Dergiler / Biyolojik Çeşitlilik ve Koruma / 2023 / Cilt: 16 Sayı: 3

Türkiye'nin güneyindeki meralardan Azotobacter izolasyon protokolleri kullanılarak Azotobacter olmayan bakterilerin izolasyonu ve moleküler karakterizasyonu

Isolation and molecular characterization of non-Azotobacter bacteria using Azotobacter isolation protocols from pastures in the south of Turkey

Sayfa
252–257
Yayın Tarihi
2023-12-15
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bu sonuçlara göre çeşitli cinslere (Agrobacterium, Phyllobacterium, Variovorax, Acinetobacter, Pseudomonas, Agromyces ve Arthrobacter) ait bakteriler tespit edilmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Türkiye'nin güneyindeki meralardan Azotobacter izolasyon protokolleri kullanılarak Azotobacter olmayan bakterilerin izolasyonu ve moleküler karakterizasyonu Özet Toprak, biyolojik çeşitlilik açısından zengin bir ekosistemdir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Türkiye'nin Antalya ilindeki çeşitli meralardan toplanan toprak örneklerinden toplam 800 izolat elde edilmiş ve bunlardan 92'si moleküler olarak karakterize edilmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:Bu sonuçlara göre çeşitli cinslere (Agrobacterium, Phyllobacterium, Variovorax, Acinetobacter, Pseudomonas, Agromyces ve Arthrobacter) ait bakteriler tespit edilmiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Azotobacter · izolat · toprak

Özet

Türkiye'nin güneyindeki meralardan Azotobacter izolasyon protokolleri kullanılarak Azotobacter olmayan bakterilerin izolasyonu ve moleküler karakterizasyonu Özet Toprak, biyolojik çeşitlilik açısından zengin bir ekosistemdir. Bu ekosistemin önemli bir bileşeni olan azot bağlayan Azotobacter bakterileri çeşitli yöntemlerle sıklıkla izole edilir. Bu çalışmanın amacı, iki Azotobacter izolasyon protokolü sırasında elde edilen Azotobacter olmayan izolatların kısmi moleküler karakterizasyonunu gerçekleştirmek ve bu yöntemle hangi bakterilerin elde edilebileceğini belirlemektir. Türkiye'nin Antalya ilindeki çeşitli meralardan toplanan toprak örneklerinden toplam 800 izolat elde edilmiş ve bunlardan 92'si moleküler olarak karakterize edilmiştir. İzolatlar, 16S rRNA genlerinin RFLP analizi ile gruplandırılmış ve farklı grupları temsil eden izolatların DNA dizileri gerçekleştirilmiştir. Bu sonuçlara göre çeşitli cinslere (Agrobacterium, Phyllobacterium, Variovorax, Acinetobacter, Pseudomonas, Agromyces ve Arthrobacter) ait bakteriler tespit edilmiştir. Sonuçlar, bu çalışmada kullanılan iki izolasyon protokolü ile benzer bakterilerin elde edilebileceğini göstermektedir. Bununla birlikte, Brown Besi ortamında Soil-Past’a göre daha çeşitli bakteriler tespit edilmiştir. Anahtar kelimeler: Azotobacter, izolat, toprak, 16S rDNA

Abstract

Isolation and molecular characterization of non-Azotobacter bacteria using Azotobacter isolation protocols from pastures in the south of Turkey Ebru ÇELEN ORCID: 0000-0002-8452-5933 Department of Biology, Faculty of Arts and Science, Bolu Abant İzzet Baysal University, Gölköy, 14280 Bolu, Türkiye Abstract Soil is a biodiversity-rich ecosystem. Nitrogen-fixing Azotobacter bacteria, an important component of this ecosystem, are frequently isolated using various methods. The aim of the present study was to perform partial molecular characterization of non-Azotobacter isolates derived during two Azotobacter isolation protocols, as well as to determine which bacteria can be obtained using this method. A total of 800 isolates were acquired from soil samples collected from various pastures in Antalya province of Turkey, with 92 of them being molecularly characterized. These isolates were clustered through RFLP analysis of 16S rRNA gene and the DNA sequences of the isolates representing different groups were performed. According to these results, the bacteria belonging to various genera (Agrobacterium, Phyllobacterium, Variovorax, Acinetobacter, Pseudomonas, Agromyces, and Arthrobacter) were identified. The results show that similar bacteria could be obtained through two isolation protocols used in this study. However, more diverse bacteria were encountered on the Brown-medium than on soil-past. Keywords: Azotobacter, isolate, soil, 16S rDNA ----------  ----------

