilik (bitkilerin tanısı ve DNA düzeyinde kontrol vb.) alanlarında katkılar sağlayacaktır.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

AKPINAR, A. E., ALTINTAŞ, S., ALTUNOK, S., AKÇAY, M. E., KARATAŞ, M. D., ERGÜL, A. (2018). Bazı Elma (Malus domestica Borkh.) Genotiplerinin SSR’lara (Simple Sequence Repeats) Dayalı Genetik Karakterizasyonu. Gaziosmanpaşa Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, Cilt: 35 - Sayı: 3, 268–277. https://ajindex.com/articles/164962

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (12)

  1. Anonim (2004). http://www.fao.org. FAO Statistical Databases Agriculture, Agriculture and Food Trade, Apple Export in The World. Anonim (2006). http://www.fao.org.
  2. FAO Statistical Databases, Agriculture, Agriculture and Food Trade, Apple Export in The World. Anonim (2016). http://www.tarim.gov.tr/sgb/Belgeler/ SagMenuVeriler/BUGEM.pdf. Burak M, Ergül A, Kazan, K, Akcay ME, Yüksel C, Bakir M, Mutaf F, Akpinar AE, Yaşasın AS, Ayanoğlu H (2014). Genetic analysis of Anatolian apples (Malus sp.) by simple sequence repeats. Journal of systematics and evolution, 52(5): 580-588.
  3. Decroocq V, Fave MG, Hagen G, Bordenave L and Decroocq S (2003). Development and transferability of apricot and grape EST microsatellite markers across taxa. Theor Appl Genet, 106: 912-922.
  4. Laigret F (2003). Development of microsatellite markers in peach (Prunus persica L.) and their uses in genetic diversity analysis in peach and sweet cherry (Prunus avium L.). Theor. Appl. Genet, 105: 127-138
  5. Galli Z., Halász G., Kiss E., Heszky, L., and Dobránszki, J. (2005). Molecular identification of commercial apple cultivars with microsatellite markers. HortScience, 40: 1974-1977.
  6. Garkava-Gustavsson L, Kolodinska Brantestam A, Sehic J and Nybom H (2008). Molecular characterisation of indigenous Swedish apple cultivars based on SSR and S-allele analysis. Hereditas, 145: 99-112.
  7. Gianfranceschi L, Seglias N, Tarchini R, Komjanc M, Gessler C (1998). Simple sequence repeats for the genetic analysis of apple. Theor. Appl. Genet, 96: 1069-1076.
  8. Guarino C, Santoro S, De Simone L, Lain O, CIpriani G and Testolin R (2006). Genetic diversity in a collection of ancient cultivars of apple (Malus-domestica Borkh.) as revealed by SSR-based fingerprinting. J. Hort. Sci. Biotechnol, 81: 39-44.
  9. Lefort F, Lally M, Thompson D and Douglas GC (1998). Morfolojical traits microsatellite fingerprinting and genetic relatedness of a stand of elite oaks (Q. Robur L.) at Tuallynally Ireland. Silvae Genetica, 47: 5-6.
  10. Litt M and Luty JA (1989). A hypervariable microsatelllite revealed by in vitro amplification of a dinucleotide repeat within the cardiac muscle actin gene. Am J Hum Genet, 44: 397-401.
  11. Liebhard R, Gianfranceschi L, Koller B, Ryder CD, Tarchini R, van de Weg E and Gessler C (2002). Development and characterisation of 140 new microsatellites in apple (Malus domestica Borkh.). Mol. Breed, 10:217–241.
  12. Minch E, Ruiz-Linares A, Goldstein DB, Feldman M and Cavalli-Sforza LL (1995). Microsat (version 1.4d): a computer pr