KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Trakya University Journal of Natural Sciences / 2025 / Volume: 26 Issue: 2

Diversity of Melanoleuca Pat. (Basidiomycota, Agaricales) in Çanakkale, Türkiye: morphological and molecular perspectives

İsmail Acar(YÜZÜNCÜ YIL ÜNİVERSİTESİ, BAŞKALE MESLEK YÜKSEKOKULU)0000-0002-6049-4896
Halide Karabıyık(TRAKYA ÜNİVERSİTESİ)0000-0002-1778-2200
Sayfa
—
Yayın Tarihi
2025-10-15
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bu bulgular, Türkiye’deki Melanoleuca türlerinin çeşitliliğinin anlaşılmasına yeni veriler katmakta, morfolojik olarak benzer türleri ayırt etmede moleküler verilerin kritik önemini vurgulamakta ve literatürdeki bazı kayıtların mevcut filogenetik bağlamda yeniden değerlendirilmesi gerektiğini göstermektedir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Melanoleuca Pat., Basidiomycota veya Agaricales, cinsi önemli morfolojik benzerliklerin varlığı nedeniyle taksonomik olarak karmaşık bir gruptur.
📊
Temel Bulgular & Veri:M. granadensis, ilk olarak 2020 yılında İspanya’da tanımlanmış ve Avrupa’da sadece Çek Cumhuriyeti ve Slovakya’da rapor edilmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:Bu bulgular, Türkiye’deki Melanoleuca türlerinin çeşitliliğinin anlaşılmasına yeni veriler katmakta, morfolojik olarak benzer türleri ayırt etmede moleküler verilerin kritik önemini vurgulamakta ve literatürdeki bazı kayıtların mevcut filogenetik bağlamda yeniden değerlendirilmesi gerektiğini göstermektedir.
🔬Tür:Literatür & Derleme Çalışması
📍Kapsam:2020 Verileri
⚙️Değişkenler:DNA · Internal Transcribed Spacer · new record

Özet

Melanoleuca Pat., Basidiomycota veya Agaricales, cinsi önemli morfolojik benzerliklerin varlığı nedeniyle taksonomik olarak karmaşık bir gruptur. Bu sebeple, güvenilir tür tanımlaması, moleküler filogenetik verilerle desteklenen bütünsel bir yaklaşım gerektirir. Bu çalışmada, Türkiye’nin Çanakkale ilinden tanımlanan beş takson, yani M. exscissa (Fr.) Singer, M. cf. graminicola, M. granadensis Armada, M. paedida (Fr.) Kühner & Maire ve M. stridula (Fr.) Singer incelenmiştir. Bu türler, makro- ve mikromorfolojik karakterlerin İçsel Transkribe Edilmiş Aralık rDNA dizilerine dayalı filogenetik analizlerle entegre edilmesiyle tanımlanmıştır. M. exscissa, M. graminicola, M. paedida ve M. stridula daha önce Türkiye’de belgelenmiştir; bu çalışmada, ayrıntılı makro- ve mikroskobik tanımlamalar güncellenmiş ve yeniden sunulmuştur. M. granadensis, ilk olarak 2020 yılında İspanya’da tanımlanmış ve Avrupa’da sadece Çek Cumhuriyeti ve Slovakya’da rapor edilmiştir. Bu tür, Türkiye mikobiyotası için güvenilir bir şekilde doğrulanmış yeni bir kayıt olup, Avrupa dışından bilinen ilk örnek olarak kabul edilmektedir. Tüm örneklerin habitat gözlemleri, coğrafi koordinatları ve toplama tarihleri ayrıntılı olarak belgelenmiştir; mikroskobik karakterler çizimlerle desteklenmiştir ve yeni kaydın tanımı taramalı elektron mikroskobu görüntüleri ile desteklenmiştir. Bu bulgular, Türkiye’deki Melanoleuca türlerinin çeşitliliğinin anlaşılmasına yeni veriler katmakta, morfolojik olarak benzer türleri ayırt etmede moleküler verilerin kritik önemini vurgulamakta ve literatürdeki bazı kayıtların mevcut filogenetik bağlamda yeniden değerlendirilmesi gerektiğini göstermektedir.