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ÇELEN, E. (2023). Türkiye'nin güneyindeki meralardan Azotobacter izolasyon protokolleri kullanılarak Azotobacter olmayan bakterilerin izolasyonu ve moleküler karakterizasyonu. Biyolojik Çeşitlilik ve Koruma, Cilt: 16 Sayı: 3, 252–257. https://ajindex.com/articles/1021848

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (12)

  1. Torsvik, V., Goksøyr, J., Daae, F. L., Sørheim, R., Michalsen, J. & Salte, K. (1994). Use of DNA analysis to determine the diversity of microbial communities. In: K. Ritz, J. Dighton & K.E. Giller (Eds.), Beyond the Biomass. Compositional and Functional Analysis of Soil Microbial Communities (pp. 39-48). Chichester: John Wiley
  2. Falkowski, P.G., Fenchel, T. & Delong, E.F. (2008). The microbial engines that drive Earth's biogeochemical cycles. Science, 320:1034-1039.
  3. Schlesinger, W.H. (1991). Biogeochemistry: An Analysis of Global Change, Academic, San Diego, Calif: Academic
  4. Young, J.P.W. (1992). Phylogenetic classification of nitrogen-fixing organisms. In: G. Stacey, R.H. Burris & H.J. Evans. (Eds.), Biological nitrogen fixation (pp. 43-86). New York: Chapman and Hall Inc
  5. Raymond, J., Siefert, J.L., Staples, C.R. & Blankenship, R.E. (2004). The natural history of nitrogen fixation. Molecular Biology and Evolution, 21:541-554.
  6. Postgate, J.R. (1998). Nitrogen Fixation (3nd ed.), Cambridge: Cambridge University Press
  7. Revillas, J.J., Rodelas, B., Pozo, C., Martínez‐Toledo, M.V., & González‐López, J. (2000). Production of B‐group vitamins by two Azotobacter strains with phenolic compounds as sole carbon source under diazotrophic and adiazotrophic conditions. Journal of Applied Microbiology, 89:486-493.
  8. Ward, D.M., Bateson, M.M., Weller, R. & Ruff-Roberts, A.L. (1992). Ribosomal RNA analysis of microorganisms as they occur in nature. Advanced Microbial Ecology, 12:220–286.
  9. Pham, V.H. & Kim, J. (2012). Cultivation of unculturable soil bacteria. Trends in Biotechnology, 30:475-484
  10. Kennedy, C., Rudnick, P. Macdonald, M.L. & Melton, T. (2005). Genus III. Azotobacter Beijerinck 1901. In: N.R. Krieg, J.T. Staley & G.M. Garrity (Eds.), Bergey's Manual of Systematic Bacteriology – The Proteobacteria (2nd ed, pp 384–402). New York: Springer
  11. Wollum, A.G. (1982). Cultural methods for soil microorganisms. In: A.L. Page, R.H. Miller & D.R. Keeney (Eds.), Methods of Soil Analysis: Part 2 Chemical and Microbiological Properties (pp. 781-802). Madison: American Society of Agronomy
  12. Knowles, R. (1982). Free‐living dinitrogen‐fixing bacteria. In: A.L. Page, R.H. Miller & D.R. Keeney (Eds.), Methods of Soil Analysis: Part 2 Chemical and Microbiological Pr