The Assessment of Genetic Diversity of Venturia inaequalis Isolates Obtained from Turkey and Europe by Molecular Markers

Avrupa ve Türkiye'den Toplanan Venturia inaequalis İzolatlarının Genetik Farklılığının Moleküler Markırlar ile Değerlendirilmesi

Özet

Elma kara lekesi hastalığı (Venturia inaequalis (Cke) Wint) dünyada olduğu gibi ülkemizde de elmanın ana hastalığıdır.Hastalık, yurdumuzda elma yetiştirilen tüm bahçelerde önemli ürün kaybına neden olabilmektedir. Bu çalışmadamoleküler markırlar ile Türkiye'den ve Avrupa'dan toplanan Elma kara lekesi izolatlarının genetik farklılıkları veakrabalık ilişkileri araştırılmıştır. Moleküler çalışmalarda RAPD, ISSR, SSR ve SRAP markırları kullanılmıştır. Markır sistemlerinden elde edilen sonuçlara göre, izolatların tamamı birbirinden ayrılmış ve bunlar arasında bir varyasyonolduğu görülmüştür. Genetik benzerlikler birbirine yakın bulunmuş, gruplar arasında konukçu seçimi ve coğrafik konumyönünden farklılıklar oluşmamıştır. SSR ve SRAP markırlarında gruplar daha toplu oluşmuş ve uygulamanın kolaylığı,tekrarlanabilirliği ve spesifikliği bakımından daha bilgi verici bulunmuştur.

Abstract

Apple scab (Venturia inaequalis (Cke) Wint) is the main disease of apple trees not only in the world but also in Turkey. The disease can cause severe yield losses in all Turkish apple orchards. Genetic diversity and relatedness of apple scab (Venturia inaequalis (Cke) Wint) isolates collected from Turkey and Europe were investigated in this study through molecular markers. RAPD, ISSR, SSR and SRAP markers were used in the molecular studies. Results obtained by marker system revealed that isolates were quite separated from each other and it is appeared to exist a variation between them. Genetic relatedness between the isolates are very close to each other, and difference among the groups is not significant due to host specificity and geographical location. The groups are consisted of more number of isolates when SSR and SRAP markers are used compared with ISSR and RAPD markers. Using SSR and SRAP markers are preferable to provide more informative outcomes because of ease of use, repeatability and specificity.