Abstract

The genus Melanoleuca Pat. (Basidiomycota or Agaricales) is taxonomically complex due to its remarkable morphological similarities with other genera. Consequently, any reliable species identification method requires a holistic approach that includes molecular phylogenetic data. In this study, five taxa, namely M. exscissa (Fr.) Singer, M. cf. graminicola, M. granadensis Armada, M. paedida (Fr.) Kühner & Maire, and M. stridula (Fr.) Singer were identified from the Çanakkale province, Türkiye. These were described by integrating macro and micromorphological characters with phylogenetic analyses, which were based on Internal Transcribed Spacer rDNA sequences. M. exscissa, M. graminicola, M. paedida, and M. stridula have already been documented in Türkiye. This study updated the detailed macro- and microscopic descriptions. M. granadensis, first described in Spain in 2020 and reported from only the Czech Republic and Slovakia in Europe, was confirmed as a novel record of the Turkish mycobiota. It represents the first known non- European specimen. The detailed habitat characteristics, geographic coordinates, and collection dates of all specimens were documented. The microscopic characters were supported with drawings; the description of the new record was supplemented with scanning electron microscope images. These findings contribute novel data for understanding the Melanoleuca spp. diversity in Türkiye, underscoring the significance of molecular data in distinguishing morphologically similar species. They also suggest that certain records should be re-evaluated within the context of current phylogenetics.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

Acar, İ., Karabıyık, H. (2025). Diversity of Melanoleuca Pat. (Basidiomycota, Agaricales) in Çanakkale, Türkiye: morphological and molecular perspectives. Trakya University Journal of Natural Sciences, Volume: 26 Issue: 2. https://ajindex.com/articles/1111941

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (35)

