Journals / Türkiye Entomoloji Dergisi / 2012 / Cilt: 36 - Sayı: 4

Güney Anadolu Bölgesi Tahıl kist nematodu popülasyonlarının ribozomal DNA nın ITS bölgesi sekanslanarak moleküler karakterizasyonu

Molecular characterization of cereal cyst nematodes from the South Anatolian Region in Turkey using ITS-rDNA sequences

Pages
491–499
Publication Date
2022-11-05
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

Based on phylogenetic analysis using ITS-rDNA sequences, H. avenae, H. filipjevi, H. latipons and Heterodera ciceri Vovlas, Greco & Di Vito, 1985 were identified. 76,5 % of the isolates were characterized as H. latipons, 13 % H. filipjevi, 8,5 % H. avenae and 2 % H. ciceri.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:The Heterodera avenae group includes 12 species feeding on roots of cereals.
📊
Key Findings & Data:Three species, Heterodera avenae Wollenweber, 1924, Heterodera filipjevi (Madzhidov, 1981) Stelter, 1984 and Heterodera latipons Franklin, 1969 are among the most economically important cyst nematode pests of cereals cultivated in different parts of Turkey.
💡
Conclusion & Impact:Based on phylogenetic analysis using ITS-rDNA sequences, H. avenae, H. filipjevi, H. latipons and Heterodera ciceri Vovlas, Greco & Di Vito, 1985 were identified. 76,5 % of the isolates were characterized as H. latipons, 13 % H. filipjevi, 8,5 % H. avenae and 2 % H. ciceri.
🔬Design:Research Article
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:Domain Parameters

Abstract

The Heterodera avenae group includes 12 species feeding on roots of cereals. Three species, Heterodera avenae Wollenweber, 1924, Heterodera filipjevi (Madzhidov, 1981) Stelter, 1984 and Heterodera latipons Franklin, 1969 are among the most economically important cyst nematode pests of cereals cultivated in different parts of Turkey. In this study, forty seven cereal cyst nematode isolates collected from cereal growing areas of the South Anatolian Region of Turkey (Hatay, Kahramanmaraş, Gaziantep, Kilis, Mardin and Adıyaman), were identified by using sequence analysis of the Internal Transcribed Spacer region of the ribosomal DNA (ITS-rDNA). Based on phylogenetic analysis using ITS-rDNA sequences, H. avenae, H. filipjevi, H. latipons and Heterodera ciceri Vovlas, Greco & Di Vito, 1985 were identified. 76,5 % of the isolates were characterized as H. latipons, 13 % H. filipjevi, 8,5 % H. avenae and 2 % H. ciceri.

Özet

Tahıl kist nematodlarının (Heterodera avenae group) buğday köklerinde beslenen 12 farklı türü bilinmektedir. Türkiyede buğday yetiştiriciliğinin yapıldığı farklı alanlarda ekonomik olarak önemli üç tür, Heterodera avenae Wollenweber, 1924, Heterodera filipjevi (Madzhidov, 1981) Stelter, 1984 ve Heterodera latipons Franklin, 1969 bulunmaktadır. Bu çalışmada Güneydoğu Anadolu Bölgesi (Hatay, Kahramanmaraş, Gaziantep, Kilis ve Mardin) buğday alanlarından toplanan 47 adet Tahıl kist nematodu popülasyonuna ait ribozomal DNAnın transkripte olmayan (ITS-rDNA) bölgesi sekanslanarak moleküler teşhisi yapılmıştır. Filogenetik analiz sonuçlarına göre, H. avenae, H. filipjevi, H. latipons ve H. ciceri Vovlas, Greco & Di Vito, 1985 tanımlanmıştır. Çalışmada kullanılan nematod popülasyonunun % 76,5i H. latipons, %13ü H. filipjevi, % 8,5i H. avenae ve % 2si Heterodera ciceri olarak saptanmıştır.

🔖

Cite This Article

TOKTAY, H., İMREN, M., ELEKÇİOĞLU, İ. H., WAEYENBERGE, L., DABABAT, A., VIAENE, N. (2022). Güney Anadolu Bölgesi Tahıl kist nematodu popülasyonlarının ribozomal DNA nın ITS bölgesi sekanslanarak moleküler karakterizasyonu. Türkiye Entomoloji Dergisi, Cilt: 36 - Sayı: 4, 491–499. https://ajindex.com/articles/628219

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (7)

  1. Abidou, H., A. El-Ahmed, J. M. Nicol, N. Bolat, R. Rivoal & A. Yahyaoui, 2005. Occurrence and distribution of species of the Heterodera avenae group in Syria and Turkey. Nematology Mediterranean, 33: 197-203.
  2. Bekal, S., J. P. Gauthier & R. Rivoal, 1997. Genetic diversity among a complex of cereal cyst nematodes inferred from RFLP analysis of the ribosomal internal transcribed spacer region. Genome, 40: 479–486. Ferris, V. R., J. M. Ferris, J. FaghihI & M. Ireholm, 1994. Comparisons of isolates of Heterodera avenae using 2-D PAGE protein patterns and ribosomal DNA. Journal of Nematology, 26: 144-151.
  3. İmren, M., A. Özarslandan, H. Toktay, A. Öcal, İ. H. Elekçioğlu, A. Dababat & J. Nicol, 2010. Preliminary survey study on Heterodera species in some provinces of Southeast Anatolia region of Turkey (19-23
  4. September, Vienna, 2010). Proc. of 30th European Society of Nematologist, 68 pp. İmren, M., H. Toktay, A. Özarslandan, A. Öcal & İ. H. Elekçioğlu, 2011. Doğu Akdeniz Bölgesi buğday alanlarında Tahıl kist nematodu (Heterodera avenae group) türlerinin belirlenmesi. Türkiye IV. Bitki Koruma Kongresi 28- 30 Haziran 2011- Kahramanmaraş. s 10. Kort, J., 1960. A technique for the extraction of Heterodera cysts from wet soil and for the estimation of their egg and larval content. Verslagen en Medelingen Plantenziektenkundige Dienst. Wageningen. Netherlands, 233: 3-7.
  5. Madani, M., N. Vovlas, P. Castillo, S. A. Subbotin & M. Moens, 2004. Molecular characterization of cyst nematode species (Heterodera spp.) from the Mediterranean basin using RFLPs and sequences of ITS-rDNA. Journal of Phytopathology, 152: 229-234. Nicol J. M., 2002. Important nematode pests. Pp. 345–366 in B. C. Curtis, S. Rajaram, and H. Gomez Macpherson, eds. Bread wheat: Improvement and production. Rome: FAO Publisher.
  6. Nicol, J., R. Rivoal, S. Taylor & M. Zaharieva, 2004. Global Importance of Cyst (Heterodera spp.) and Lesion Nematodes (Pratylenchus spp.) on Cereals: yield loss, population dynamics, use of host resistance and integration of molecular tools. Nematology Monographs and Perspectives 2: 233-251.
  7. Nicol J. M., N. Bolat, A. Bağcı, R. T. Trethowan, M. William, H. Hekimhan, A. F. Yıldırım, E. Şahin, İ. H. Elekcioğlu, H. Toktay, B. Tunalı, A. Hede, S. Taner, H. J. Braun, M. Van Ginkel, M. Keser, Z. Arısoy, A. Yorgancılar, A. Tülek, D. Erdurmuş, O. Büyük & M. Aydoğdu, 2005. The international breeding strategy for the incorporation of resistance in bread wheat against the soil borne pathogens (Dryl