SavedAdd your journal

Journals / Uluslararası Tarım ve Yaban Hayatı Bilimleri Dergisi / 2023 / Cilt: 9 Sayı: 1

Identification and Virulence of Fusarium Wilt and Fusarium Crown & Root Rot Disease Agents from Tomato Greenhouses in Mediterranean Climate

Akdeniz iklimindeki Domates Seralarında Fusarium Solgunluk ve Fusarium Kök & Kök Boğazı Çürüklüğü Hastalık Etmenlerinin Moleküler Tanısı ve Virülenslikleri

Hacer Handan ALTINOK
Canan CAN
Özge DEMİREL
Gamze YÜKSEL
Pages
36–49
Publication Date
2023-04-25
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

In terms of virulence, 11% of Fol isolates are highly virulent (HV), 58% are moderately virulent (MV), and 31% are low virulent (LV), while 28% of Forl isolates are highly virulent (HV) and 72% were determined as moderately virulent (MV).

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Fusarium wilt (Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici, Fol) and Fusarium root and crown rot (Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici, Forl) diseases were defined by survey studies.
📊
Key Findings & Data:The isolates of both agents obtained as a result of the isolations were identified with species/race specific primers (FOF1-FOR1, sp13, sp23 and sprl) and their virulence groups were determined.
💡
Conclusion & Impact:In terms of virulence, 11% of Fol isolates are highly virulent (HV), 58% are moderately virulent (MV), and 31% are low virulent (LV), while 28% of Forl isolates are highly virulent (HV) and 72% were determined as moderately virulent (MV).
🔬Design:Survey & Empirical Study
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:Survey · Fusarium solgunluğu · kök ve kök boğazı çürüklüğü

Abstract

Fusarium wilt (Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici, Fol) and Fusarium root and crown rot (Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici, Forl) diseases were defined by survey studies. The isolates of both agents obtained as a result of the isolations were identified with species/race specific primers (FOF1-FOR1, sp13, sp23 and sprl) and their virulence groups were determined. Of the 42 Fol isolates from Antalya province, 20 were determined as race 1 (R1), 7 as race 2 (R2) and 15 as race 3 (R3). Three isolates from Mersin province were identified as race 3 (R3). In PCR studies, the sprl primer set yielded a single 947-bp amplicon for 58 Forl isolates. Of the 119 F. oxysporum isolates from tomato plants, 45 were Fol and 58 were Forl. In terms of virulence, 11% of Fol isolates are highly virulent (HV), 58% are moderately virulent (MV), and 31% are low virulent (LV), while 28% of Forl isolates are highly virulent (HV) and 72% were determined as moderately virulent (MV).

Özet

Akdeniz ikliminde Fusarium solgunluğu (Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici, Fol) ve Fusarium kök ve kök boğazı çürüklüğü (Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici, Forl) hastalıklarına neden olan fungal etmenler survey çalışmaları ile belirlenmiştir. İzolasyonlar sonucu elde edilen her iki etmene ait izolatların tür/ırk spesifik primerlerle (FOF1-FOR1, sp13, sp23 ve sprl) tanısı yapılmış ve virülenslik grupları oluşturulmuştur. Antalya ilinden izole edilen 42 adet Fol izolatının 20’si ırk 1 (R1), 7’si ırk 2 (R2) ve 15’i ırk 3 (R3) olarak saptanmıştır. Mersin ilinden izole edilen 3 adet Fol izolatı ırk 3 (R3) olarak belirlenmiştir. PCR çalışmalarında sprl primer seti, 58 adet Forl izolatı için 947-bp büyüklüğünde tek amplikon vermiştir. Domates bitkisinden izole edilen toplam 119 adet F. oxysporum izolatının 45’i Fol ve 58’i Forl olarak saptanmıştır. Virülenslikleri açısından, Fol izolatlarının %11’i yüksek virülent (YV), %58’i orta virülent (OV) ve %31’i düşük virülent (DV), Forl izolatlarının ise %28’i yüksek virülent (YV) ve %72’si orta virülent (OV) olarak saptanmıştır.

🔖

Cite This Article

ALTINOK, H. H., CAN, C., DEMİREL, Ö., YÜKSEL, G. (2023). Identification and Virulence of Fusarium Wilt and Fusarium Crown & Root Rot Disease Agents from Tomato Greenhouses in Mediterranean Climate. Uluslararası Tarım ve Yaban Hayatı Bilimleri Dergisi, Cilt: 9 Sayı: 1, 36–49. https://ajindex.com/articles/935238

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (10)

  1. Akbulut, İ. (2014). Domates Fusarium solgunluk ve kök-kök boğazı çürüklüğü hastalıklarına karşı biyolojik mücadele yöntemlerinin araştırılması [Yüksek Lisans Tezi]. Süleyman Demirel Üniversitesi,
  2. Isparta. Altinok, H. H. (2005). First Report of Fusarium wilt of eggplant caused by Fusarium oxysporum f. sp. melongenae in Turkey. Plant Pathology, 54(4), 577. https://doi: 10.1111/j.1365-3059.2005.01235.x Altınok, H. H., & Can, C. (2010). Characterization of Fusarium oxysporum f. sp. melongenae isolates from eggplant in Turkey by pathogenicity, VCG and RAPD analysis. Phytoparasitica, 38, 149-157. https://doi: 10.1007/s12600-010-0081-0
  3. Altınok, H. H., Boyacı, F., & Topçu, V. (2012).
  4. Antalya, Mersin ve Samsun illeri örtü altı patlıcan üretim alanlarında Fusarium ve Verticillium solgunluklarının yaygınlığı ve izolatların virülensliklerinin coğrafi dağılımı. Atatürk Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, 43, 107-115.
  5. Altinok, H. H., Can, C., & Çolak, H. (2013). Vegetative compatibility, pathogenicity and virulence diversity of Fusarium oxysporum f. sp. melongenae recovered from eggplant. Journal of Phytopathology, 161, 651-660. https://doi.org/10.1111/jph.12123
  6. Altınok, H. H., Can, C., Tanyolaç, M. B., & Özkılınç, H. (2018). Domates, biber ve patlıcanda Patojen Fusarium oxysporum izolatlarının yeni nesil sekanslama yöntemi ile DNA sekans bazında karşılaştırmalı tüm genom analizini kullanarak genetik çeşitliliğinin belirlenmesi, filogenetik ilişkilerin değerlendirilmesi ve izolatların patojen efektör protein genlerinin karşılaştırılması. TÜBİTAK 114O866 Sonuç Raporu. Anonim, 2019. Türkiye İstatistik Kurumu. Turkey Statistical Institute http://www.tuik.gov.tr (TUIK) https://biruni.tuik.gov.tr/medas/?locale=tr [Erişim tarihi: 10 August 2018].
  7. Attitalla, I. H., Fatehi, J., Levenfors, J., & Brishammar, S. (2004). A rapid molecular method for differentiating two special forms (lycopersici and radicis-lycopersici) of Fusarium oxysporum”, Mycological Research, 108, 787-794. https://doi.org/10.1017/S0953756204000322
  8. Baysal, Ö., Siragusa, M., İkten H., Polat I., Gümrükçü E., Yiğit F., Carimi F., & Teixeira da Silva JA. (2009). Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici races and their genetic discrimination by molecular markers in West Mediterranean region of Turkey. Physiological and Molecular Plant Pathology, 74, 68-75. https://doi.org/10.1016/j.pmpp.2009.09.008
  9. Beckman, C. H. (1987). The nature of wilt diseases of plants. APS Press,
  10. St Paul, MN, 175p. Boix-Ruíz, A., Gálvez-Pató