  1. Acar, İ., Dizkırıcı Tekpınar, A., Kalmer, A., & Uzun, Y. (2017). Phylogenetic relationships and taxonomical positions of two new records Melanoleuca species from Hakkari province, Turkey. Biological Diversity and Conservation, 10(3), 85–93.
  2. Acar, İ., Uzun, Y., & Akata, İ. (2020). Some macrofungi determined in Şemdinli and Yüksekova districts (Hakkari-Turkey). Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi, 23(1), 157–167. https://doi.org/10.18016/ ksutarimdoga.vi.588237
  3. Akata, İ., Ediş, G., Kumru, E., Acar, İ., & Şahin, E. (2024b). Taxonomic studies on Rhodocybe asyae specimens discovered in a new location. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi, 27(Suppl 1), 124–132. https:// doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.1507554
  4. Akata, İ., Ediş, G., Kumru, E., Acar, İ., & Şahin, E. (2024c). Initial report of Inocybe costinitii in Türkiye with morphological and molecular data. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi, 27(6), 1304– 1312. https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.1467628
  5. Akata, İ., Kumru, E., Ediş, G., Acar, İ., & Şahin, E. (2024d). Two newly reported Agaricales species from Türkiye with morphological and molecular data. Kastamonu University Journal of Forestry Faculty, 24(3), 260–280. https://doi. org/10.17475/kastorman.1599952
  6. Akata, İ., Kumru, E., Şahin, E., Acar, İ., & Kaya, E. (2024a). Amanita vidua: A new record for Turkish Amanita section Phalloideae based on morphological and molecular data. Trakya University Journal of Natural Sciences, 25(1), 97–110. https://doi.org/10.23902/trkjnat.1446327
  7. Antonín, V., Ďuriška, O., Jančovičová, S., Kudláček, T., Para, R., Ševčíková, H., & Tomšovský, M. (2023). Two new European species of Melanoleuca (Fungi, Agaricales) with comments on the M. graminicola group. Systematics and Biodiversity, 21(1), 2218375. https://doi.org/10.1080/14772000.2023.221837
  8. Antonín, V., Ďuriška, O., Jančovičová, S., Para, R., Kudláček, T., & Tomšovský, M. (2022). Multilocus phylogeny and taxonomy of European Melanoleuca subgenus Melanoleuca. Mycologia, 114(1), 114–143. https://doi.org/10.1080/0 0275514.2021.1966246
  9. Antonín, V., Ševčíková, H., Para, R., Ďuriška, O., Kudláček, T., & Tomšovský, M. (2021). Melanoleuca galbuserae, M. fontenlae and M. acystidiata: Three new species in subgenus Urticocystis (Pluteaceae, Basidiomycota) with comments on M. castaneofusca and related species. Journal of Fungi, 7(3), 191. https://doi. org/10.3390/jof7030191
  10. Armada, F. (2020). Quelques basidiomycètes nouveaux ou rares pour l’Andalousie, découverts près de Grenade dans la Sierra Nevada (Espagne). Bulletin Mycologique et Botanique Dauphiné-Savoie, 239, 67–78.
  11. Assyov, B., & Slavova, M. (2023). Macrofungi in stands of the endemic pine Pinus peuce as inferred from morphological and molecular data. Proceedings of the Bulgarian Academy of Sciences, 76(5), 707–715. https://doi.org/10.7546/ CRABS.2023.05.06
  12. Barba-Montoya, J., Tao, Q., & Kumar, S. (2020). Using a GTR+Γ substitution model for dating sequence divergence when stationarity and time-reversibility assumptions are violated. Bioinformatics, 36(Suppl 1), i884–i894. https://doi. org/10.1093/bioinformatics/btaa820
  13. Breitenbach, J., & Kränzlin, F. (1991). Fungi of Switzerland (Vol. 3). Richmond Publishing Co., Ltd.
  14. Canan, K., Quark, M., Russell, S., Ostuni, S., Rockefeller, A., Williams, J., Culliton, S., Geurin, Z., & Birkebak, J. (2024). Introducing the Ohio Mushroom DNA Lab: Early lessons and contributions from a new community-driven nanopore sequencing laboratory. McIlvainea, 33, 2024.
  15. Chen, L., Cai, Y., Zhou, G., Shi, X., Su, J., Chen, G., & Lin, K. (2014). Rapid Sanger sequencing of the 16S rRNA gene for identification of some common pathogens. PLOS ONE, 9(2), e88886. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0088886
  16. Dizkırıcı, A., Kalmer, A., & Acar, İ. (2019). Morphologic and molecular diagnosis of some Leucoagaricus species and revealing a new record from Turkey. Mantar Dergisi, 10(2), 143–150. https://doi.org/10.30708/mantar.590274
  17. Felsenstein, J. (1985). Phylogenies and the comparative method. The American Naturalist, 125(1), 1–15.
