Journals / Biyolojik Çeşitlilik ve Koruma / 2017 / Cilt: 10 - Sayı: 2

Distribution patterns and ISSR PCR optimisation of invasive plant Eichhornia crassipes in Asi River/Turkey

İstilacı Eichhornia crassipes bitkisinin Türkiye’de Asi Nehrinde dağılımı ve ISSR PCR optimizasyonu

Pages
75–80
Publication Date
2017-08-15
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

Study results suggested that distribution of E. crassipes in Turkey is not negligible and populations must be monitored periodically.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Eichhornia crassipes Mart.
📊
Key Findings & Data:Population size of E. crassipes varied between 4900-13600.
💡
Conclusion & Impact:Study results suggested that distribution of E. crassipes in Turkey is not negligible and populations must be monitored periodically.
🔬Design:Research Article
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:Eichhornia crassipes · istilacı tür · Asi Nehri

Abstract

Eichhornia crassipes Mart. Solms Pontederiaceae is a perennial aquatic invasive weed throughout the tropical and subtropical regions of the world. Recently, this species was detected in Asi River, Hatay. Therefore, knowledge on its population structure, size and density is very important to understand the current status of this species in Turkey. In this study, we have determined the distribution pattern of E. crassipes. After monitoring Asi River, spanning Syrian Border to Mediterranian Sea, we have detected three main population located at Reyhanlı, Antakya and Samandağ. Population size of E. crassipes varied between 4900-13600. ISSR-PCR protocol was also optimized for E. crassipes based on concentrations of MgCl2, primer, dNTP and template DNA. Among 45 ISSR primers tested, 20 of them have produced satisfactory results. Study results suggested that distribution of E. crassipes in Turkey is not negligible and populations must be monitored periodically. In addition, the optimized ISSR-PCR procedure can be used to study the genetic structure of E. crassipes populations naturally grown in Turkey

Özet

Eichhornia crassipes Mart. Solms Pontederiaceae dünyada tropik ve sub-tropik bölgelerde yayılış gösteren çok yıllık istilacı bir sulak alan bitkisidir. Bu bitki türü yakın zamanlarda Hatay yöresinde Asi Nehrinde tespit edilmiştir. Bu nedenle bu türün popülasyon yapısı, büyüklüğü, yoğunluğunun belirlenmesi Türkiye’deki güncel durumunun anlaşılması açısından oldukça önemlidir. Bu çalışmada E. crassipes’in Asi Nehri üzerindeki dağılım alanları tespit edilmiştir. Nehrin Suriye sınırı ve Akdeniz arasında kalan kısmı tarandığında Reyhanlı, Antakya ve Samandağ’da üç ana popülasyon tespit edilmiştir. Popülasyon büyüklükleri 4900-13600 arasında değişmektedir. Bunun yanında, E. crassipes için farklı MgCl2, primer, dNTP ve kalıp DNA konsantrasyonları temel alınarak ISSR-PCR protokolü optimize edilmiştir. Denenen 45 ISSR primerden 20’si kabul edilebilir sonuçlar vermiştir. Çalışma sonuçlarımız, E. crassippes’in Türkiye’deki dağılımının göz ardı edilemez seviyede olduğunu ve populasyonların düzenli olarak monitörlenmesi gerektiğini göstermektedir. Ek olarak, optimize edilen ISSR-PCR prosedürü Türkiye’de doğal yayılış gösteren E. crassipes populasyonlarının genetik yapılarının çalışılmasında kullanılabilecektir

🔖

Cite This Article

HİLOOĞLU, M., SÖZEN, E. (2017). Distribution patterns and ISSR PCR optimisation of invasive plant Eichhornia crassipes in Asi River/Turkey. Biyolojik Çeşitlilik ve Koruma, Cilt: 10 - Sayı: 2, 75–80. https://ajindex.com/articles/744473

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (11)

  1. Adegunloye, D.V, Olosunde, S.Y., Omokanju, A.B. (2013). Evaluation of Ratio Variation of Water Hyacinth (Eichhornia crassipes) on the Production of Pig Dung Biogas. International Research Journal of Biological Sciences, 2(3), 44-48.
  2. Ahmad, R., Liow, P.S., Spencer, D.F., Jasieniuk, M. (2008). Molecular evidence for a single genetic clone of invasive Arundo donax in the United States. Aquatic Botany. 88: 113-120. Anonymous, (2010).
  3. T.C. Zirai Karantina Yönetmeliği, Agricultural Quarantine Regulation, Ankara. pp. 54. Barrett, S.C.H. (1989). Waterweed invasions. Scientific American, 260, 90-97.
  4. Brundu, G., Azzella, M.M., Blasi, C., Camarda, I., Iberite, M., Celesti-Grapow, L. (2013). The silent invasion of Eichhornia crassipes (Mart.) Solms in Italy. Plant Biosystems-An International Journal Dealing with All Aspects of Plant Biology, 147(4), 1120-1127.
  5. Center, T.D. and Spencer, N.R. (1981). The phenology and growth of water hyacinth (Eichhornia crassipes (Mart.) Solms) in a eutrophic north-central Florida lake. Aquatic Botany, 10, 1-32.
  6. Center, T.D., Hill, M.P., Cordo, H., Julien, M.H. (2002). Water hyacinth. In: Biological Control of Invasive Plants in the Eastern United States, ed. R.G. van Driesche, S. Lyon, B. Blossey, M.S. Hoddle and R. Reardon. Morgantown, Washington DC: USDA Forest Service, pp 41-64.
  7. Doyle, J.J., Doyle J.L. (1987). A rapid DNA isolation for small quantities of fresh tissue. Phytochemical Bulletin, 19, 11-15.
  8. Güngör, H., Solak, M.H., Allı H., Işıloğlu M., Kalmış, E. (2016). Contributions to the macrofungal diversity of Hatay province, Turkey. Biological Diversity and Conservation, 9(1), 101-106.
  9. Haddadchi, A., Gross, C.L., Fatemi, M. (2013). The expansion of sterile Arundo donax (Poaceae) in southeastern Australia is accompanied by genotypic variation. Aquatic Botany, 104, 153-161.
  10. Harley, K.L.S. (1990). The role of biological control in the management of water hyacinth, Eichhornia crassipes. Biocontrol News and Information, 11, 11-22.
  11. Julien, M.H., Griffiths, M.W., Wright, A.D. (1999). Biological Control of Water Hyacinth. The Weevils Neochetina bruchi and N. eichhorniae: Biologies, Host Ranges, and Rearing, Releasing and Monitoring Techniques for Biological Control of Eichhornia crassipes. Monograph 60. Canberra, Australia: Australian Centre for International Agricultural Research (ACIAR), 87 pp. Lambertini, C., Riis, T., Olesen, B., Clayton, J.S., Sorrell, B. K., Brix, H. (2010). Genetic diversity in three invasive clonal aquatic spec