Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar
AI InsightTürkiye’de yayılış gösteren Biarum cinsi için yapılan ilk filogenetik çalışma olmasından dolayı burada elde edilen veriler, gelecekte yapılacak çalışmalar için bir kaynak teşkil edecektir.
📌 3 Maddede Bu Makale
Özet
Bu çalışma, Türkiye’de doğal olarak yayılış gösteren Biarum cinsine ait türlerin filogenetik analizini yapmak amacıyla gerçekleştirilmiştir. Biarum, Araceae familyasına ait, genellikle Akdeniz bölgesinde yayılış gösteren, rizomlu veya yumrulu bir bitki cinsidir. Türkiye’de bu cinse ait 12 takson bulunmakta olup, bunların 5’i endemiktir. Araştırmada, Biarum türlerinin filogenetik ilişkilerini belirlemek amacıyla kloroplast DNA trnL-trnF intergenik bölgesi (IGS) kullanılmıştır. 2020-2022 yılları arasında Türkiye’nin farklı bölgelerinden toplanan bitki örneklerinden DNA ekstraksiyonu yapılmış ve Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) yöntemiyle trnL-trnF bölgesi çoğaltılmıştır. Elde edilen DNA dizileri biyoinformatik programlar ile hizalanarak Neighbor-Joining (NJ) yöntemi ile filogenetik ağaç oluşturulmuştur. Sonuçlara göre, Biarum cinsine ait türlerin büyük çoğunluğu monofiletik bir grup oluşturmaktadır. Bazı türlerin birbirine genetik olarak daha yakın olduğu belirlenmiştir. Bu türler arasında; Biarum x cinarense ve Biarum carduchorum türlerinin yakın akraba oldukları belirlenmiştir. Öte yandan, Biarum syriacum daha izole bir konumda yer almakta olup diğer türlerden daha farklı bir genetik yapıya sahiptir. Bu çalışma, Biarum cinsinin genetik çeşitliliğini ve filogenetik ilişkilerini daha iyi anlamamıza katkı sağlamıştır. Türkiye’de yayılış gösteren Biarum cinsi için yapılan ilk filogenetik çalışma olmasından dolayı burada elde edilen veriler, gelecekte yapılacak çalışmalar için bir kaynak teşkil edecektir.
Abstract
This study was conducted to perform a phylogenetic analysis of species belonging to the genus Biarum, which naturally occurs in Turkey. Biarum is a genus of rhizomatous or tuberous plants belonging to the Araceae family, predominantly distributed in the Mediterranean region. In Turkey, 12 taxa of this genus are found, five of which are endemic. In the study, the chloroplast DNA trnL-trnF intergenic spacer (IGS) region was used to determine the phylogenetic relationships of Biarum species. DNA extraction was performed from plant samples collected from different regions of Turkey between 2020 and 2022, and the trnL-trnF region was amplified using the Polymerase Chain Reaction (PCR) method. The obtained DNA sequences were aligned using bioinformatics programs, and a phylogenetic tree was constructed using the Neighbor-Joining (NJ) method. According to the results, most species belonging to the genus Biarum form a monophyletic group. Some species were found to be genetically closer to each other. Among these, Biarum × cinarense and Biarum carduchorum were determined to be closely related. On the other hand, Biarum syriacum was found to be in a more isolated position, possessing a distinct genetic structure compared to other species. This study contributes to a better understanding of the genetic diversity and phylogenetic relationships of the Biarum genus. Since it is the first phylogenetic study conducted on Biarum species distributed in Turkey, the data obtained here will serve as a valuable resource for future research.