Dergiler / International Journal of Advances in Engineering and Pure Sciences / 2017 / Cilt: 29 Sayı: 4

Hücre Tipine Özgü Analiz : Arabidopsis thaliana Yapraklarında Floresans ile Aktive Edilmiş Hücrelerin Toplanması Yönteminin Kullanımı

Cell-type specific analysis: The use of fluorescence-activated cell sorting (FACS) in Arabidopsis thaliana leaves

Sayfa
131–133
Yayın Tarihi
2017-12-31
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bu derlemede GFP (Green flourescent protein=Yeşil floresans protein) ile işaretlenmiş transgenik Arabidopsis thaliana bitkilerinin yapraklarında FACS uygulaması hakkında bilgi verilmiş olacaktır.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Gen aktivitesinin hücreye özgü çözümü özel gelişimsel olayların anlaşılmasında kritik bir rol oynamaktadır.
📊
Temel Bulgular & Veri:Aynı organ ya da dokunun komşu hücrelerinden spesifik hücrelerin izole edilebilmesi için en etkili yöntem FACS (Fluorescence-activated cell sorting=Floresans tarafından aktive edilmiş hücrelerin ayrılması) yöntemidir.
💡
Sonuç & Katkı:Bu derlemede GFP (Green flourescent protein=Yeşil floresans protein) ile işaretlenmiş transgenik Arabidopsis thaliana bitkilerinin yapraklarında FACS uygulaması hakkında bilgi verilmiş olacaktır.
🔬Tür:Literatür & Derleme Çalışması
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:FACS · GFP · Arabidopsis thaliana

Özet

Gen aktivitesinin hücreye özgü çözümü özel gelişimsel olayların anlaşılmasında kritik bir rol oynamaktadır. Bunun yanında, genomik seviyede böyle yüksek çözünürlüklü verilerin elde edilmesi spesifik hücrelerin izole edilmesini gerektirdiği için oldukça zordur. Aynı organ ya da dokunun komşu hücrelerinden spesifik hücrelerin izole edilebilmesi için en etkili yöntem FACS (Fluorescence-activated cell sorting=Floresans tarafından aktive edilmiş hücrelerin ayrılması) yöntemidir. İzole edilen hücreler genomik analizler için kullanılabilmektedir. Bu derlemede GFP (Green flourescent protein=Yeşil floresans protein) ile işaretlenmiş transgenik Arabidopsis thaliana bitkilerinin yapraklarında FACS uygulaması hakkında bilgi verilmiş olacaktır.

Abstract

Cell-specific resolution of gene activity is critical to understand specific developmental events. However, such high resolution data have been difficult to obtain at a genomic level because specific types of cell need to be isolated. One of the most efficient method to isolate specific cells from neighboring cells in the same organ or tissue is FACS. The isolated cells can be used for genomic analysis. In this review, it will be given information about FACS in transgenic Arabidopsis thaliana leaves which are labelled  with GFP.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

Sağlam, N. G. (2017). Hücre Tipine Özgü Analiz : Arabidopsis thaliana Yapraklarında Floresans ile Aktive Edilmiş Hücrelerin Toplanması Yönteminin Kullanımı. International Journal of Advances in Engineering and Pure Sciences, Cilt: 29 Sayı: 4, 131–133. https://doi.org/10.7240/marufbd.371519

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (7)

  1. Birnbaum K., Jung J.W., Wang J.Y., Lambert G.M., Galbraith D.W., Benfey P.N., 2003, A gene expression map of the Arabidopsis root. Science, 302:1956-1960
  2. Birnbaum K., Jung J.W., Wang J.Y., Lambert G.M., Hirst, J.A., Galbraith D.W., Benfey P.N., 2005, Cell type-specific expression profiling in plants via cell sorting of protoplasts from fluorescent repeater lines. Nat. Methods., 2:615-619
  3. Carter A.D., Bonyadi R., Gifford M.L., 2013, The use of fluorescence-activated cell sorting in studying plant development and environmental responses. Int. J. Dev. Biol., 57:545-552
  4. Gronlund J.T., Eyres A., Kumar S., Buchanan-Wollaston V., Gifford M.L., 2012, Cell specific analysis of Arabidopsis leaves using flourescence activated cell sorting, J. Vis. Exp. (68), e4214 10.3791/4214 DOI: 10.37914214 (2012)
  5. Hertberg M., Sievertzaon M., Aspeborg H., Nilsson P., Sandberg G., Lundeberg J., cDNA microarray analysis of small plant tissue samples using cDNA target amplification protocol. Plant J., 25:585-591
  6. Lee J.Y., Levesque M., Benfey P.N., 2005, High-throughput RNA isolation technologies. New tools for high-resolution gene expression profiling in plant systems. Plant Physiol., 138:585-590
  7. Wang Y. and Jiao Y., 2011, Advances in plant cell type-spesific genome-wide studies of gene expression. Front. Biol., 6:384-389