  18. He, M. Q., Zhao, R. L., Hyde, K. D., … & Kirk, P. M. (2019). Notes, outline and divergence times of Basidiomycota. Fungal Diversity, 99(1), 105–367. https://doi.org/10.1007/s13225-019-00435-4
  19. Höhna, S., Landis, M. J., & Heath, T. A. (2017). Phylogenetic inference using RevBayes. Current Protocols in Bioinformatics, 57(1), 6.16.1–6.16.34. https://doi. org/10.1002/cpbi.2
  20. Justo, A., Vizzini, A., Minnis, A. M., Menolli, N., Capelari, M., Rodriguez, O., Malysheva, E., Contu, M., Ghignone, S., & Hibbett, D. S. (2011). Phylogeny of the Pluteaceae (Agaricales, Basidiomycota): Taxonomy and character evolution. Fungal Biology, 115(1), 1–20. https://doi.org/10.1016/j.funbio.2010.09.012
  21. Kalmer, A., Acar, İ., & Dizkırıcı, A. (2018). Phylogeny of some Melanoleuca species (Fungi: Basidiomycota) in Turkey and identification of Melanoleuca angelesiana A. H. Sm. as a first record. Kastamonu University Journal of Forestry Faculty, 18(3), 314–326. https://doi.org/10.17475/kastorman.499076
  22. Kalmer, A., Dizkırıcı, A., & Acar, İ. (2022). Molecular and morphological identification of Melanoleuca cinereifolia from Türkiye. Mantar Dergisi, 13(2), 134–140. https://doi.org/10.30708/mantar.1125768
  23. Kaşık, G., Alkan, S., Aktaş, S., Öztürk, C., & Akgül, H. E. (2022). Macrofungi of Yenice (Karabük) district and new records for Turkey. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi, 25(6), 1264–1278. https://doi. org/10.18016/ksutarimdoga.vi.889463
  24. Knudsen, H., & Vesterholt, J. (2008). Funga Nordica: Agaricoid, boletoid and cyphelloid genera. Nordsvamp.
  25. Kornerup, A., & Wanscher, J. H. (1978). Methuen handbook of colour (3rd ed.). Eyre Methuen.
  26. Patouillard, N. T. (1897). Fungi: Catalogue raisonné des plantes cellulaires de la Tunisie. Imprimerie Nationale.
  27. Rogers, S. O., & Bendich, A. J. (1994). Extraction of total cellular DNA from plants, algae and fungi. In S. B. Gelvin & R. A. Schilperoort (Eds.), Plant molecular biology manual (pp. 183–190). Springer.
  28. Ronquist, F., Teslenko, M., Van Der Mark, P., Ayres, D. L., Darling, A., Höhna, S., Larget, B., Liu, L., Suchard, M. A., & Huelsenbeck, J. P. (2012). MrBayes 3.2: Efficient Bayesian phylogenetic inference and model choice across a large model space. Systematic Biology, 61(3), 539–542. https://doi.org/10.1093/sysbio/sys029
  29. Sanchez-Garcia, M., Cifuentes-Blanco, J., & Matheny, P. B. (2013). Taxonomic revision of the genus Melanoleuca in Mexico and description of new species. Revista Mexicana de Biodiversidad, 84(Suppl 1), S111–S127. https://doi. org/10.7550/rmb.31569
  30. Schoch, C. L., Seifert, K. A., Huhndorf, S., Robert, V., Spouge, J. L., Levesque, C. A., Chen, W., & Fungal Barcoding Consortium. (2012). Nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region as a universal DNA barcode marker for fungi. Proceedings of the National Academy of Sciences, 109(16), 6241–6246. https://doi.org/10.1073/pnas.1117018109
  31. Uzun, Y., Kaya, A., Keleş, A., Akçay, M. E., & Acar, İ. (2009). Macromycetes of Genç district (Bingöl-Turkey). International Journal of Botany, 5(4), 301–306. https://doi.org/10.3923/ijb.2009.301.306
  32. Vesterholt, J. (2008). Melanoleuca Pat. In H. Knudsen & J. Vesterholt (Eds.), Funga Nordica: Agaricoid, boletoid and cyphelloid genera (pp. 347–352). Nordsvamp.
  33. Vizzini, A., Alvarado, P., Consiglio, G., Marchetti, M., & Xu, J. (2024). Family matters inside the order Agaricales: Systematic reorganization and classification of incertae sedis clitocyboid, pleurotoid and tricholomatoid taxa based on an updated 6-gene phylogeny. Studies in Mycology, 107(1), 67–148. https://doi. org/10.3114/sim.2024.107.02
  34. Vizzini, A., Para, R., Fontenla, R., Ghignone, S., & Ercole, E. (2011). A preliminary ITS phylogeny of Melanoleuca (Agaricales), with special reference to European taxa. Mycotaxon, 118(1), 361–381. https://doi.org/10.5248/118.361
  35. Xu, J., Yu, X., Lu, M., Hu, J., Moodley, O., Zhang, C., Gong, L., & Li, Y. (2019). Phylogenetic analyses of some Melanoleuca species (Agaricales, Tricholomataceae) in Northern China, with descriptions of two new species and the identification of seven species as a first record. Frontiers in Microbiology, 10, 2167. https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.02167